Wirus Orsay
Wirus Orsay | |
---|---|
Klasyfikacja wirusów | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Rybowiria |
Królestwo: | Orthornawirusy |
Gromada: | Kitrinoviricota |
Klasa: | Magsaviricetes |
Zamówienie: | Nodamuvirales |
Rodzina: | Nodaviridae |
Wirus: |
Wirus Orsay
|
Wirus Orsay to jednoniciowy wirus RNA o dodatniej czułości , który infekuje nicienie Caenorhabditis elegans . Przypomina nodawirusy (rodzina Nodaviridae ), ale nie został jeszcze formalnie sklasyfikowany.
Wirus Orsay ma genom (+)ssRNA składający się z dwóch segmentów, określanych jako RNA1 i RNA2. Segment RNA1 koduje polimerazę RNA zależną od RNA (RdRP) złożoną z 982 aminokwasów. Segment RNA2 ma dwie otwarte ramki odczytu (ORF), które kodują białko kapsydu i białko niestrukturalne o nieznanej funkcji. Wirus składa się z dwóch domen strukturalnych, otoczki (S) i wypustki (P).
Wirus Orsay został odkryty w 2011 roku w nicieniach Caenorhabditis elegans w gnijących owocach w Orsay we Francji. Tuż przed odkryciem opracowano znormalizowane metody izolacji nicieni na wolności. Stosując te metody, Caenorhabditis briggsae i C. elegans stwierdzono nicienie, które wykazywały nieprawidłowości w jelitach, takie jak rozległe zwoje wierzchołkowej granicy jelita. Lizat zakażonych nicieni dodano do zdrowych nicieni, co doprowadziło do zakażenia. Ponieważ w przypadku lizatu zastosowano filtr, który umożliwia penetrację tylko cząsteczkom wirusa, sugerowało to, że wirus był przyczyną nieprawidłowości jelitowych. Mikroskopia elektronowa pokazująca cząsteczki wirusowe potwierdziła rolę wirusa.
Po zakażeniu podatnego nicienia cząsteczki wirusa są zlokalizowane głównie w komórkach jelitowych. Mała struktura wirusa Orsay, jego podobieństwo do dobrze zbadanych nodawirusów i jego tropizm do komórek jelitowych C. elegans , wraz z brakiem zakaźności dla ludzi, sprawiają, że wirus Orsay jest użytecznym wirusem do badania interakcji gospodarz-wirus.