Alex K. Shalek

Alex Shalek
Alex K. Shalek, PhD.jpg
Alex Shalek, sierpień 2019
Urodzić się ( 18.12.1981 ) 18 grudnia 1981
Nagrody




Harolda E. Edgertona na MIT (2020) Pew Charitable Trust Pew-Stewart Scholar (2018) Alfred P. Sloan Foundation Sloan Research Fellow (2018) Searle Scholars Program (2015) Beckman Young Investigators Award (2015) Nowy innowator dyrektora NIH Nagroda (2015)
Kariera naukowa
Instytucje




Massachusetts Institute of Technology Broad Institute Koch Institute for Integrative Cancer Research Ragon Institute Mass General Hospital Harvard Medical School
Doradca doktorski Park Hongkun
Strona internetowa www.shaleklab.com _ _

Alex K. Shalek jest inżynierem biomedycznym i głównym członkiem wydziału Instytutu Inżynierii i Nauki Medycznej (IMES), profesorem nadzwyczajnym chemii oraz członkiem niestacjonarnym Instytutu Kocha dla Integracyjnych Badań nad Rakiem w Massachusetts Institute of Technology . Ponadto jest członkiem Instytutu Ragon i członkiem Instytutu Broad Institute , asystentem w zakresie immunologii w Massachusetts General Hospital oraz instruktorem nauk o zdrowiu i technologii w Harvard Medical School . Multidyscyplinarne badania Shalek Lab mają na celu stworzenie i wdrożenie metod o szerokim zastosowaniu do badania i inżynierii odpowiedzi komórkowych w tkankach, do napędzania odkryć biologicznych i poprawy prognozowania, diagnostyki i terapii chorób autoimmunologicznych, zakaźnych i nowotworowych. genomiką pojedynczych komórek i badania wielu wyniszczających, ale trudnych do zbadania chorób ludzkich z partnerami z całego świata.

Edukacja i wcześniejsze badania

Shalek otrzymał tytuł licencjata z wyróżnieniem w 2004 roku na Uniwersytecie Columbia , gdzie studiował fizykę chemiczną jako stypendysta John Jay u Richarda Bersohna i Louisa Brusa . Następnie wykonał pracę dyplomową z fizyki chemicznej, rozwijając macierze nanoprzewodów jako „strzykawki” komórkowe i sondy elektrochemiczne pod kierunkiem Hongkun Park na Uniwersytecie Harvarda. Następnie, jako doktor habilitowany, pod kierunkiem Parka i Aviva Regeva w Broad Institute, Shalek pomógł wprowadzić wzorce pojedynczych komórek w odpowiedziach komórkowych, aby zbadać, w jaki sposób komórki reagują inaczej na ten sam stan, pokazując, że kowariancja ekspresji genów w całym genomie w różnych Komórki mogłyby być użyte do definiowania typów i stanów komórkowych, ich wewnętrznych „obwodów”, od „od dołu do góry”.

Jako niezależny badacz, Shalek i jego laboratorium pomogli skalować i upraszczać genomikę pojedynczych komórek, aby badać złożone, niskonakładowe próbki kliniczne na całym świecie. Równolegle wykorzystali te i inne podejścia [ nadmierne cytowania ] , aby pomóc zbadać przyczyny i konsekwencje heterogeniczności komórek w przypadku raka, chorób zakaźnych, [ nadmiernej liczby cytowań ] i stanów zapalnych.

Trwają badania

Bieżąca praca w Shalek Lab obejmuje zarówno rozwój szeroko zakrojonych technologii wspomagających, jak i ich zastosowanie do charakteryzowania, modelowania i sterowania systemami wielokomórkowymi. Jeśli chodzi o rozwój technologii, laboratorium łączy obszary badań z zakresu genomiki , biologii chemicznej i nanotechnologii w celu ustalenia dostępnych podejść do profilowania i kontrolowania komórek oraz ich interakcji.

