TARBP2

TARBP2
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, LOQS, TRBP, TRBP1, TRBP2, RISC ładujący kompleks podjednostka wiążąca RNA, podjednostka TARBP2 kompleksu ładującego RISC
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcje molekularne
Składnik komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Podjednostka kompleksu ładującego RISC TARBP2 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen TARBP2 .

Funkcjonować

HIV-1 , czynnik sprawczy zespołu nabytego niedoboru odporności (AIDS), zawiera genom RNA, który wytwarza zintegrowane z chromosomem DNA podczas cyklu replikacyjnego. Aktywacja ekspresji genu HIV-1 przez transaktywator Tat zależy od elementu regulacyjnego RNA (TAR) zlokalizowanego poniżej miejsca inicjacji transkrypcji. Białko kodowane przez ten gen wiąże się między wybrzuszeniem a pętlą elementu regulatorowego RNA HIV-1 TAR i aktywuje ekspresję genu HIV-1 w synergii z wirusowym białkiem Tat. Splicing alternatywny skutkuje wieloma wariantami transkryptu kodującymi różne izoformy. Ten gen ma również pseudogen .

Interakcje

Wykazano, że TARBP2 oddziałuje z kinazą białkową R i RBM14 .

Dalsza lektura

Cosentino GP, Venkatesan S, Serluca FC, Green SR, Mathews MB, Sonenberg N (październik 1995). „Kinaza białkowa zależna od dwuniciowego RNA i białko wiążące RNA TAR tworzą homo- i heterodimery in vivo” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 92 (21): 9445–9. Bibcode : 1995PNAS...92.9445C . doi : 10.1073/pnas.92.21.9445 . PMC40818 . _ PMID 7568151 .
Kozak CA, Gatignol A, Graham K, Jeang KT, McBride OW (styczeń 1995). „Mapowanie genetyczne u ludzi i myszy locus kodującego TRBP, białko, które wiąże region TAR ludzkiego wirusa niedoboru odporności (HIV-1)” . Genomika . 25 (1): 66–72. doi : 10.1016/0888-7543(95)80110-8 . PMID 7774957 .
Gatignol A, Buckler C, Jeang KT (kwiecień 1993). „Pokrewieństwo motywu wiążącego RNA w białku wiążącym RNA TRBP ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 TAR z ludzką kinazą P1 / dsI i Drosophila staufen” . Biologia molekularna i komórkowa . 13 (4): 2193–202. doi : 10.1128/mcb.13.4.2193 . PMC 359540 . PMID 8455607 .
Gatignol A, Duarte M, Daviet L, Chang YN, Jeang KT (1996). „Kolejne etapy transaktywacji Tat HIV-1 za pośrednictwem komórkowego DNA, RNA i czynników wiążących białka” . Ekspresja genów . 5 (4–5): 217–28. PMC 6138028 . PMID 8723388 .
Kasof GM, Goyal L, White E (czerwiec 1999). „Btf, nowy promujący śmierć represor transkrypcji, który oddziałuje z białkami pokrewnymi Bcl-2” . Biologia molekularna i komórkowa . 19 (6): 4390–404. doi : 10.1128/mcb.19.6.4390 . PMC 104398 . PMID 10330179 .
Daviet L, Erard M, Dorin D, Duarte M, Vaquero C, Gatignol A (kwiecień 2000). „Analiza różnicy wiązania między dwiema domenami wiążącymi dsRNA w TRBP ujawnia modułową funkcję motywu helisy KR”. Europejski Dziennik Biochemii . 267 (8): 2419–31. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01256.x . PMID 10759868 .
Duarte M, Graham K, Daher A, Battisti PL, Bannwarth S, Segeral E, Jeang KT, Gatignol A (2001). „Charakterystyka TRBP1 i TRBP2. Stabilna struktura pnia-pętli na końcu 5 'mRNA TRBP2 przypomina HIV-1 TAR i nie występuje w przetworzonym pseudogenie”. Journal of Biomedical Science . 7 (6): 494–506. doi : 10.1007/bf02253365 . PMID 11060498 .
Siffroi JP, Pawlak A, Alfonsi MF, Troalen F, Guellaen G, Dadoune JP (marzec 2001). „Ekspresja białka wiążącego RNA TAR w ludzkich jądrach” . Molekularna reprodukcja człowieka . 7 (3): 219–25. doi : 10.1093/molehr/7.3.219 . PMID 11228241 .
