Sulfolobus turreted icosahedral virus 1

Emd-5584.jpg
Sulfolobus Turreted icosahedral virus 1
4,5 Å struktura Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus 1 określona przez cryoEM. Wpis EMDB , wpis PDB .
Klasyfikacja wirusów
(nierankingowe): Wirus
królestwo : Varidnaviria
Królestwo: Bamfordvirae
Gromada: Preplasmiviricota
Klasa: Tectiliviricetes
Zamówienie: Belfryvirales
Rodzina: Turriviridae
Rodzaj: alfaturriwirus
Gatunek:
Sulfolobus turreted icosahedral virus 1

Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 (dawniej Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 ) to gatunek wirusa, który infekuje archeon Sulfolobus solfataricus .

Historia

Wirus ten został wyizolowany z gorącego źródła w obszarze termalnym Rabbit Creek, który znajduje się w Midway Geyser Basin w Parku Narodowym Yellowstone .

Wirusologia

Jest to dwudziestościan symetryczny wirus o unikalnej liczbie triangulacji (T) równej 31. W 12 pięciokrotnie symetrycznych pozycjach dwudziestościanu wystają „wieżyczki”, które wystają 13 nanometrów (nm) ponad powierzchnię kapsydu . Wieżyczki mają średnią średnicę 24 nm. Środek każdej wieży zawiera kanał ~ 3 nm. Funkcja tego kanału nie jest znana, ale może zapewniać dostęp między wnętrzem a zewnętrzem wirionu. Wydaje się, że na każdym końcu kanału występuje gęstość, co wskazuje, że kanał może być zablokowany i sugeruje możliwą rolę regulacyjną związaną z tą gęstością. [ potrzebne źródło ]

Istnieje pięć białek strukturalnych: główne białko o masie 37 kilodaltonów (kDa) i kilka mniejszych białek o szacowanej masie 75, 25, 12,5 i 10 kDa. Główne białko kapsydu jest głównie β-kartkowe . [ potrzebne źródło ]

Genom to okrągły dwuniciowy DNA o długości 17,663 kilozasad z 36 otwartymi ramkami odczytu. Genom zawiera 36% G+C . [ potrzebne źródło ]

W przeciwieństwie do innych wirusów, które albo lizują, albo pączkują ze swoich żywicieli, ten wirus indukuje unikalną piramidalną strukturę na powierzchni żywiciela, z którego się pączkuje. [ potrzebne źródło ]