Alex K. Shalek
Alex Shalek | |
---|---|
Urodzić się | 18 grudnia 1981 |
Nagrody |
Harolda E. Edgertona na MIT (2020) Pew Charitable Trust Pew-Stewart Scholar (2018) Alfred P. Sloan Foundation Sloan Research Fellow (2018) Searle Scholars Program (2015) Beckman Young Investigators Award (2015) Nowy innowator dyrektora NIH Nagroda (2015) |
Kariera naukowa | |
Instytucje |
Massachusetts Institute of Technology Broad Institute Koch Institute for Integrative Cancer Research Ragon Institute Mass General Hospital Harvard Medical School |
Doradca doktorski | Park Hongkun |
Strona internetowa |
Alex K. Shalek jest inżynierem biomedycznym i głównym członkiem wydziału Instytutu Inżynierii i Nauki Medycznej (IMES), profesorem nadzwyczajnym chemii oraz członkiem niestacjonarnym Instytutu Kocha dla Integracyjnych Badań nad Rakiem w Massachusetts Institute of Technology . Ponadto jest członkiem Instytutu Ragon i członkiem Instytutu Broad Institute , asystentem w zakresie immunologii w Massachusetts General Hospital oraz instruktorem nauk o zdrowiu i technologii w Harvard Medical School . Multidyscyplinarne badania Shalek Lab mają na celu stworzenie i wdrożenie metod o szerokim zastosowaniu do badania i inżynierii odpowiedzi komórkowych w tkankach, do napędzania odkryć biologicznych i poprawy prognozowania, diagnostyki i terapii chorób autoimmunologicznych, zakaźnych i nowotworowych. genomiką pojedynczych komórek i badania wielu wyniszczających, ale trudnych do zbadania chorób ludzkich z partnerami z całego świata.
Edukacja i wcześniejsze badania
Shalek otrzymał tytuł licencjata z wyróżnieniem w 2004 roku na Uniwersytecie Columbia , gdzie studiował fizykę chemiczną jako stypendysta John Jay u Richarda Bersohna i Louisa Brusa . Następnie wykonał pracę dyplomową z fizyki chemicznej, rozwijając macierze nanoprzewodów jako „strzykawki” komórkowe i sondy elektrochemiczne pod kierunkiem Hongkun Park na Uniwersytecie Harvarda. Następnie, jako doktor habilitowany, pod kierunkiem Parka i Aviva Regeva w Broad Institute, Shalek pomógł wprowadzić wzorce pojedynczych komórek w odpowiedziach komórkowych, aby zbadać, w jaki sposób komórki reagują inaczej na ten sam stan, pokazując, że kowariancja ekspresji genów w całym genomie w różnych Komórki mogłyby być użyte do definiowania typów i stanów komórkowych, ich wewnętrznych „obwodów”, od „od dołu do góry”.
Jako niezależny badacz, Shalek i jego laboratorium pomogli skalować i upraszczać genomikę pojedynczych komórek, aby badać złożone, niskonakładowe próbki kliniczne na całym świecie. Równolegle wykorzystali te i inne podejścia [ nadmierne cytowania ] , aby pomóc zbadać przyczyny i konsekwencje heterogeniczności komórek w przypadku raka, chorób zakaźnych, [ nadmiernej liczby cytowań ] i stanów zapalnych.
Trwają badania
Bieżąca praca w Shalek Lab obejmuje zarówno rozwój szeroko zakrojonych technologii wspomagających, jak i ich zastosowanie do charakteryzowania, modelowania i sterowania systemami wielokomórkowymi. Jeśli chodzi o rozwój technologii, laboratorium łączy obszary badań z zakresu genomiki , biologii chemicznej i nanotechnologii w celu ustalenia dostępnych podejść do profilowania i kontrolowania komórek oraz ich interakcji.