Oprócz tych narzędzi we współpracy z globalną społecznością naukową laboratorium stosuje je do analizowania chorób ludzkich, takich jak COVID-19, metodycznie łącząc cechy komórkowe i obserwacje kliniczne. Główne obszary zainteresowania obejmują: jak: komórki odpornościowe koordynują zrównoważone reakcje na stres środowiskowy; interakcje komórka gospodarza z patogenem ewoluują podczas infekcji; [ nadmierna liczba cytatów ] i komórki nowotworowe unikają leczenia terapeutycznego i naturalnej odporności.

Na podstawie tych i innych obserwacji laboratorium ma na celu zrozumienie, w jaki sposób choroba zmienia funkcjonowanie tkanek na poziomie komórkowym, oraz wdrożenie interwencji terapeutycznych i profilaktycznych w celu przywrócenia lub wsparcia zdrowia ludzkiego.

Wybierz wyróżnienia i nagrody

2019-20 Nagroda Wydziału za osiągnięcia Harolda E. Edgertona 2020

Nagroda Młodego Mentora, Harvard Medical School , 2020

Stypendysta Pew-Stewart, Pew Charitable Trust Charitable Trust, 2018 – 2022

Sloan Research Fellow in Chemistry, Alfred P. Sloan Foundation , 2018 – 2020

Profesura rozwoju kariery firmy Pfizer-Laubach, MIT, 2017–2020

Asystent doradcy naukowego, medycyna translacyjna nauki, 2016

Nagroda Dyrektora NIH dla Nowego Innowatora , 2015-2020

Beckman Young Investigators Award Fundacja Arnolda i Mabel Beckmanów, 2015 – 2019

