ATPazy typu P , takie jak ATP11B, są fosforylowane w stanie pośrednim i napędzają transport jonów przez błony pod górę. Zidentyfikowano kilka podrodzin ATPaz typu P. Jedna podrodzina transportuje jony metali ciężkich, takie jak Cu(2+) czy Cd(2+). Inna podrodzina transportuje jony metali nieciężkich, takie jak H(+), Na(+), K(+) czy Ca(+). Trzecia podrodzina transportuje amfipaty, takie jak fosfatydyloseryna .