Oprócz tych narzędzi we współpracy z globalną społecznością naukową laboratorium stosuje je do analizowania chorób ludzkich, takich jak COVID-19, metodycznie łącząc cechy komórkowe i obserwacje kliniczne. Główne obszary zainteresowania obejmują: jak: komórki odpornościowe koordynują zrównoważone reakcje na stres środowiskowy; interakcje komórka gospodarza z patogenem ewoluują podczas infekcji; [ nadmierna liczba cytatów ] i komórki nowotworowe unikają leczenia terapeutycznego i naturalnej odporności.
Na podstawie tych i innych obserwacji laboratorium ma na celu zrozumienie, w jaki sposób choroba zmienia funkcjonowanie tkanek na poziomie komórkowym, oraz wdrożenie interwencji terapeutycznych i profilaktycznych w celu przywrócenia lub wsparcia zdrowia ludzkiego.
Wybierz wyróżnienia i nagrody
2019-20 Nagroda Wydziału za osiągnięcia Harolda E. Edgertona 2020
Nagroda Młodego Mentora, Harvard Medical School , 2020
Stypendysta Pew-Stewart, Pew Charitable Trust Charitable Trust, 2018 – 2022
Sloan Research Fellow in Chemistry, Alfred P. Sloan Foundation , 2018 – 2020
Profesura rozwoju kariery firmy Pfizer-Laubach, MIT, 2017–2020
Asystent doradcy naukowego, medycyna translacyjna nauki, 2016
Nagroda Dyrektora NIH dla Nowego Innowatora , 2015-2020
Beckman Young Investigators Award Fundacja Arnolda i Mabel Beckmanów, 2015 – 2019
Program Searle Scholars , Kinship Foundation, 2015 – 2018
Pierwsze miejsce w konkursie „Follow That Cell” (członek zespołu), NIH, 2015
Hermann LF von Helmholtz Career Development Professor, MIT, 2014 – 2016
Excellence Award, Broad Institute of Harvard i MIT, 2013
Nagroda Dudleya R. Herschbacha za nauczanie, Uniwersytet Harvarda, 2006
Absolwent stypendium badawczego, NSF, 2005 – 2008
Dyplom z wyróżnieniem w nauczaniu, Uniwersytet Harvarda, 2005
Phi Beta Kappa, Columbia University, 2004
John Jay Scholar, Columbia University, 2000 – 2004
Wybierz publikacje
- Huang, Siyi i in. (2021-01-21). „Węzły chłonne są unerwione przez unikalną populację neuronów czuciowych o potencjale immunomodulującym”. komórka . 184 (2): 441–459.e25
- Zieglera, CGK i in. (2020-05-28). „Receptor SARS-CoV-2 ACE2 jest genem stymulowanym interferonem w ludzkich komórkach nabłonka dróg oddechowych i jest wykrywany w określonych podzbiorach komórek w tkankach”, Cell, 181, 1016 (2020).
- Hughes, Travis K. i in. (2020-10-13). „Masowo równoległe scRNA-Seq oparte na syntezie drugiej nici ujawnia stany komórkowe i cechy molekularne ludzkich patologii zapalnych skóry”. Odporność . 53 (4): 878–894.e7.
- Kotliar, Dylan i in. (2020-11-25). „Profilowanie pojedynczej komórki choroby wirusa Ebola in vivo ujawnia dynamikę wirusa i gospodarza” . komórka . 183 (5): 1383–1401.e19.
- Kazer, Samuel W. i in. (2020-04). „Zintegrowana analiza pojedynczych komórek wielokomórkowej dynamiki immunologicznej podczas nadostrego zakażenia HIV-1”. Medycyna natury . 26 (4): 511–518.
- Smillie, C.# i in. (2019). „Wewnątrz- i międzykomórkowe ponowne okablowanie ludzkiej okrężnicy podczas wrzodziejącego zapalenia jelita grubego” Cell , 178 , 714 (2019).
- Ordovas-Montanes, J. i in. (2018). „Zmniejszona różnorodność komórkowa i zmieniony podstawowy stan komórek progenitorowych informują o dysfunkcji bariery nabłonkowej w odporności człowieka typu 2”, Nature , 560 , 649 (2018).