Program Searle Scholars , Kinship Foundation, 2015 – 2018

Pierwsze miejsce w konkursie „Follow That Cell” (członek zespołu), NIH, 2015

Hermann LF von Helmholtz Career Development Professor, MIT, 2014 – 2016

Excellence Award, Broad Institute of Harvard i MIT, 2013

Nagroda Dudleya R. Herschbacha za nauczanie, Uniwersytet Harvarda, 2006

Absolwent stypendium badawczego, NSF, 2005 – 2008

Dyplom z wyróżnieniem w nauczaniu, Uniwersytet Harvarda, 2005

Phi Beta Kappa, Columbia University, 2004

John Jay Scholar, Columbia University, 2000 – 2004

Wybierz publikacje

  • Huang, Siyi i in. (2021-01-21). „Węzły chłonne są unerwione przez unikalną populację neuronów czuciowych o potencjale immunomodulującym”. komórka . 184 (2): 441–459.e25
  • Zieglera, CGK i in. (2020-05-28). „Receptor SARS-CoV-2 ACE2 jest genem stymulowanym interferonem w ludzkich komórkach nabłonka dróg oddechowych i jest wykrywany w określonych podzbiorach komórek w tkankach”, Cell, 181, 1016 (2020).
  • Hughes, Travis K. i in. (2020-10-13). „Masowo równoległe scRNA-Seq oparte na syntezie drugiej nici ujawnia stany komórkowe i cechy molekularne ludzkich patologii zapalnych skóry”. Odporność . 53 (4): 878–894.e7.
  • Kotliar, Dylan i in. (2020-11-25). „Profilowanie pojedynczej komórki choroby wirusa Ebola in vivo ujawnia dynamikę wirusa i gospodarza” . komórka . 183 (5): 1383–1401.e19.
  • Kazer, Samuel W. i in. (2020-04). „Zintegrowana analiza pojedynczych komórek wielokomórkowej dynamiki immunologicznej podczas nadostrego zakażenia HIV-1”. Medycyna natury . 26 (4): 511–518.
  • Smillie, C.# i in. (2019). „Wewnątrz- i międzykomórkowe ponowne okablowanie ludzkiej okrężnicy podczas wrzodziejącego zapalenia jelita grubego” Cell , 178 , 714 (2019).
  • Ordovas-Montanes, J. i in. (2018). „Zmniejszona różnorodność komórkowa i zmieniony podstawowy stan komórek progenitorowych informują o dysfunkcji bariery nabłonkowej w odporności człowieka typu 2”, Nature , 560 , 649 (2018).
  • Martin-Gayo, E. i in. (2018). „Racjonalne ramy modulowania zachowań immunologicznych zespołu zainspirowane elitarną kontrolą HIV-1”, Genome Biol. , 19 , 10 (2018).
  • TM Gierahn i in. (2017) „Seq-Well: przenośna, niedroga platforma do jednokomórkowego RNA-Seq próbek o niskim poziomie wejściowym”. Natura Meth . 14 (2017): 395.
  • I.Tirosz i in. (2017) „Analiza wielokomórkowego ekosystemu przerzutowego czerniaka za pomocą pojedynczej komórki RNA-seq”. Nauka 352.6282 (2016): 189-96.
  • EZ Macosko i in. (2015). „Profilowanie ekspresji w całym genomie tysięcy pojedynczych komórek przy użyciu nanolitrowych kropelek”. Komórka 161 (2015): 1202-14.
  • AK Shalek i in. (2014). „Sekwencja jednokomórkowego RNA na dużą skalę ujawnia strategie regulacji dynamicznej zmienności między komórkami poprzez sygnalizację parakrynną”. Natura 510 (2014): 363.
  • AK Shalek i in. (2013). „Transkryptomika jednokomórkowa ujawnia bimodalność w ekspresji i splicingu w komórkach odpornościowych”. Przyroda 498 (2013): 236-40.
  • N. Yosef i in. (2013). „Dynamiczna sieć regulacyjna kontrolująca różnicowanie komórek Th17”. Przyroda 496 (2013): 461-68.
  1. Bibliografia _ _ shaleklab.com . Źródło 2020-10-30 .
