arylomycyna

Naturalna arylomycyna AC 16 (na górze) i syntetyczny analog G0775 (na dole)

Arylomycyny to klasa antybiotyków początkowo wyizolowanych z próbki gleby uzyskanej w Cape Coast w Ghanie . W tej początkowej izolacji zidentyfikowano dwie rodziny blisko spokrewnionych arylomycyn, A i B. Rodzina glikozylowanych lipopeptydów arylomycyny C została następnie wyizolowana z hodowli Streptomyces w badaniu przesiewowym pod kątem inhibitorów bakteryjnej peptydazy sygnałowej. Początkowo wyizolowane arylomycyny mają ograniczone spektrum działania przeciwko Gram-dodatnim , w tym Staphylococcus aureus i Streptococcus pneumoniae . Jedyną aktywność przeciwko bakteriom Gram-ujemnym zaobserwowano u szczepów z uszkodzoną błoną zewnętrzną.

Arylomycyna A2 w kompleksie peptydazy sygnałowej E. coli . Diadę katalityczną (Ser90 i Lys145) pokazano w postaci sztyftu w pobliżu C-końca produktu naturalnego.

Po ich wstępnej identyfikacji i charakteryzacji określono struktury kokrystaliczne z peptydazą sygnałową E. coli i wykazano, że rdzeń arylomycyn wiąże się z peptydazą sygnałową, a reszta alaniny w pierścieniu makrocyklicznym zajmuje miejsce reszty alaniny P3 w pierścieniu makrocyklicznym. motyw rozpoznawania peptydazy sygnałowej Ala-X-Ala. Ponadto C-koniec arylomycyn znajduje się w odległości wiązań wodorowych katalitycznej diady seryna/lizyna.

Zaintrygowani możliwością, że arylomycyny mogą reprezentować klasę utajonych antybiotyków, których aktywność jest ukryta przez mutacje w peptydazie sygnałowej bakterii podatnych na nie, naukowcy z laboratorium Floyda Romesberga, biologa chemicznego w Scripps Research Institute w San Diego , Kalifornia, opracowała całkowitą syntezę tych naturalnych produktów. Pierwszą zsyntetyzowaną arylomycyną była arylomycyna A2 , a następnie przygotowano arylomycyny B2 i C.

ich działania polega na hamowaniu bakteryjnej peptydazy sygnałowej typu I (SPazy). Ponieważ obecnie nie ma leków farmaceutycznych o tego typu aktywności antybiotykowej, arylomycyny mogą mieć zastosowanie w leczeniu lekoopornych infekcji bakteryjnych i dlatego wzbudziły zainteresowanie naukowców.

Opracowano syntetyczne analogi arylomycyn, takie jak G0775, które mają szersze spektrum działania i większą skuteczność.

Zobacz też