- Martin-Gayo, E. i in. (2018). „Racjonalne ramy modulowania zachowań immunologicznych zespołu zainspirowane elitarną kontrolą HIV-1”, Genome Biol. , 19 , 10 (2018).
- TM Gierahn i in. (2017) „Seq-Well: przenośna, niedroga platforma do jednokomórkowego RNA-Seq próbek o niskim poziomie wejściowym”. Natura Meth . 14 (2017): 395.
- I.Tirosz i in. (2017) „Analiza wielokomórkowego ekosystemu przerzutowego czerniaka za pomocą pojedynczej komórki RNA-seq”. Nauka 352.6282 (2016): 189-96.
- EZ Macosko i in. (2015). „Profilowanie ekspresji w całym genomie tysięcy pojedynczych komórek przy użyciu nanolitrowych kropelek”. Komórka 161 (2015): 1202-14.
- AK Shalek i in. (2014). „Sekwencja jednokomórkowego RNA na dużą skalę ujawnia strategie regulacji dynamicznej zmienności między komórkami poprzez sygnalizację parakrynną”. Natura 510 (2014): 363.
- AK Shalek i in. (2013). „Transkryptomika jednokomórkowa ujawnia bimodalność w ekspresji i splicingu w komórkach odpornościowych”. Przyroda 498 (2013): 236-40.
- N. Yosef i in. (2013). „Dynamiczna sieć regulacyjna kontrolująca różnicowanie komórek Th17”. Przyroda 496 (2013): 461-68.
- Bibliografia _ _ shaleklab.com . Źródło 2020-10-30 .
- Bibliografia _ Jorgolli, Marsela; Shalek, Alex K.; Yoon, Myung-Han; Gertner, Rona S.; Park, Hongkun (marzec 2012). „Pionowe macierze elektrod z nanoprzewodów jako skalowalna platforma do wewnątrzkomórkowego łączenia z obwodami neuronalnymi” . Natura Nanotechnologia . 7 (3): 180–184. Bibcode : 2012NatNa...7..180R . doi : 10.1038/nnano.2011.249 . ISSN 1748-3395 . PMC 4209482 . PMID 22231664 .
- ^ a b Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Adiconis, Xian; Gertner, Rona S.; Gaublomme, Jellert T.; Raychowdhury, Raktima; Schwartz, Schraga; Józef, Nir; Malboeuf, Krystyna; Lu, Diana; Trombetta, John J. (czerwiec 2013). „Transkryptomika jednokomórkowa ujawnia bimodalność w ekspresji i splicingu w komórkach odpornościowych” . Natura . 498 (7453): 236–240. Bibcode : 2013Natur.498..236S . doi : 10.1038/natura12172 . ISSN 1476-4687 . PMC 3683364 . PMID 23685454 .
- ^ a b Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Shuga, Joe; Trombetta, John J.; Gennert, Dave; Lu, Diana; Chen, Peilin; Gertner, Rona S.; Gaublomme, Jellert T.; Józef, Nir; Schwartz, Schraga (czerwiec 2014). „Seq pojedynczej komórki RNA ujawnia dynamiczną parakrynną kontrolę zmienności komórkowej” . Natura . 510 (7505): 363–369. Bibcode : 2014Natur.510..363S . doi : 10.1038/natura13437 . ISSN 1476-4687 . PMC 4193940 . PMID 24919153 .
- ^ abcd Gierahn , Todd M .; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Bryson, Bryan D.; Butler, Andrzej; Satija, Rahul; Szczęście, Saro; Miłość, J. Christopher; Shalek, Alex K. (kwiecień 2017). „Seq-Well: przenośne, tanie sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek przy dużej przepustowości” . Metody natury . 14 (4): 395–398. doi : 10.1038/nmeth.4179 . hdl : 1721.1/113430 . ISSN 1548-7105 . PMC 5376227 . PMID 28192419 .
- ^ „Szeroko dostępne sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek” . Wiadomości z MIT | Instytut Technologii Massachusetts . Źródło 2021-02-17 .