  2. Bibliografia     _ Jorgolli, Marsela; Shalek, Alex K.; Yoon, Myung-Han; Gertner, Rona S.; Park, Hongkun (marzec 2012). „Pionowe macierze elektrod z nanoprzewodów jako skalowalna platforma do wewnątrzkomórkowego łączenia z obwodami neuronalnymi” . Natura Nanotechnologia . 7 (3): 180–184. Bibcode : 2012NatNa...7..180R . doi : 10.1038/nnano.2011.249 . ISSN 1748-3395 . PMC 4209482 . PMID 22231664 .
  3. ^ a b     Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Adiconis, Xian; Gertner, Rona S.; Gaublomme, Jellert T.; Raychowdhury, Raktima; Schwartz, Schraga; Józef, Nir; Malboeuf, Krystyna; Lu, Diana; Trombetta, John J. (czerwiec 2013). „Transkryptomika jednokomórkowa ujawnia bimodalność w ekspresji i splicingu w komórkach odpornościowych” . Natura . 498 (7453): 236–240. Bibcode : 2013Natur.498..236S . doi : 10.1038/natura12172 . ISSN 1476-4687 . PMC 3683364 . PMID 23685454 .
  4. ^ a b     Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Shuga, Joe; Trombetta, John J.; Gennert, Dave; Lu, Diana; Chen, Peilin; Gertner, Rona S.; Gaublomme, Jellert T.; Józef, Nir; Schwartz, Schraga (czerwiec 2014). „Seq pojedynczej komórki RNA ujawnia dynamiczną parakrynną kontrolę zmienności komórkowej” . Natura . 510 (7505): 363–369. Bibcode : 2014Natur.510..363S . doi : 10.1038/natura13437 . ISSN 1476-4687 . PMC 4193940 . PMID 24919153 .
  5. ^ abcd Gierahn , Todd M     .; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Bryson, Bryan D.; Butler, Andrzej; Satija, Rahul; Szczęście, Saro; Miłość, J. Christopher; Shalek, Alex K. (kwiecień 2017). „Seq-Well: przenośne, tanie sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek przy dużej przepustowości” . Metody natury . 14 (4): 395–398. doi : 10.1038/nmeth.4179 . hdl : 1721.1/113430 . ISSN 1548-7105 . PMC 5376227 . PMID 28192419 .
  6. ^ „Szeroko dostępne sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek” . Wiadomości z MIT | Instytut Technologii Massachusetts . Źródło 2021-02-17 .
  7. ^ ab Macosko     , Evan Z.; Basu, Anindita; Satija, Rahul; Nemesz, Jakub; Szekhar, Karthik; Goldman, Melissa; Tirosh, Włochy; Białas, Allison R.; Kamitaki, Nolan; Martersteck, Emily M.; Trombetta, John J. (21.05.2015). „Wysoce równoległe profilowanie ekspresji poszczególnych komórek w całym genomie przy użyciu nanolitrowych kropelek” . komórka . 161 (5): 1202–1214. doi : 10.1016/j.cell.2015.05.002 . ISSN 0092-8674 . PMC 4481139 . PMID 26000488 .
  8. ^ a b c d e f     Hughes, Travis K.; Wadsworth, Marc H.; Gierahn, Todd M.; Zrób, Tran; Weiss, Dawid; Andrade, Priscila R.; Mam, Feiyang; Silva, Bruno J. de Andrade; Shao, Shuai; Tsoi, Lam C.; Ordovas-Montanes, Jose (2020-10-13). „Masowo równoległe scRNA-Seq oparte na syntezie drugiej nici ujawnia stany komórkowe i cechy molekularne ludzkich patologii zapalnych skóry” . Odporność . 53 (4): 878–894.e7. doi : 10.1016/j.immuni.2020.09.015 . ISSN 1074-7613 . PMC 7562821 . PMID 33053333 .
  9. ^ a b c d     Kazer, Samuel W.; Aicher, Toby P.; Muema, Daniel M.; Carroll, Shaina L.; Ordovas-Montanes, Jose; Miao, Vincent N.; Tu, Ang A.; Ziegler, Carly GK; Nyquist, Sarah K.; Wong, Emily B.; Ismail, Nasreen (kwiecień 2020). „Zintegrowana analiza jednokomórkowa wielokomórkowej dynamiki immunologicznej podczas nadostrego zakażenia HIV-1” . Medycyna natury . 26 (4): 511–518. doi : 10.1038/s41591-020-0799-2 . ISSN 1546-170X . PMC 7237067 . PMID 32251406 .
