1,4-dihydroksy-2-naftoesan poliprenylotransferazy
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| poliprenylotransferazy 1,4-dihydroksy-2-naftoesanu | |||||||||
| nr WE | 2.5.1.74 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| |||||||||
Poliprenylotransferaza 1-4-dihydroksy-2-naftoesanu (DHNA) (EC 2.5.1.74 ) jest enzymem , który katalizuje reakcję chemiczną: difosforan all-trans-nonaprenylu + 1-4-dihydroksy-2-naftoesan + H + demetylomenachinol-9 + difosforan + dwutlenek węgla
Stąd 3 substraty tego enzymu to całkowicie difosforan trans-nonaprenylu, 1-4-dihydroksy-2-naftoinian i jon wodoru, a trzema produktami są demetylomenachinol-9, difosforan i dwutlenek węgla. Jednak inne substraty, z których może korzystać ten enzym, obejmują difosforan farnezylu lub difosforan solanezylu zamiast difosforanu all-trans-nonaprenylu.
Poliprenylotransferaza 1-4-dihydroksy-2-naftoesanu znajduje się w 88 minucie chromosomu E. coli, podczas gdy pozostałe geny odpowiedzialne za syntezę menachinonu (witaminy K) są skupione w 51 minucie.
Enzym ten należy do rodziny transferaz , w szczególności przenoszących grupy alkilowe lub arylowe inne niż grupy metylowe. Inne nazwy enzymu obejmują oktaprenylotransferazę 1-4-dihydroksy-2-naftoanu, monoprenylotransferazę 1-4-dihydroksy-2-naftoanu i MenA.
Funkcjonować
Poliprenylotransferaza 1-4-dihydroksy-2-naftoesanu jest ósmym z 9 etapów biosyntezy menachinonu (witaminy K), w szczególności demetylomenachinolu-9 w ecoli. Witamina K jest kofaktorem niezbędnym do życia i działa jako jeden transporter elektronów w fotosyntezie jako cząsteczka redoks. Reakcje, które katalizuje ten enzym, polegają na pobraniu rozpuszczalnego bicyklicznego związku naftalenoidowego DHNA i przekształceniu go w demetylomenachinon-9 poprzez przyłączenie 40-węglowego łańcucha bocznego do DHNA. Jednak ten enzym jest wyjątkowy w tym sensie, że może umieszczać różne długości łańcuchów bocznych węgla w DHNA w celu wytworzenia różnych demetylomenachinoli i menachinoli.
Inne organizmy zawierające ten szlak to Micrococcus luterus i Mycobacterium tuberculosis .
Inhibitory i aktywatory
Zarówno E. coli, jak i Micrococcus luterus wymagają Mg 2+ do działania, a pH 7 w Micrococcus luterus jest optymalne. EDTA jest również związkiem aktywującym enzym w Micrococcus luterus w optymalnym stężeniu 5 mM, ale po osiągnięciu 20 mM staje się inhibitorem i do jego reaktywacji potrzebny jest Mg 2+ .
| Inhibitory enzymów | Organizm |
|---|---|
| (R)-1-(4-((3-((4-chlorofenylo)(metoksyimino)metylo)fenoksy)-metylo)piperydyn-1-ylo)oktan-2-ylokarbaminian | Prątek gruźlicy |
| (R)-1-(4-((3-(4-chlorobenzoilo)fenoksy)metylo)piperydyn-1-ylo)-oktan-2-ylokarbaminian | Prątek gruźlicy |
| (S)-(2-chloro-4-((1-(2-hydroksyoktylo)piperydyn-4-ylo)metoksy)-fenylo)(4-chlorofenylo)metanon | Prątek gruźlicy |
| (S)-1-(4-((3-chloro-4-((4-chlorofenylo)(metoksyimino)metylo)-fenoksy)metylo)piperydyn-1-ylo)oktan-2-ylokarbaminian | Prątek gruźlicy |
| (S)-1-(4-((3-chloro-4-(4-chlorobenzoilo)fenoksy)metylo)-piperydyn-1-ylo)oktan-2-ylokarbaminian | Prątek gruźlicy |
| około 2+ | Micrococcus luterus |
| EDTA | Micrococcus luterus |
Lokalizacja
Lokalizacja poliprenylotransferazy 1-4-dihydroksy-2-naftoanu znajduje się w błonie.