- ^ ab Macosko , Evan Z.; Basu, Anindita; Satija, Rahul; Nemesz, Jakub; Szekhar, Karthik; Goldman, Melissa; Tirosh, Włochy; Białas, Allison R.; Kamitaki, Nolan; Martersteck, Emily M.; Trombetta, John J. (21.05.2015). „Wysoce równoległe profilowanie ekspresji poszczególnych komórek w całym genomie przy użyciu nanolitrowych kropelek” . komórka . 161 (5): 1202–1214. doi : 10.1016/j.cell.2015.05.002 . ISSN 0092-8674 . PMC 4481139 . PMID 26000488 .
- ^ a b c d e f Hughes, Travis K.; Wadsworth, Marc H.; Gierahn, Todd M.; Zrób, Tran; Weiss, Dawid; Andrade, Priscila R.; Mam, Feiyang; Silva, Bruno J. de Andrade; Shao, Shuai; Tsoi, Lam C.; Ordovas-Montanes, Jose (2020-10-13). „Masowo równoległe scRNA-Seq oparte na syntezie drugiej nici ujawnia stany komórkowe i cechy molekularne ludzkich patologii zapalnych skóry” . Odporność . 53 (4): 878–894.e7. doi : 10.1016/j.immuni.2020.09.015 . ISSN 1074-7613 . PMC 7562821 . PMID 33053333 .
- ^ a b c d Kazer, Samuel W.; Aicher, Toby P.; Muema, Daniel M.; Carroll, Shaina L.; Ordovas-Montanes, Jose; Miao, Vincent N.; Tu, Ang A.; Ziegler, Carly GK; Nyquist, Sarah K.; Wong, Emily B.; Ismail, Nasreen (kwiecień 2020). „Zintegrowana analiza jednokomórkowa wielokomórkowej dynamiki immunologicznej podczas nadostrego zakażenia HIV-1” . Medycyna natury . 26 (4): 511–518. doi : 10.1038/s41591-020-0799-2 . ISSN 1546-170X . PMC 7237067 . PMID 32251406 .
- ^ a b c d Kotliar, Dylan; Lin, Aaron E.; Logue, James; Hughes, Travis K.; Khoury, Nadine M.; Raju, Siddharth S.; Wadsworth, Marc H.; Chen, Han; Kurtz, Jonathan R.; Dighero-Kemp, Bonnie; Bjornson, Zach B. (25.11.2020). „Profilowanie pojedynczej komórki wirusa Ebola w warunkach in vivo ujawnia dynamikę wirusa i gospodarza” . komórka . 183 (5): 1383–1401.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.10.002 . ISSN 0092-8674 . PMC 7707107 . PMID 33159858 .
- ^ Genshaft, Alex S.; Li, Shuqiang; Galant, Caroline J.; Darmanis, Spyros; Prakadan, Sanjay M.; Ziegler, Carly GK; Lundberg, Martin; Fredriksson, Szymon; Hong, Joyce; Regew, Awiw; Livak, Kenneth J. (2016-09-19). „Multipleksowe, ukierunkowane profilowanie proteomów i transkryptomów jednokomórkowych w jednej reakcji” . Biologia genomu . 17 (1): 188. doi : 10.1186/s13059-016-1045-6 . ISSN 1474-760X . PMC 5027636 . PMID 27640647 .
- ^ Kimmerling, Robert J.; Lee Szeto, Gregory; Li, Jennifer W.; Genshaft, Alex S.; Kazer, Samuel W.; Płatnik, Kristofor R.; de Riba Borrajo, Jakub; Blainey, Paul C.; Irvine, Darrell J.; Shalek, Alex K.; Manalis, Scott R. (2016-01-06). „Platforma mikroprzepływowa umożliwiająca jednokomórkowe sekwencjonowanie RNA wielopokoleniowych linii” . Komunikacja natury . 7 (1): 10220. Bibcode : 2016NatCo...710220K . doi : 10.1038/ncomms10220 . ISSN 2041-1723 . PMC 4729820 . PMID 26732280 .