  10. ^ a b c d     Kotliar, Dylan; Lin, Aaron E.; Logue, James; Hughes, Travis K.; Khoury, Nadine M.; Raju, Siddharth S.; Wadsworth, Marc H.; Chen, Han; Kurtz, Jonathan R.; Dighero-Kemp, Bonnie; Bjornson, Zach B. (25.11.2020). „Profilowanie pojedynczej komórki wirusa Ebola w warunkach in vivo ujawnia dynamikę wirusa i gospodarza” . komórka . 183 (5): 1383–1401.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.10.002 . ISSN 0092-8674 . PMC 7707107 . PMID 33159858 .
  11. ^     Genshaft, Alex S.; Li, Shuqiang; Galant, Caroline J.; Darmanis, Spyros; Prakadan, Sanjay M.; Ziegler, Carly GK; Lundberg, Martin; Fredriksson, Szymon; Hong, Joyce; Regew, Awiw; Livak, Kenneth J. (2016-09-19). „Multipleksowe, ukierunkowane profilowanie proteomów i transkryptomów jednokomórkowych w jednej reakcji” . Biologia genomu . 17 (1): 188. doi : 10.1186/s13059-016-1045-6 . ISSN 1474-760X . PMC 5027636 . PMID 27640647 .
  12. ^     Kimmerling, Robert J.; Lee Szeto, Gregory; Li, Jennifer W.; Genshaft, Alex S.; Kazer, Samuel W.; Płatnik, Kristofor R.; de Riba Borrajo, Jakub; Blainey, Paul C.; Irvine, Darrell J.; Shalek, Alex K.; Manalis, Scott R. (2016-01-06). „Platforma mikroprzepływowa umożliwiająca jednokomórkowe sekwencjonowanie RNA wielopokoleniowych linii” . Komunikacja natury . 7 (1): 10220. Bibcode : 2016NatCo...710220K . doi : 10.1038/ncomms10220 . ISSN 2041-1723 . PMC 4729820 . PMID 26732280 .
  13. ^     Tu, Ang A .; Gierahn, Todd M.; Monian, Brinda; Morgan, Duncan M.; Mehta, Naveen K.; Ruiter, Bert; Shreffler, Wayne G.; Shalek, Alex K.; Miłość, J. Christopher (grudzień 2019). „Sekwencjonowanie TCR w połączeniu z masowo równoległymi sekwencjami 3′ RNA ujawnia klonotypowe sygnatury komórek T” . Immunologia przyrody . 20 (12): 1692–1699. doi : 10.1038/s41590-019-0544-5 . ISSN 1529-2916 . PMC 7528220 . PMID 31745340 .
  14. ^     Galen, Peter van; Hovestadt, Volker; II, Marc H. Wadsworth; Hughes, Travis K.; Griffin, Gabriel K.; Battaglia, Sofia; Verga, Julia A.; Stephansky, Jason; Pastika, Timothy J.; Historia, Jennifer Lombardi; Pinkus, Geraldine S. (2019-03-07). „Single-Cell RNA-Seq ujawnia hierarchie AML istotne dla progresji choroby i odporności” . komórka . 176 (6): 1265–1281.e24. doi : 10.1016/j.cell.2019.01.031 . ISSN 0092-8674 . PMC 6515904 . PMID 30827681 .
  15. ; ^ abc Tirosh , Włochy     Izar, Beniamin; Prakadan, Sanjay M.; Wadsworth, Marc H.; Traktat, Daniel; Trombetta, John J.; Rotem, Asaf; Rodman, Krzysztof; Lian, Krystyna; Murphy, George; Fallahi-Sichani, Mohammad (2016-04-08). „Analiza wielokomórkowego ekosystemu przerzutowego czerniaka za pomocą jednokomórkowego RNA-seq” . nauka . 352 (6282): 189–196. Bibcode : 2016Sci...352..189T . doi : 10.1126/science.aad0501 . ISSN 0036-8075 . PMC 4944528 . PMID 27124452 .
