Thermococcus kodakarensis
| Thermococcus ksis | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| Królestwo: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
T. kodakarensis
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Thermococcus kodakarensis Atomi i in., 2004
|
|
Thermococcus kodakarensis to gatunek ciepłolubnych archeonów . Szczep typu T. kodakarensis KOD1 jest jednym z najlepiej zbadanych członków rodzaju .
Historia
T. kodakarensis został wyizolowany z solfatary w pobliżu brzegu wyspy Kodakara , Kagoshima , Japonia. Izolat pierwotnie nosił nazwę Pyrococcus kodakarensis KOD1, ale został przeklasyfikowany jako gatunek Thermococcus w oparciu o sekwencję 16S rRNA . Wczesne badania z T. kodakarensis były ukierunkowane głównie na jego termostabilne enzymy, ale względna łatwość manipulacji i manipulacji genetycznych ułatwiona przez naturalne kompetencje uczyniło go atrakcyjnym systemem do badania kilku procesów biologicznych.
Nieruchomości
T. kodakarensis to nieregularne ziarniaki o średnicy 1–2 μm, często występujące parami i wysoce ruchliwe za pośrednictwem lophotrichous archaella . Ściana komórkowa składa się z warstwy lipidów dieterowych i tetraeterowych oraz zewnętrznej glikoproteinowej . T. kodakarensis jest bezwzględnym beztlenowcem i heterotrofem , szybko rosnącym na różnych podłożach organicznych w obecności siarki elementarnej , wytwarzającej siarkowodór gaz. Czas generowania szacuje się na 40 minut w optymalnych warunkach. Zapotrzebowanie na siarkę elementarną jest zmniejszone, gdy do wzrostu stosuje się pirogronian lub skrobię . W przypadku braku siarki zamiast siarkowodoru wytwarzany jest wodór . Wzrost jest możliwy w temperaturze 60-100°C, z optimum w 85°C. Podobnie jak inne organizmy morskie, do optymalnego wzrostu wymagane są wysokie stężenia soli, aw rozcieńczonych roztworach może wystąpić liza komórek.
Genom
W 2005 roku genom T. kodakarensis KOD1 został w pełni zsekwencjonowany. Genom składa się z pojedynczego okrągłego chromosomu o długości 2 088 737 par zasad, kodującego przewidywane 2306 białek.
Dalsza lektura
- Elshawadfy AM, Keith BJ, Ee Ooi H, Kinsman T, Heslop P, Connolly BA (27 maja 2014). „Hybrydy polimerazy DNA pochodzące z enzymów rodziny B Pyrococcus furiosus i Thermococcus kodakarensis: poprawa wydajności reakcji łańcuchowej polimerazy” . Granice w mikrobiologii . 5 (224): 224. doi : 10.3389/fmicb.2014.00224 . PMC 4034419 . PMID 24904539 .
- Hwa KY, Subramani B, Shen ST, Lee YM (wrzesień 2014). „Międzycząsteczkowe wiązanie dwusiarczkowe jest wymagane do termostabilności i termoaktywności β-glikozydazy z Thermococcus kodakarensis KOD1”. Mikrobiologia stosowana i biotechnologia . 98 (18): 7825–36. doi : 10.1007/s00253-014-5731-6 . PMID 24728717 . S2CID 9812474 .
- Kishimoto A, Kita A, Ishibashi T, Tomita H, Yokooji Y, Imanaka T i in. (wrzesień 2014). „Struktura krystaliczna syntetazy fosfopantotenianu z Thermococcus kodakarensis”. Białka . 82 (9): 1924–36. doi : 10.1002/prot.24546 . PMID 24638914 . S2CID 23549563 .