- ^ Tu, Ang A .; Gierahn, Todd M.; Monian, Brinda; Morgan, Duncan M.; Mehta, Naveen K.; Ruiter, Bert; Shreffler, Wayne G.; Shalek, Alex K.; Miłość, J. Christopher (grudzień 2019). „Sekwencjonowanie TCR w połączeniu z masowo równoległymi sekwencjami 3′ RNA ujawnia klonotypowe sygnatury komórek T” . Immunologia przyrody . 20 (12): 1692–1699. doi : 10.1038/s41590-019-0544-5 . ISSN 1529-2916 . PMC 7528220 . PMID 31745340 .
- ^ Galen, Peter van; Hovestadt, Volker; II, Marc H. Wadsworth; Hughes, Travis K.; Griffin, Gabriel K.; Battaglia, Sofia; Verga, Julia A.; Stephansky, Jason; Pastika, Timothy J.; Historia, Jennifer Lombardi; Pinkus, Geraldine S. (2019-03-07). „Single-Cell RNA-Seq ujawnia hierarchie AML istotne dla progresji choroby i odporności” . komórka . 176 (6): 1265–1281.e24. doi : 10.1016/j.cell.2019.01.031 . ISSN 0092-8674 . PMC 6515904 . PMID 30827681 .
- ; ^ abc Tirosh , Włochy Izar, Beniamin; Prakadan, Sanjay M.; Wadsworth, Marc H.; Traktat, Daniel; Trombetta, John J.; Rotem, Asaf; Rodman, Krzysztof; Lian, Krystyna; Murphy, George; Fallahi-Sichani, Mohammad (2016-04-08). „Analiza wielokomórkowego ekosystemu przerzutowego czerniaka za pomocą jednokomórkowego RNA-seq” . nauka . 352 (6282): 189–196. Bibcode : 2016Sci...352..189T . doi : 10.1126/science.aad0501 . ISSN 0036-8075 . PMC 4944528 . PMID 27124452 .
- ^ Lohr, Jens G.; Adalsteinsson, Wiktor A.; Cibulskis, Krystian; Choudhury, Atish D.; Rosenberg, Mara; Cruz-Gordillo, Piotr; Franciszek, Joshua M.; Zhang, Cheng-Zhong; Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Trombetta, John J. (maj 2014). „Sekwencjonowanie całego egzomu krążących komórek nowotworowych zapewnia wgląd w raka prostaty z przerzutami” . Biotechnologia przyrody . 32 (5): 479–484. doi : 10.1038/nbt.2892 . ISSN 1546-1696 . PMC 4034575 . PMID 24752078 .
- ^ a b Patel, Anoop P .; Tirosh, Włochy; Trombetta, John J.; Shalek, Alex K.; Gillespie, Shawn M.; Wakimoto, Hiroaki; Cahill, Daniel P.; Nahed, Brian V.; Curry, William T.; Martuza, Robert L.; Louis, David N. (20.06.2014). „Seq jednokomórkowego RNA podkreśla heterogeniczność wewnątrz guza w pierwotnym glejaku” . nauka . 344 (6190): 1396–1401. Bibcode : 2014Sci...344.1396P . doi : 10.1126/science.1254257 . ISSN 0036-8075 . PMC 4123637 . PMID 24925914 .
- ^ a b Hamza, Baszar; Ng, Sheng Rong; Prakadan, Sanjay M.; Delgado, Francisco Feijó; Podbródek, Christopher R.; Król, Emily M.; Yang, Lucy F.; Davidson, Shawn M.; DeGouveia, Kelsey L.; Cermak, Nathan; Navia, Andrew W. (2019-02-05). „Optofluidyczny sorter komórek w czasie rzeczywistym do podłużnych badań CTC w mysich modelach raka” . Obrady Narodowej Akademii Nauk . 116 (6): 2232–2236. Bibcode : 2019PNAS..116.2232H . doi : 10.1073/pnas.1814102116 . ISSN 0027-8424 . PMC 6369805 . PMID 30674677 .