  16. ^     Lohr, Jens G.; Adalsteinsson, Wiktor A.; Cibulskis, Krystian; Choudhury, Atish D.; Rosenberg, Mara; Cruz-Gordillo, Piotr; Franciszek, Joshua M.; Zhang, Cheng-Zhong; Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Trombetta, John J. (maj 2014). „Sekwencjonowanie całego egzomu krążących komórek nowotworowych zapewnia wgląd w raka prostaty z przerzutami” . Biotechnologia przyrody . 32 (5): 479–484. doi : 10.1038/nbt.2892 . ISSN 1546-1696 . PMC 4034575 . PMID 24752078 .
  17. ^ a b     Patel, Anoop P .; Tirosh, Włochy; Trombetta, John J.; Shalek, Alex K.; Gillespie, Shawn M.; Wakimoto, Hiroaki; Cahill, Daniel P.; Nahed, Brian V.; Curry, William T.; Martuza, Robert L.; Louis, David N. (20.06.2014). „Seq jednokomórkowego RNA podkreśla heterogeniczność wewnątrz guza w pierwotnym glejaku” . nauka . 344 (6190): 1396–1401. Bibcode : 2014Sci...344.1396P . doi : 10.1126/science.1254257 . ISSN 0036-8075 . PMC 4123637 . PMID 24925914 .
  18. ^ a b     Hamza, Baszar; Ng, Sheng Rong; Prakadan, Sanjay M.; Delgado, Francisco Feijó; Podbródek, Christopher R.; Król, Emily M.; Yang, Lucy F.; Davidson, Shawn M.; DeGouveia, Kelsey L.; Cermak, Nathan; Navia, Andrew W. (2019-02-05). „Optofluidyczny sorter komórek w czasie rzeczywistym do podłużnych badań CTC w mysich modelach raka” . Obrady Narodowej Akademii Nauk . 116 (6): 2232–2236. Bibcode : 2019PNAS..116.2232H . doi : 10.1073/pnas.1814102116 . ISSN 0027-8424 . PMC 6369805 . PMID 30674677 .
  19. ^ ab Kimmerling     , Robert J.; Prakadan, Sanjay M.; Gupta, Alejandro J.; Calistri, Nicholas L.; Stevens, Mark M.; Olcum, Selim; Cermak, Nathan; Drake, Riley S.; Pelton, Krystyna; De Smet, Frederik; Ligon, Keith L. (2018-11-27). „Łączenie pomiarów masy, tempa wzrostu i ekspresji genów pojedynczych komórek” . Biologia genomu . 19 (1): 207. doi : 10.1186/s13059-018-1576-0 . ISSN 1474-760X . PMC 6260722 . PMID 30482222 .
  20. ^ ab Ziegler, Carly     GK; Allon, Samuel J.; Nyquist, Sarah K.; Mbano, Ian M.; Miao, Vincent N.; Tzouanas, Konstantyn N.; Cao, Yuming; Yousif, Ashraf S.; Bale, Julia; Hauser, Blake M.; Feldman, Jared (28.05.2020). „Receptor SARS-CoV-2 ACE2 jest genem stymulowanym interferonem w ludzkich komórkach nabłonka dróg oddechowych i jest wykrywany w określonych podzbiorach komórek w tkankach” . komórka . 181 (5): 1016–1035.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.04.035 . ISSN 0092-8674 . PMC 7252096 . PMID 32413319 .
  21. ^ a b   Gideon, Hannah P .; Hughes, Travis K.; Wadsworth, Marc H.; Tu, Ang Andy; Gierahn, Todd M.; Hopkins, Forrest F.; Wei, Jun-Rong; Kummerlowe, Conner; Grant, Nicole L.; Nargan, Kievershen; Phuah, JiaYao (26.10.2020). „Profilowanie pojedynczych komórek ziarniniaków płucnych gruźlicy ujawnia funkcjonalne sygnatury limfocytów kontroli bakteryjnej” . bioRxiv : 2020.10.24.352492. doi : 10.1101/2020.10.24.352492 . S2CID 226229228 .
  22. ^ ab Waldman     , Benjamin S.; Schwarz, Dominik; Wadsworth, Marc H.; Saeij, Jeroen P.; Shalek, Alex K.; Lourido, Sebastian (23.01.2020). „Identyfikacja głównego regulatora różnicowania w toksoplazmie” . komórka . 180 (2): 359–372.e16. doi : 10.1016/j.cell.2019.12.013 . ISSN 0092-8674 . PMC 6978799 . PMID 31955846 .
  23. ^ ab Darrah, Patricia     A.; Zeppa, Józef J.; Maiello, Paulina; Hackney, Joshua A.; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Pokkali, Suprija; Swanson, Phillip A.; Grant, Nicole L.; Rodgers, Mark A.; Kamath, Megha (styczeń 2020). „Zapobieganie gruźlicy u makaków po dożylnej immunizacji BCG” . Natura . 577 (7788): 95–102. Bibcode : 2020Natur.577...95D . doi : 10.1038/s41586-019-1817-8 . ISSN 1476-4687 . PMC 7015856 . PMID 31894150 .
