ACTL6A

Identyfikatory
ACTL6A
	, ACTL6, ARPN-BETA, Arp4, BAF53A, INO80K, działające jak 6A, SMARCN1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcje molekularne
Składnik komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko podobne do aktyny 6A jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen ACTL6A .

Funkcjonować

Ten gen koduje członka rodziny białek związanych z aktyną (ARP), które mają znaczną identyczność sekwencji aminokwasów z konwencjonalnymi aktynami. Zarówno aktyny, jak i ARP mają wspólną cechę fałdu aktynowego, który jest szczeliną wiążącą ATP. ARP biorą udział w różnych procesach komórkowych, w tym w transporcie pęcherzykowym, orientacji wrzeciona, migracji jądrowej i przebudowie chromatyny . Gen ten koduje białko podjednostki 53 kDa kompleksu BAF (BRG1/brm-associated factor) u ssaków, które jest funkcjonalnie spokrewnione z kompleksem SWI/SNF u S. cerevisiae i Drosophila ; uważa się, że ta ostatnia ułatwia transkrypcyjną aktywację określonych genów poprzez antagonizowanie represji transkrypcyjnej za pośrednictwem chromatyny . Wraz z beta-aktyną jest wymagana do maksymalnej aktywności ATPazy BRG1 i asocjacji kompleksu BAF z chromatyną/matrycą. Opisano trzy warianty transkryptu, które kodują dwie różne izoformy białek.

Znaczenie kliniczne

ACTL6A jest amplifikowany w raku głowy i raku płaskonabłonkowym i powoduje złe rokowanie u pacjentów. W raku wątrobowokomórkowym sprzyja przerzutom.

Interakcje

Wykazano, że ACTL6A oddziałuje z SMARCA2 , Myc , białkiem związanym z domeną transformacyjną/transkrypcyjną , RuvB-like 1 i SMARCA4 .

Dalsza lektura

Schafer DA, Schroer TA (2000). „Białka związane z aktyną”. rok Rev. Cell Dev. Biol . 15 : 341–63. doi : 10.1146/annurev.cellbio.15.1.341 . PMID 10611965 .
Doyon Y, Wybrzeże J (2004). „Wysoce konserwatywny i wielofunkcyjny kompleks NuA4 HAT”. bież. Opinia. Genet. Dev . 14 (2): 147–54. doi : 10.1016/j.gde.2004.02.009 . PMID 15196461 .
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998). „Kompleks ludzkiej polimerazy RNA II zawierający czynniki modyfikujące strukturę chromatyny” . Mol. Komórka. Biol . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). „Rekonstytucja kompleksu przebudowy chromatyny rdzenia z podjednostek SWI / SNF” . Mol. komórka . 3 (2): 247–53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID 10078207 .
Ikura T, Ogryzko VV, Grigoriev M, Groisman R, Wang J, Horikoshi M, Scully R, Qin J, Nakatani Y (2000). „Zaangażowanie kompleksu acetylazy histonowej TIP60 w naprawę DNA i apoptozę” . komórka . 102 (4): 463–73. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00051-9 . PMID 10966108 . S2CID 18047169 .
Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Młody MK, Łosoś ED, Wang W (2001). „Ludzki kompleks przebudowy chromatyny SWI / SNF-B jest spokrewniony z drożdżami rsc i lokalizuje się w kinetochorach mitotycznych chromosomów” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 97 (24): 13015–20. Bibcode : 2000PNAS...9713015X . doi : 10.1073/pnas.240208597 . PMC27170 . _ PMID 11078522 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Genom Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). „Systematyczna lokalizacja subkomórkowa nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Przedstawiciel EMBO 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Śpiewane YH, Choi EY, Kwon H (2001). „Identyfikacja białka jądrowego ArpN jako składnika ludzkiego kompleksu SWI / SNF i jego selektywne powiązanie z podzbiorem aktywnych genów”. Mol. Komórki . 11 (1): 75–81. PMID 11266125 .
Lai CH, Chiu JY, Lin W (2001). „Identyfikacja ludzkiego genu krzywej szyi przez porównawczą identyfikację genów”. Biochim. Biofiza. Akta . 1517 (3): 449–54. doi : 10.1016/s0167-4781(00)00295-5 . PMID 11342225 .
Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (2001). „Kompleks p400 jest podstawowym celem transformacji E1A” . komórka . 106 (3): 297–307. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00450-0 . PMID 11509179 . S2CID 15634637 .
Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (2002). „SYT łączy się z ludzkimi kompleksami SNF / SWI i C-końcowym regionem jego partnera fuzyjnego SSX1, celując w histony” . J. Biol. chemia . 277 (7): 5498–505. doi : 10.1074/jbc.M108702200 . PMID 11734557 .
Park J, Wood MA, Cole MD (2002). „BAF53 tworzy odrębne kompleksy jądrowe i działa jako krytyczny kofaktor jądrowy oddziałujący z c-Myc w transformacji onkogennej” . Mol. Komórka. Biol . 22 (5): 1307–16. doi : 10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002 . PMC 134713 . PMID 11839798 .
Ohfuchi E, Nishimori K, Harata M (2003). „Alternatywne produkty splicingu genu ludzkiego białka związanego z aktyną jądrową, hArpNbeta / Baf53, które kodują izoformę białka hArpNbetaS w cytoplazmie”. Biologia. Biotechnologia. Biochem . 66 (8): 1740–3. doi : 10.1271/bbb.66.1740 . PMID 12353638 . S2CID 35246242 .
Kuroda Y, Oma Y, Nishimori K, Ohta T, Harata M (2003). „Swoista dla mózgu ekspresja białka ArpNalpha związanego z aktyną jądrową i jego udział w kompleksie przebudowy chromatyny ssaków SWI / SNF”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 299 (2): 328–34. doi : 10.1016/S0006-291X(02)02637-2 . PMID 12437990 .