- ^ ab Kimmerling , Robert J.; Prakadan, Sanjay M.; Gupta, Alejandro J.; Calistri, Nicholas L.; Stevens, Mark M.; Olcum, Selim; Cermak, Nathan; Drake, Riley S.; Pelton, Krystyna; De Smet, Frederik; Ligon, Keith L. (2018-11-27). „Łączenie pomiarów masy, tempa wzrostu i ekspresji genów pojedynczych komórek” . Biologia genomu . 19 (1): 207. doi : 10.1186/s13059-018-1576-0 . ISSN 1474-760X . PMC 6260722 . PMID 30482222 .
- ^ ab Ziegler, Carly GK; Allon, Samuel J.; Nyquist, Sarah K.; Mbano, Ian M.; Miao, Vincent N.; Tzouanas, Konstantyn N.; Cao, Yuming; Yousif, Ashraf S.; Bale, Julia; Hauser, Blake M.; Feldman, Jared (28.05.2020). „Receptor SARS-CoV-2 ACE2 jest genem stymulowanym interferonem w ludzkich komórkach nabłonka dróg oddechowych i jest wykrywany w określonych podzbiorach komórek w tkankach” . komórka . 181 (5): 1016–1035.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.04.035 . ISSN 0092-8674 . PMC 7252096 . PMID 32413319 .
- ^ a b Gideon, Hannah P .; Hughes, Travis K.; Wadsworth, Marc H.; Tu, Ang Andy; Gierahn, Todd M.; Hopkins, Forrest F.; Wei, Jun-Rong; Kummerlowe, Conner; Grant, Nicole L.; Nargan, Kievershen; Phuah, JiaYao (26.10.2020). „Profilowanie pojedynczych komórek ziarniniaków płucnych gruźlicy ujawnia funkcjonalne sygnatury limfocytów kontroli bakteryjnej” . bioRxiv : 2020.10.24.352492. doi : 10.1101/2020.10.24.352492 . S2CID 226229228 .
- ^ ab Waldman , Benjamin S.; Schwarz, Dominik; Wadsworth, Marc H.; Saeij, Jeroen P.; Shalek, Alex K.; Lourido, Sebastian (23.01.2020). „Identyfikacja głównego regulatora różnicowania w toksoplazmie” . komórka . 180 (2): 359–372.e16. doi : 10.1016/j.cell.2019.12.013 . ISSN 0092-8674 . PMC 6978799 . PMID 31955846 .
- ^ ab Darrah, Patricia A.; Zeppa, Józef J.; Maiello, Paulina; Hackney, Joshua A.; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Pokkali, Suprija; Swanson, Phillip A.; Grant, Nicole L.; Rodgers, Mark A.; Kamath, Megha (styczeń 2020). „Zapobieganie gruźlicy u makaków po dożylnej immunizacji BCG” . Natura . 577 (7788): 95–102. Bibcode : 2020Natur.577...95D . doi : 10.1038/s41586-019-1817-8 . ISSN 1476-4687 . PMC 7015856 . PMID 31894150 .
- ^ Ranasinghe, Srinika; Lamothe, Pedro A.; Soghoian, Damien Z.; Kazer, Samuel W.; Cole, Michael B.; Shalek, Alex K.; Józef, Nir; Jones, R. Brad; Donaghey, Wiara; Nwonu, Chioma; Jani, Priya (2016-10-18). „Przeciwwirusowe komórki T CD8 + ograniczone przez ludzki antygen leukocytarny klasy II istnieją podczas naturalnej infekcji HIV i wykazują ekspansję klonalną” . Odporność . 45 (4): 917–930. doi : 10.1016/j.immuni.2016.09.015 . ISSN 1074-7613 . PMC 5077698 . PMID 27760342 .
- ^ ab Raghavan , Srivatsan; Zima, Piotr S.; Navia, Andrew W.; Williams, Hannah L.; DenAdel, Alan; Kalekar, Radha L.; Galvez-Reyes, Jennyfer; Dolny, Kristen E.; Mulugeta, Nolawit; Raghavan, Manisha S.; Borah, Ashir A. (2020-08-25). „Transkrypcyjny przesłuch mikrośrodowiskowy specyficzny dla podtypu i plastyczność komórek nowotworowych w przerzutowym raku trzustki” . bioRxiv : 2020.08.25.256214. doi : 10.1101/2020.08.25.256214 . S2CID 221355597 .
