SMARCA2

SMARCA2
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, BAF190, BRM, NCBRS, SNF2, SNF2L2, SNF2LA, SWI2, Sth1p, hBRM, hSNF2a, związane z SWI/SNF, związane z macierzą, zależne od aktyny regulatory chromatyny, podrodzina a, członek 2, BIS Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Prawdopodobny globalny aktywator transkrypcji SNF2L2 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SMARCA2 .

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen należy do rodziny białek SWI/SNF i jest bardzo podobne do białka brahma Drosophila . Członkowie tej rodziny mają helikazy i ATPazy i uważa się, że regulują transkrypcję pewnych genów poprzez zmianę struktury chromatyny wokół tych genów. Kodowane białko jest częścią dużego zależnego od ATP kompleksu przebudowy chromatyny SNF/SWI, który jest wymagany do aktywacji transkrypcji genów normalnie represjonowanych przez chromatynę . Znaleziono dwa warianty transkryptu kodujące różne izoformy tego genu, który zawiera polimorfizm długości powtórzeń trinukleotydów (CAG) .

Interakcje

Wykazano, że SMARCA2 wchodzi w interakcje z:

• ACTL6A ,
• ARID1B ,
• CEBPB ,
• POLR2A ,
• prohibicja ,
• SIN3A ,
• SMARCB1 ,
• SMARCC1 i
• SS18 .

- zespół Nicolaidesa Baraitsera (NCBRS)