  24. ^     Ranasinghe, Srinika; Lamothe, Pedro A.; Soghoian, Damien Z.; Kazer, Samuel W.; Cole, Michael B.; Shalek, Alex K.; Józef, Nir; Jones, R. Brad; Donaghey, Wiara; Nwonu, Chioma; Jani, Priya (2016-10-18). „Przeciwwirusowe komórki T CD8 + ograniczone przez ludzki antygen leukocytarny klasy II istnieją podczas naturalnej infekcji HIV i wykazują ekspansję klonalną” . Odporność . 45 (4): 917–930. doi : 10.1016/j.immuni.2016.09.015 . ISSN 1074-7613 . PMC 5077698 . PMID 27760342 .
  25. ^ ab Raghavan   , Srivatsan; Zima, Piotr S.; Navia, Andrew W.; Williams, Hannah L.; DenAdel, Alan; Kalekar, Radha L.; Galvez-Reyes, Jennyfer; Dolny, Kristen E.; Mulugeta, Nolawit; Raghavan, Manisha S.; Borah, Ashir A. (2020-08-25). „Transkrypcyjny przesłuch mikrośrodowiskowy specyficzny dla podtypu i plastyczność komórek nowotworowych w przerzutowym raku trzustki” . bioRxiv : 2020.08.25.256214. doi : 10.1101/2020.08.25.256214 . S2CID 221355597 .
  26. ^ abc Martin- Gayo ; , Enrique     Cole, Michael B.; Kolb, Kellie E.; Ouyang, Zhengyu; Cronin, Jacqueline; Kazer, Samuel W.; Ordovas-Montanes, Jose; Lichterfeld, Maciej; Walker, Bruce D.; Józef, Nir; Shalek, Alex K. (2018-01-29). „Ramy obliczeniowe oparte na odtwarzalności identyfikują indukowalny, wzmocniony stan przeciwwirusowy w komórkach dendrytycznych od elitarnych kontrolerów HIV-1” . Biologia genomu . 19 (1): 10. doi : 10.1186/s13059-017-1385-x . ISSN 1474-760X . PMC 5789701 . PMID 29378643 .
  27. ^     Kløverpris, Henrik N.; Kazer, Samuel W.; Mjösberg, Jenny; Mabuka, Jenniffer M.; Wellmann, Amanda; Ndhlovu, Zaza; Yadon, Marisa C.; Nhamoyebonde, pasterz; Münchhoff, Maksymilian; Simoni, Yannick; Andersson, Frank (2016-02-16). „Wrodzone komórki limfatyczne są nieodwracalnie wyczerpane podczas ostrej infekcji HIV-1 przy braku supresji wirusa” . Odporność . 44 (2): 391–405. doi : 10.1016/j.immuni.2016.01.006 . ISSN 1074-7613 . PMC 6836297 . PMID 26850658 .
  28. ^ abc Ordovas ; -Montanes, Jose     Dwyer, Daniel F.; Nyquist, Sarah K.; Buchheit, Kathleen M.; Vukovic, Marko; Deb, Chaarushena; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Kazer, Samuel W.; Yoshimoto, Eri; Cahill, Katherine N. (sierpień 2018). „Alergiczna pamięć zapalna w ludzkich komórkach progenitorowych nabłonka oddechowego” . Natura . 560 (7720): 649–654. Bibcode : 2018Natur.560..649O . doi : 10.1038/s41586-018-0449-8 . hdl : 1721.1/122932 . ISSN 1476-4687 . PMC 6133715 . PMID 30135581 .
  29. ^ abc Smillie , Christopher     S.; Biton, Mosze; Ordovas-Montanes, Jose; Sullivan, Keri M.; Burgin, Łaska; Graham, Daniel B.; Herbst, Rebecca H.; Rogel, Noga; Ślizgon, Michał; Waldman, Julia; Sud, Malika (2019-07-25). „Wewnątrz- i międzykomórkowe ponowne okablowanie ludzkiej okrężnicy podczas wrzodziejącego zapalenia jelita grubego” . komórka . 178 (3): 714–730.e22. doi : 10.1016/j.cell.2019.06.029 . ISSN 0092-8674 . PMC 6662628 . PMID 31348891 .