- ^ abc Martin- Gayo ; , Enrique Cole, Michael B.; Kolb, Kellie E.; Ouyang, Zhengyu; Cronin, Jacqueline; Kazer, Samuel W.; Ordovas-Montanes, Jose; Lichterfeld, Maciej; Walker, Bruce D.; Józef, Nir; Shalek, Alex K. (2018-01-29). „Ramy obliczeniowe oparte na odtwarzalności identyfikują indukowalny, wzmocniony stan przeciwwirusowy w komórkach dendrytycznych od elitarnych kontrolerów HIV-1” . Biologia genomu . 19 (1): 10. doi : 10.1186/s13059-017-1385-x . ISSN 1474-760X . PMC 5789701 . PMID 29378643 .
- ^ Kløverpris, Henrik N.; Kazer, Samuel W.; Mjösberg, Jenny; Mabuka, Jenniffer M.; Wellmann, Amanda; Ndhlovu, Zaza; Yadon, Marisa C.; Nhamoyebonde, pasterz; Münchhoff, Maksymilian; Simoni, Yannick; Andersson, Frank (2016-02-16). „Wrodzone komórki limfatyczne są nieodwracalnie wyczerpane podczas ostrej infekcji HIV-1 przy braku supresji wirusa” . Odporność . 44 (2): 391–405. doi : 10.1016/j.immuni.2016.01.006 . ISSN 1074-7613 . PMC 6836297 . PMID 26850658 .
- ^ abc Ordovas ; -Montanes, Jose Dwyer, Daniel F.; Nyquist, Sarah K.; Buchheit, Kathleen M.; Vukovic, Marko; Deb, Chaarushena; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Kazer, Samuel W.; Yoshimoto, Eri; Cahill, Katherine N. (sierpień 2018). „Alergiczna pamięć zapalna w ludzkich komórkach progenitorowych nabłonka oddechowego” . Natura . 560 (7720): 649–654. Bibcode : 2018Natur.560..649O . doi : 10.1038/s41586-018-0449-8 . hdl : 1721.1/122932 . ISSN 1476-4687 . PMC 6133715 . PMID 30135581 .
- ^ abc Smillie , Christopher S.; Biton, Mosze; Ordovas-Montanes, Jose; Sullivan, Keri M.; Burgin, Łaska; Graham, Daniel B.; Herbst, Rebecca H.; Rogel, Noga; Ślizgon, Michał; Waldman, Julia; Sud, Malika (2019-07-25). „Wewnątrz- i międzykomórkowe ponowne okablowanie ludzkiej okrężnicy podczas wrzodziejącego zapalenia jelita grubego” . komórka . 178 (3): 714–730.e22. doi : 10.1016/j.cell.2019.06.029 . ISSN 0092-8674 . PMC 6662628 . PMID 31348891 .
- ^ „Technika identyfikuje komórki T przygotowane na określone alergie lub infekcje: Naukowcy opracowują metodę izolowania i sekwencjonowania RNA komórek T, które reagują na określony cel” . ScienceDaily . Źródło 2021-02-17 .
- ^ Majumder, Partha P.; Mhlanga, Musa M.; Shalek, Alex K. (październik 2020). „Atlas komórek ludzkich i równość: wyciągnięte wnioski” . Medycyna natury . 26 (10): 1509–1511. arXiv : 2010.16154 . doi : 10.1038/s41591-020-1100-4 . ISSN 1546-170X . PMID 33029017 .
- ^ „Naukowcy identyfikują komórki, które prawdopodobnie są celem wirusa Covid-19” . Wiadomości z MIT | Instytut Technologii Massachusetts . Źródło 2021-02-17 .
- ^ „Do płuc i dalej” . hms.harvard.edu . Źródło 2021-02-17 .
