1,2-dioksygenaza naftalenu
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1,2-dioksygenazy naftalenu | |||||||||
| nr WE | 1.14.12.12 | ||||||||
| nr CAS | 9074-04-8 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
W enzymologii 1,2-dioksygenaza naftalenu ( EC 1.14.12.12 ) jest enzymem , który katalizuje reakcję chemiczną
- naftalen + NADH + H + + O 2 (1R, 2S) -1,2-dihydronaftaleno-1,2-diol + NAD +
Cztery substraty tego enzymu to naftalen , NADH , H + i O2 . , podczas gdy jego dwoma produktami są (1R,2S)-1,2-dihydronaftaleno-1,2-diol i NAD +
Enzym ten należy do rodziny oksydoreduktaz , szczególnie tych działających na sparowanych dawców, z O2 jako utleniaczem i włączaniem lub redukcją tlenu. Wprowadzony tlen nie musi pochodzić z O2 z NADH lub NADPH jako jednym donorem i włączeniem dwóch atomów tlenu w drugim donorze. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to naftalen, NADH: oksydoreduktaza tlenowa (1,2-hydroksylująca) . Inne powszechnie używane nazwy to dioksygenaza naftalenowa i oksygenaza naftalenowa . Enzym ten bierze udział w 4 szlakach metabolicznych : degradacja 1- i 2-metylonaftalenu, degradacja naftalenu i antracenu, degradacja fluorenu i degradacja etylobenzenu. Zatrudnia jednego kofaktora , żelazo .
Studia strukturalne
Pod koniec 2007 roku rozwiązano 18 struktur dla tej klasy enzymów o kodach dostępu PDB 1EG9 , 1NDO , 1O7G , 1O7H , 1O7M , 1O7N , 1O7P , 1O7W , 1UUV , 1UUW , 2B1X , 2B24 , 2HMJ , 2 HMK , 2HML , 2HMM , 2HMN i 2HMO .
- Ensley BD, Gibson DT (1983). „Dioksygenaza naftalenowa: oczyszczanie i właściwości końcowego składnika oksygenazy” . J. Bacteriol . 155 (2): 505–11. doi : 10.1128/JB.155.2.505-511.1983 . PMC 217717 . PMID 6874638 .
- Jeffrey AM, Yeh HJ, Jerina DM, Patel TR, Davey JF, Gibson DT (1975). „Początkowe reakcje utleniania naftalenu przez Pseudomonas putida”. Biochemia . 14 (3): 575–84. doi : 10.1021/bi00674a018 . PMID 234247 .
