Atlas genetyki i cytogenetyki w onkologii i hematologii
| Treść | |
|---|---|
| Opis | Atlas jest recenzowanym internetowym czasopismem / encyklopedią / bazą danych w otwartym dostępie, zajmującą się chromosomami, genami i nowotworami oraz biologią normalnych i nowotworowych komórek . |
| Przechwycone typy danych |
Adnotacja na temat chromosomów, genów i nowotworów |
| Organizmy | Człowiek |
| Różnorodny | |
| Wersjonowanie | Tak |
| Częstotliwość udostępniania danych |
co tydzień |
| Polityka kuracji | Tak – ręczny (ponad 10 000 stron) i automatyczny (30 000 stron). Artykuły z pełną recenzją a automatyczne adnotacje. |
Atlas genetyki i cytogenetyki w onkologii i hematologii , stworzony w 1997 roku przez Jeana-Loupa Hureta (z bioinformatyką Philippe'a Dessena), jest zbiorem zasobów dotyczących genów , anomalii chromosomowych , białaczek , guzów litych i chorób podatnych na raka . Projekt jest dostępny przez Internet i składa się z plików w stylu encyklopedycznym, a także tradycyjnych przeglądów, linków do stron internetowych i baz danych poświęconych nowotworom i/lub genetyce, opisów przypadków z hematologii . Obejmuje również elementy nauczania w różnych językach.
Począwszy od cytogenetyki w latach dziewiętnastych, Atlas łączy teraz różne rodzaje wiedzy w jednej witrynie internetowej: geny i ich funkcje, biologia komórki (np. apoptoza), dane patologiczne, choroby i ich implikacje kliniczne, cytogenetyka, ale także genetyka medyczna , z dziedzicznymi zaburzeniami związanymi ze zwiększonym ryzykiem raka. Daje to szerszy i bardziej globalny obraz genetyki raka, podczas gdy dane te są zwykle rozproszone. Zawiera dużą ikonografię około 35 000 obrazów. Dan van Dyke powiedział: „To jest punkt kompleksowej obsługi, który ujednolica informacje o genetyce raka”, a Lidia Larizza powiedziała, że Atlas jest „zasobem interdyscyplinarnym”. Felix Mitelman powiedział: „Ten systematyczny zbiór aberracji cytogenetycznych i genetycznych (…) wynik molekularny (…) i konsekwencje kliniczne (...) rozrósł się do prawdziwie monumentalnej encyklopedycznej pracy o wielkim znaczeniu”; Janet Rowley powiedziała: „W przyszłości bez wątpienia będę polegać na waszej witrynie, zamiast próbować samodzielnie nadążać za literaturą”
Atlas jest częścią projektu genomu i uczestniczy w badaniach nad epidemiologią raka . Dostęp do Atlasu mają: 1- naukowcy zajmujący się cytogenetyką , biologią molekularną , biologią komórki ; 2- klinicystów, hematologów, cytogenetyków, patologów, rzeczywiście ze szpitali uniwersyteckich, ale także ze szpitali ogólnych, gdzie Atlas jest jednym z rzadkich darmowych zasobów. Młodsi lekarze hematologii lub onkologii są również najbardziej otwarci na Atlas, który postrzegają jako narzędzie szkoleniowe i edukacyjne; 3-Studenci medycyny i nauk przyrodniczych.
W 2017 roku zawiera artykuły przeglądowe na temat 1500 genów, 700 artykułów na temat białaczek, 220 na temat guzów litych i 110 na temat chorób dziedzicznych ze skłonnością do raka oraz 110 „Deep Insights” na tematy pokrewne, 40 000 linków wewnętrznych i 730 000 linków zewnętrznych. Odpowiada to 45 000 „stron internetowych” (tj. około 200 000 wydrukowanych stron). Ponad 3300 autorów ma/wnosi swój wkład (1130 północnoamerykańskich, 400 francuskich, 300 włoskich, 200 japońskich, 180 hiszpańskich, 170 niemieckich, 160 angielskich, 140 chińskich itd.). Zawiera ikonografię około 35 000 obrazów.
W 2018 roku Jesús María Hernández Rivas (Salamanca, Hiszpania) i Paola Dal Cin (Boston, Massachusetts) dołączyli do Jean-Loup Hureta jako współredaktorzy naczelni, a w kwietniu 2021 roku Alessandro Beghini (Mediolan, Włochy) i João Agostinho Machado-Neto (São Paulo, Brazylia) zastępuje Jean-Loup Huret. „Po 25 latach budowania Atlasu dzień po dniu, Jean-Loup Huret i Philippe Dessen zrobią sobie mały odpoczynek”, jak czytamy na stronie internetowej.
Atlas jest również publikowany jako czasopismo naukowe przez CNRS i jest cytowany przez Scopus et Embase . Atlas jest wspierany finansowo przez towarzystwa naukowe, organizacje charytatywne oraz darowizny indywidualne. Więcej danych jest dostępnych na stronie stowarzyszenia odpowiedzialnego za Atlas.
Zobacz też
- Baza danych raka COSMIC
- Projekt bazy danych genomu Ensembl
- Gen Entreza
- GenBank
- Gene Wiki
- Komitet Nomenklatury Genów HUGO
- Międzynarodowa Agencja Badań nad Rakiem
- Międzynarodowa Klasyfikacja Chorób Onkologicznych
- Baza danych Mitelmana dotycząca aberracji chromosomowych i fuzji genów w raku
- Internetowe dziedziczenie mendlowskie u człowieka
- Przeglądarka genomu UCSC
- HONkod
Źródła
- Brooksbank, Cath (grudzień 2001). „Siekanie i zmiana” . Nature Recenzje Rak . 1 (3): 179. doi : 10.1038/35106056 . S2CID 29705598 .
Linki zewnętrzne
- Baza danych (atlasgeneticssoncology.org)
- Czasopismo naukowe (irevues.inist.fr/atlasgeneticssoncology)
- OxfordJournals.org
- w MedMatrixie