- ^ a b Huang, Siyi; Ziegler, Carly GK; Austin, John; Mannoun, Najat; Vukovic, Marko; Ordovas-Montanes, Jose; Shalek, Alex K.; Andrian, Ulrich H. von (21.01.2021). „Węzły chłonne są unerwione przez unikalną populację neuronów czuciowych o potencjale immunomodulacyjnym” . komórka . 184 (2): 441–459.e25. doi : 10.1016/j.cell.2020.11.028 . ISSN 0092-8674 . PMC 9612289 . PMID 33333021 .
- Bibliografia _ Suárez-Fariñas, Mayte; Izar, Beniamin; Prakadan, Sanjay; Dannenfelser, Ruth; Tirosh, Włochy; Liu, Yong; Zhu, Qian; Devi, K. Sanjana P.; Carroll, Shaina L.; Chau, David (2017-06-29). „Homeostaza tkankowo-immunologiczna zależna od IFNγ jest dokooptowana w mikrośrodowisku guza” . komórka . 170 (1): 127–141.e15. doi : 10.1016/j.cell.2017.06.016 . ISSN 0092-8674 . PMC 5569303 . PMID 28666115 .
- ^ „Alex Shalek zdobywa nagrodę Wydziału Edgertona” . Wiadomości z MIT | Instytut Technologii Massachusetts . Źródło 2020-12-11 .
- ^ „Doskonałość w nagrodach mentorskich” . Biuro ds. Włączenia Różnorodności i Partnerstwa Społecznościowego w Harvard Medical School . Źródło 2020-12-11 .
- ^ „Shalek mianowany 2018 Pew-Stewart Scholar for Cancer Research - MIT Department of Chemistry” . Źródło 2020-12-11 .
- ^ „Profesor IMS Alex Shalek wygrywa stypendium Sloan Research Fellowship 2018” . Instytut Inżynierii i Nauki Medycznej . 2018-02-15 . Źródło 2021-02-09 .
- ^ „Alex Shalek mianowany profesorem rozwoju kariery Pfizer-Laubach - Shalek Lab” . shaleklab.com . Źródło 2020-12-11 .
- ^ „Poprzednie ASA | Medycyna translacyjna nauki” . stm.sciencemag.org . Źródło 2021-02-17 .
- ^ „Shalek otrzymał nagrodę NIH New Innovator Award” . Ragon Institute of MGH, MIT i Harvard . 2015-10-06 . Źródło 2020-12-11 .
- Wikimedia Commons znajdują się multimedia związane z Alex Shalek . Fundacja Arnolda i Mabel Beckmanów . Źródło 2020-12-11 .
- Wikimedia Commons znajdują się multimedia związane z Alex Shalek . Program Searle Scholars . Źródło 2020-12-11 .
- ^ a b c d e f g h „Alex K. Shalek” . Instytut Inżynierii i Nauki Medycznej . Źródło 2021-02-09 .
- ^ Josef, Nir; Shalek, Alex K.; Gaublomme, Jellert T.; Jin, Hulin; Lee, Youjin; Awasthi, Amit; Wu, Chuan; Karwacz, Katarzyna; Xiao, Sheng; Jorgolli, Marsela; Gennert, David (kwiecień 2013). „Dynamiczna sieć regulatorowa kontrolująca różnicowanie komórek TH 17” . Natura . 496 (7446): 461–468. Bibcode : 2013Natur.496..461Y . doi : 10.1038/natura11981 . ISSN 1476-4687 . PMC 3637864 . PMID 23467089 .
Linki zewnętrzne
- Publikacje Alexa K. Shalka zindeksowane przez Google Scholar
- 1981 urodzeń
- amerykańscy naukowcy
- Inżynierowie biomedyczni
- Ludzie z szerokiego Instytutu
- Absolwenci Columbia College (Nowy Jork).
- Wydział Uniwersytetu Harvarda
- Żywi ludzie
- Ludzie ze Szpitala Ogólnego w Massachusetts
- Wydział Massachusetts Institute of Technology School of Science
- Ludzie z Kalifornii
- Sloan Research Fellows