Dalsza lektura

•    Aves SJ, Hindley J, Phear GA, Tongue N (sierpień 1995). „Mapowanie genu drożdży z rozszczepienia blisko suc1 koduje białko zawierające dwie bromodomeny”. Genetyka molekularna i ogólna . 248 (4): 491–8. doi : 10.1007/BF02191650 . PMID 7565614 . S2CID 10281349 .
•    Chiba H, Muramatsu M, Nomoto A, Kato H (maj 1994). „Dwa ludzkie homologi Saccharomyces cerevisiae SWI2/SNF2 i Drosophila brahma są koaktywatorami transkrypcji współpracującymi z receptorem estrogenowym i receptorem kwasu retinowego” . Badania kwasów nukleinowych . 22 (10): 1815–20. doi : 10.1093/nar/22.10.1815 . PMC 308079 . PMID 8208605 .
•    Muchardt C, Yaniv M (listopad 1993). „Ludzki homolog genów Saccharomyces cerevisiae SNF2 / SWI2 i Drosophila brm nasila aktywację transkrypcji przez receptor glukokortykoidowy” . Dziennik EMBO . 12 (11): 4279–90. doi : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb06112.x . PMC 413724 . PMID 8223438 .
•    Muchardt C, Reyes JC, Bourachot B, Leguoy E, Yaniv M (lipiec 1996). „Białka hbrm i BRG-1, składniki ludzkiego kompleksu SNF/SWI, są fosforylowane i wykluczane ze skondensowanych chromosomów podczas mitozy” . Dziennik EMBO . 15 (13): 3394–402. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00705.x . PMC451903 . _ PMID 8670841 .
•   Wang W, Xue Y, Zhou S, Kuo A, Cairns BR, Crabtree GR (wrzesień 1996). „Różnorodność i specjalizacja kompleksów SWI / SNF ssaków” . Geny i rozwój . 10 (17): 2117–30. doi : 10.1101/gad.10.17.2117 . PMID 8804307 .
•    Wang W, Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (październik 1996). „Oczyszczanie i heterogeniczność biochemiczna kompleksu SWI-SNF ssaków” . Dziennik EMBO . 15 (19): 5370–82. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00921.x . PMC452280 . _ PMID 8895581 .
•   Ichinose H, Garnier JM, Chambon P, Losson R (marzec 1997). „Zależna od liganda interakcja między receptorem estrogenowym a ludzkimi homologami SWI2 / SNF2”. gen . 188 (1): 95–100. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00785-8 . PMID 9099865 .
•    Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (wrzesień 1998). „Kompleks ludzkiej polimerazy RNA II zawierający czynniki modyfikujące strukturę chromatyny” . Biologia molekularna i komórkowa . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
•   Thaete C, Brett D, Monaghan P, Whitehouse S, Rennie G, Rayner E, Cooper CS, Goodwin G (kwiecień 1999). „Domeny funkcjonalne białek translokacji mięsaka maziowego SYT i SYT-SSX oraz kolokalizacja z białkiem SNF BRM w jądrze” . Genetyka molekularna człowieka . 8 (4): 585–91. doi : 10.1093/hmg/8.4.585 . PMID 10072425 .
•   Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (luty 1999). „Rekonstytucja kompleksu przebudowy chromatyny rdzenia z podjednostek SWI / SNF” . Komórka molekularna . 3 (2): 247–53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID 10078207 .
•   Lee DW, Zhang K, Ning ZQ, Raabe EH, Tintner S, Wieland R, Wilkins BJ, Kim JM, Blough RI, Arceci RJ (lipiec 2000). „Gen podobny do SNF2 związany z proliferacją (PASG): członek rodziny SNF2 zmieniony w białaczce”. Badania nad rakiem . 60 (13): 3612–22. PMID 10910076 .
•    Phelan ML, Schnitzler GR, Kingston RE (wrzesień 2000). „Transfer oktameru i tworzenie stabilnie przebudowanych nukleosomów przez ludzki SWI-SNF i jego izolowane ATPazy” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (17): 6380–9. doi : 10.1128/MCB.20.17.6380-6389.2000 . PMC86113 . _ PMID 10938115 .
•    Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (listopad 2000). „Ludzki kompleks przebudowy chromatyny SWI / SNF-B jest spokrewniony z drożdżami rsc i lokalizuje się w kinetochorach mitotycznych chromosomów” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (24): 13015–20. Bibcode : 2000PNAS...9713015X . doi : 10.1073/pnas.240208597 . PMC27170 . _ PMID 11078522 .
•   Machida Y, Murai K, Miyake K, Iijima S (styczeń 2001). „Ekspresja czynników przebudowy chromatyny podczas różnicowania neuronów”. Dziennik Biochemii . 129 (1): 43–9. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002834 . PMID 11134956 .
•    de la Serna IL, Carlson KA, Imbalzano AN (luty 2001). „Kompleksy SWI / SNF ssaków promują różnicowanie mięśni za pośrednictwem MyoD”. Genetyka przyrody . 27 (2): 187–90. doi : 10.1038/84826 . PMID 11175787 . S2CID 20495742 .
•   Ruhf ML, Braun A, Papoulas O, Tamkun JW, Randsholt N, Meister M (kwiecień 2001). „Gen domina Drosophila koduje nowych członków rodziny ATPaz zależnych od DNA SWI2 / SNF2, które przyczyniają się do wyciszania genów homeotycznych”. Rozwój . 128 (8): 1429–41. doi : 10.1242/dev.128.8.1429 . PMID 11262242 .
•   Strobeck MW, Reisman DN, Gunawardena RW, Betz BL, Angus SP, Knudsen KE, Kowalik TF, Weissman BE, Knudsen ES (luty 2002). „Kompensacja funkcji BRG-1 przez Brm: wgląd w rolę podstawowych podjednostek SWI-SNF w sygnalizacji supresorowej nowotworu siatkówczaka” . Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 4782–9. doi : 10.1074/jbc.M109532200 . PMID 11719516 .
•   Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (luty 2002). „SYT łączy się z ludzkimi kompleksami SNF / SWI i C-końcowym regionem jego partnera fuzyjnego SSX1, celując w histony” . Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 5498–505. doi : 10.1074/jbc.M108702200 . PMID 11734557 .
•   Mizutani T, Ito T, Nishina M, Yamamichi N, Watanabe A, Iba H (maj 2002). „Utrzymanie zintegrowanej ekspresji genów prowirusowych wymaga Brm, podjednostki katalitycznej kompleksu SWI/SNF” . Journal of Biological Chemistry . 277 (18): 15859–64. doi : 10.1074/jbc.M112421200 . PMID 11850427 .