Daher A, Longuet M, Dorin D, Bois F, Segeral E, Bannwarth S, Battisti PL, Purcell DF, Benarous R, Vaquero C, Meurs EF, Gatignol A (wrzesień 2001). „Dwie domeny dimeryzacji w białku wiążącym RNA w odpowiedzi na trans-aktywację (TRBP) indywidualnie odwracają hamowanie kinazy białkowej R ekspresji długich powtórzeń końcowych HIV-1” . Journal of Biological Chemistry . 276 (36): 33899–905. doi : 10.1074/jbc.M103584200 . PMID 11438532 .
Iwasaki T, Chin WW, Ko L (wrzesień 2001). „Identyfikacja i charakterystyka aktywatora koaktywatora zawierającego RRM (CoAA) jako białka oddziałującego z TRBP oraz jego wariantu splicingowego jako modulatora koaktywatora (CoAM)” . Journal of Biological Chemistry . 276 (36): 33375–83. doi : 10.1074/jbc.M101517200 . PMID 11443112 .
Bannwarth S, Talakoub L, Letourneur F, Duarte M, Purcell DF, Hiscott J, Gatignol A (grudzień 2001). „Organizacja ludzkiego genu tarbp2 ujawnia dwa promotory, które są represjonowane w astrocytowej linii komórkowej” . Journal of Biological Chemistry . 276 (52): 48803–13. doi : 10.1074/jbc.M104645200 . PMID 11641396 .
Xu YC, Wu RF, Gu Y, Yang YS, Yang MC, Nwariaku FE, Terada LS (sierpień 2002). „Zaangażowanie TRAF4 w aktywację oksydacyjną kinazy N-końcowej c-Jun” . Journal of Biological Chemistry . 277 (31): 28051-7. doi : 10.1074/jbc.M202665200 . PMID 12023963 .
Battisti PL, Daher A, Bannwarth S, Voortman J, Peden KW, Hiscott J, Mouland AJ, Benarous R, Gatignol A (wrzesień 2003). „Aktywność addytywna między białkiem wiążącym RNA w odpowiedzi na trans-aktywację, TRBP2 i cykliną T1 na ekspresję HIV typu 1 i produkcję wirusów w mysich komórkach”. Badania nad AIDS i ludzkie retrowirusy . 19 (9): 767–78. doi : 10.1089/088922203769232566 . PMID 14585207 .
Lee JY, Kim H, Ryu CH, Kim JY, Choi BH, Lim Y, Huh PW, Kim YH, Lee KH, Jun TY, Rha HK, Kang JK, Choi CR (lipiec 2004). „Merlin, supresor guza, oddziałuje z reagującym na transaktywację białkiem wiążącym RNA i hamuje jego aktywność onkogenną” . Journal of Biological Chemistry . 279 (29): 30265–73. doi : 10.1074/jbc.M312083200 . PMID 15123692 .
Haase AD, Jaśkiewicz L, Zhang H, Lainé S, Sack R, Gatignol A, Filipowicz W (październik 2005). „TRBP, regulator komórkowej ekspresji wirusa PKR i HIV-1, współdziała z Dicer i działa w wyciszaniu RNA” . Raporty EMBO . 6 (10): 961–7. doi : 10.1038/sj.embor.7400509 . PMC 1369185 . PMID 16142218 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (październik 2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173-8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Bannwarth S, Lainé S, Daher A, Grandvaux N, Clerzius G, Leblanc AC, Hiscott J, Gatignol A (luty 2006). „Swoista dla komórki regulacja promotora TRBP1 przez czynnik transkrypcyjny NF-Y w limfocytach i astrocytach”. Dziennik biologii molekularnej . 355 (5): 898–910. doi : 10.1016/j.jmb.2005.11.026 . PMID 16343534 .
Christensen HS, Daher A, Soye KJ, Frankel LB, Alexander MR, Lainé S, Bannwarth S, Ong CL, Chung SW, Campbell SM, Purcell DF, Gatignol A (maj 2007). „Małe interferujące RNA przeciwko białku wiążącemu RNA TAR, TRBP, kofaktorowi Dicer, hamują ekspresję i produkcję wirusów ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 o długich terminalach” . Dziennik wirusologii . 81 (10): 5121–31. doi : 10.1128/JVI.01511-06 . PMC 1900231 . PMID 17360756 .