Wirus Chrysochromulina ericina
|
|
| Chrysochromulina ericina virus 01B | |
|---|---|
| Cienkie skrawki komórki z Haptolina ericina zakażonej | |
| wirusem CeV-01B Klasyfikacja | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Varidnaviria |
| Królestwo: | Bamfordvirae |
| Gromada: | Nucleocytoviricota |
| Klasa: | Megawirycety |
| Zamówienie: | Imiterwirusy |
| Rodzina: | Mimiviridae (?) |
| Wirus: |
Wirus Chrysochromulina ericina 01B
|
Wirus Chrysochromulina ericina 01B lub po prostu wirus Chrysochromulina ericina ( CeV ) to gigantyczny wirus z rodziny Mimiviridae infekujący Haptolina ericina (wcześniej przypisany do rodzaju Chrysochromulina ), morskiego mikroalgi należącego do Haptophyta . CeV jest wirusem dsDNA .
Historia i taksonomia
CeV został odkryty w norweskich wodach przybrzeżnych w 1998 roku. Następnie został wyizolowany i scharakteryzowany. Uważano wówczas, że należy do phycodnaviridae wraz ze wszystkimi innymi znanymi wirusami infekującymi glony. Odkrycie Acanthamoeba polyphaga pomogło odkryć, że istnieją mimiwirusy morskie, które mogą infekować mikroalgi. Szczep CeV został później znaleziony w Zatoce Menem w 2013 roku, a analiza filogenetyczna pewnego specyficznego markera potwierdziła jego bliskość z mimiwirusami . W 2015 roku CeV został w pełni zsekwencjonowany, aby sklasyfikować go jako mimiviridae
Niedawno zaproponowano grupę mimiviridae infekujących mikroglony, która obejmowałaby CeV wraz z wirusem Phaeocystis globosa (PgV) infekującym haptophyceae i wirusem Aureococcus anophagefferens (AaV) infekującym stramenopile .
Struktura
CeV ma średnicę 160 nm. Ma strukturę dwudziestościenną i nie ma błony zewnętrznej.
Genom
Genom CeV ma 473 558 pz i niską zawartość GC wynoszącą 25%. Przewiduje się, że będzie mieć 512 ORF . CeV posiadają dużą liczbę genów rdzeniowych, takich jak główne białko kapsydu i polimeraza DNA B blisko odpowiednich genów PgV. CeV może mieć zdolność naprawy swojego DNA , na co wskazuje obecność sekwencji MutS7 i nukleazy naprawy DNA typu ERCC4 (które biorą udział w naprawie DNA). Ten ostatni enzym jest zwykle używany do naprawy uszkodzeń DNA spowodowanych przez światło UV, co jest zgodne z siedliskiem mimiviridae infekującego żywiciela fotosyntetyzującego . Ma również 305 unikalnych genów, które nie zostały znalezione w publicznych bazach danych
Cykl wirusowy
Niewiele wiadomo o cyklu CeV. Replikuje się w cytoplazmie żywiciela, a jego cykl lityczny trwa od 14 do 19 godzin. CeV posiada w swoim genomie sekwencję kodującą polimerazę DNA i dwie zależne od DNA polimerazy RNA II. Ma również dwanaście tRNA , co wskazuje na ważną maszynerię pozwalającą na względnie niezależną replikację i tworzenie wirionów charakterystycznych dla mimiviridea.