Streptomycetaceae
|
|
| Streptomycetaceae | |
|---|---|
| Kultura szkiełkowa gatunku Streptomyces | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | promieniowiec |
| Klasa: | promieniowce |
| Zamówienie: |
Streptomycetales Cavalier-Smith 2002 |
| Rodzina: |
Streptomycetaceae Waksman i Henrici 1943 (listy zatwierdzone 1980) |
| Rodzaje | |
|
|
| Synonimy | |
|
|
Streptomycetaceae to rodzina Actinomycetota , tworząca monotypowy rząd Streptomycetales . _ Obejmuje ważny rodzaj Streptomyces . Było to pierwotne źródło wielu antybiotyków , a mianowicie streptomycyny , pierwszego antybiotyku przeciwko gruźlicy .
Genomika
Dopasowania sekwencji genomów promieniowców doprowadziły do identyfikacji trzech konserwatywnych indeli sygnaturowych , które są unikalne dla rzędu Streptomycetales. Enzym PBGD zawiera czteroaminokwasową insercję, która jest obecna we wszystkich gatunkach Streptomyces i Kitasatospora setae , ale nie w żadnym innym Actinomycetota. Podobnie, jednoaminokwasowa insercja występuje w konserwatywnym regionie kinazy adenylanowej i występuje u wszystkich gatunków Streptomyces i K. setae , ale nie występuje w żadnym innym Actinomycetota. Zidentyfikowano również pięć konserwatywnych białek sygnaturowych, które są obecne w różnych zsekwencjonowanych Streptomyces , ale nie w K. setae ; jednakże, ponieważ pełny genom K. setae nie został jeszcze zsekwencjonowany, białka te mogą być obecne w K. setae . Ponadto zidentyfikowano 11 konserwatywnych białek sygnaturowych, które znajdują się we wszystkich zsekwencjonowanych Streptomyces i K. setae . Uważa się, że te białka są unikalne dla rzędu Streptomycetales, a zatem zapewniają markery molekularne , które można wykorzystać do odróżnienia tej grupy od reszty Actinomycetota. Drzewa filogenetyczne wskazują, że rząd Catenulisporales jest blisko spokrewniony z rzędem Streptomycetales. Wniosek ten jest wspierany przez konserwowany jeden aminokwas indel sygnaturowy, który jest unikalnie znaleziony we wszystkich gatunkach Streptomycetales i Catenulisporales acidiphilia , jedynym gatunku Catenulisporales, którego pełny genom został zsekwencjonowany. Ponadto zidentyfikowano trzy konserwatywne białka sygnaturowe, które znajdują się we wszystkich gatunkach Streptomycetales i C. acidiphilia . Zarówno konserwatywny indel sygnaturowy, jak i konserwatywne białka sygnaturowe dostarczają dowodów na to, że rzędy Streptomycetales i Catenulisporales są blisko spokrewnione.
Filogeneza
Przyjęta taksonomia oparta jest na Liście nazw prokariotycznych w nomenklaturze (LPSN). Filogeneza opiera się na analizie całego genomu.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notatki
Linki zewnętrzne
Dane dotyczące Streptomycetaceae w Wikispecies