Termometr IbpB

Termometr IbpB
Zachowana struktura drugorzędowa termometru IbpB
Identyfikatory
Symbol	ibpB 5' UTR
Inne dane
typ RNA	termometr RNA
Domeny	E coli
Struktury PDB	PDBe

Termometr IbpB jest elementem termometru RNA znajdującym się w operonie ibpAB . Operon zawiera dwa geny szoku cieplnego, kodujące ciałka inkluzyjne A i B (IbpA/B) i jest operonem najbardziej drastycznie regulowanym w górę pod wpływem szoku cieplnego u Escherichia coli .

IbpA jest regulowany przez element ROSE znajdujący się w jego 5' UTR , podczas gdy IbpB ma swój własny wrażliwy na ciepło element cis-regulatorowy . Aktywność tego termoregulatora została potwierdzona in vitro , ale nie stwierdzono jej in vivo , co sugeruje, że w komórkach bakteryjnych istnieje bardziej skomplikowana regulacja operonu.

białko IbpB

Białko IbpB, którego ekspresję reguluje termometr IbpB, jest w 48% identyczne z IbpA (na poziomie sekwencji aminokwasowej ), ale spełnia inną rolę w szoku cieplnym. Gdy IbpB jest nieobecny, białko IbpA będzie tworzyć długie fibryle , co jest niezwykłe dla białka szoku cieplnego ; IbpB, działając jako współopiekuńczy , powstrzymuje IbpA przed tworzeniem tej struktury.

W wyniku szoku cieplnego białko IbpB dysocjuje, dając dwie mniejsze podjednostki, a także przestawia swoją trzeciorzędową strukturę . Uważa się, że ta „niezwykła transformacja konformacyjna” jest niezbędna, aby IbpB działał jako współwłaściciel z IbpA w szoku cieplnym.

Stwierdzono, że IbpB zachowuje aktywność przez znaczny czas po usunięciu bodźca szoku cieplnego.