  30. ^ „Technika identyfikuje komórki T przygotowane na określone alergie lub infekcje: Naukowcy opracowują metodę izolowania i sekwencjonowania RNA komórek T, które reagują na określony cel” . ScienceDaily . Źródło 2021-02-17 .
  31. ^    Majumder, Partha P.; Mhlanga, Musa M.; Shalek, Alex K. (październik 2020). „Atlas komórek ludzkich i równość: wyciągnięte wnioski” . Medycyna natury . 26 (10): 1509–1511. arXiv : 2010.16154 . doi : 10.1038/s41591-020-1100-4 . ISSN 1546-170X . PMID 33029017 .
  32. ^ „Naukowcy identyfikują komórki, które prawdopodobnie są celem wirusa Covid-19” . Wiadomości z MIT | Instytut Technologii Massachusetts . Źródło 2021-02-17 .
  33. ^ „Do płuc i dalej” . hms.harvard.edu . Źródło 2021-02-17 .
  34. ^ a b     Huang, Siyi; Ziegler, Carly GK; Austin, John; Mannoun, Najat; Vukovic, Marko; Ordovas-Montanes, Jose; Shalek, Alex K.; Andrian, Ulrich H. von (21.01.2021). „Węzły chłonne są unerwione przez unikalną populację neuronów czuciowych o potencjale immunomodulacyjnym” . komórka . 184 (2): 441–459.e25. doi : 10.1016/j.cell.2020.11.028 . ISSN 0092-8674 . PMC 9612289 . PMID 33333021 .
  35. Bibliografia     _ Suárez-Fariñas, Mayte; Izar, Beniamin; Prakadan, Sanjay; Dannenfelser, Ruth; Tirosh, Włochy; Liu, Yong; Zhu, Qian; Devi, K. Sanjana P.; Carroll, Shaina L.; Chau, David (2017-06-29). „Homeostaza tkankowo-immunologiczna zależna od IFNγ jest dokooptowana w mikrośrodowisku guza” . komórka . 170 (1): 127–141.e15. doi : 10.1016/j.cell.2017.06.016 . ISSN 0092-8674 . PMC 5569303 . PMID 28666115 .
  36. ^ „Alex Shalek zdobywa nagrodę Wydziału Edgertona” . Wiadomości z MIT | Instytut Technologii Massachusetts . Źródło 2020-12-11 .
  37. ^ „Doskonałość w nagrodach mentorskich” . Biuro ds. Włączenia Różnorodności i Partnerstwa Społecznościowego w Harvard Medical School . Źródło 2020-12-11 .
  38. ^ „Shalek mianowany 2018 Pew-Stewart Scholar for Cancer Research - MIT Department of Chemistry” . Źródło 2020-12-11 .
  39. ^ „Profesor IMS Alex Shalek wygrywa stypendium Sloan Research Fellowship 2018” . Instytut Inżynierii i Nauki Medycznej . 2018-02-15 . Źródło 2021-02-09 .
  40. ^ „Alex Shalek mianowany profesorem rozwoju kariery Pfizer-Laubach - Shalek Lab” . shaleklab.com . Źródło 2020-12-11 .
  41. ^ „Poprzednie ASA | Medycyna translacyjna nauki” . stm.sciencemag.org . Źródło 2021-02-17 .
  42. ^ „Shalek otrzymał nagrodę NIH New Innovator Award” . Ragon Institute of MGH, MIT i Harvard . 2015-10-06 . Źródło 2020-12-11 .
  43. Wikimedia Commons znajdują się multimedia związane z Alex Shalek . Fundacja Arnolda i Mabel Beckmanów . Źródło 2020-12-11 .
  44. Wikimedia Commons znajdują się multimedia związane z Alex Shalek . Program Searle Scholars . Źródło 2020-12-11 .
  45. ^ a b c d e f g h „Alex K. Shalek” . Instytut Inżynierii i Nauki Medycznej . Źródło 2021-02-09 .
  46. ^     Josef, Nir; Shalek, Alex K.; Gaublomme, Jellert T.; Jin, Hulin; Lee, Youjin; Awasthi, Amit; Wu, Chuan; Karwacz, Katarzyna; Xiao, Sheng; Jorgolli, Marsela; Gennert, David (kwiecień 2013). „Dynamiczna sieć regulatorowa kontrolująca różnicowanie komórek TH 17” . Natura . 496 (7446): 461–468. Bibcode : 2013Natur.496..461Y . doi : 10.1038/natura11981 . ISSN 1476-4687 . PMC 3637864 . PMID 23467089 .

Linki zewnętrzne