Sulfolobus turreted icosahedral virus 1
Sulfolobus Turreted icosahedral virus 1 | |
---|---|
4,5 Å struktura Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus 1 określona przez cryoEM. Wpis EMDB , wpis PDB . | |
Klasyfikacja wirusów | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Varidnaviria |
Królestwo: | Bamfordvirae |
Gromada: | Preplasmiviricota |
Klasa: | Tectiliviricetes |
Zamówienie: | Belfryvirales |
Rodzina: | Turriviridae |
Rodzaj: | alfaturriwirus |
Gatunek: |
Sulfolobus turreted icosahedral virus 1
|
Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 (dawniej Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 ) to gatunek wirusa, który infekuje archeon Sulfolobus solfataricus .
Historia
Wirus ten został wyizolowany z gorącego źródła w obszarze termalnym Rabbit Creek, który znajduje się w Midway Geyser Basin w Parku Narodowym Yellowstone .
Wirusologia
Jest to dwudziestościan symetryczny wirus o unikalnej liczbie triangulacji (T) równej 31. W 12 pięciokrotnie symetrycznych pozycjach dwudziestościanu wystają „wieżyczki”, które wystają 13 nanometrów (nm) ponad powierzchnię kapsydu . Wieżyczki mają średnią średnicę 24 nm. Środek każdej wieży zawiera kanał ~ 3 nm. Funkcja tego kanału nie jest znana, ale może zapewniać dostęp między wnętrzem a zewnętrzem wirionu. Wydaje się, że na każdym końcu kanału występuje gęstość, co wskazuje, że kanał może być zablokowany i sugeruje możliwą rolę regulacyjną związaną z tą gęstością. [ potrzebne źródło ]
Istnieje pięć białek strukturalnych: główne białko o masie 37 kilodaltonów (kDa) i kilka mniejszych białek o szacowanej masie 75, 25, 12,5 i 10 kDa. Główne białko kapsydu jest głównie β-kartkowe . [ potrzebne źródło ]
Genom to okrągły dwuniciowy DNA o długości 17,663 kilozasad z 36 otwartymi ramkami odczytu. Genom zawiera 36% G+C . [ potrzebne źródło ]
W przeciwieństwie do innych wirusów, które albo lizują, albo pączkują ze swoich żywicieli, ten wirus indukuje unikalną piramidalną strukturę na powierzchni żywiciela, z którego się pączkuje. [ potrzebne źródło ]