AvrPphB WRAŻLIWY 1

AvrPphB SUSCEPTIBLE 1/PBS1 to kinaza białkowa działająca na serynę i treoninę . Jest to podobna do receptora kinaza cytoplazmatyczna z podrodziny VII. Jest strażnikiem ODPORNOŚCI NA PSEUDOMONAS SYRINGAE 5/RPS5 . PBS1 jest cięty przez efektor AvrPphB, używany przez Pseudomonas syringae pv. phaseolicola , służąc jako wabik immunologiczny do sygnalizowania RPS5, że atak jest w toku, zgodnie z przeglądem Kourelis i in. 2016.

Historia ewolucyjna

Cele są pod tak dużą presją ze strony efektorów, że McDowell i Simon 2006 spodziewali się, że PBS1 doświadczy zróżnicowanej selekcji . Z niecierpliwością czekali na wyniki wskazujące na niewielkie powinowactwo sekwencji, całą rodzinę PBS1 i promieniowanie wśród potomnych gatunków roślin.

Jednak zaledwie kilka lat później Caldwell i Michelmore (2009) wykazali, że PBS1 jest jednym z najbardziej konserwatywnych białek we wszystkich roślinach kwitnących . Co więcej, odkryli, że jest tak rozpowszechniony, że musi mieć jeszcze nieodkrytą funkcję (funkcje): Występuje powszechnie nawet w taksonach bez osłony RPS5. Spekulują, że te inne funkcje są tak ważne, że PBS1 nie może w inny sposób przystosować się do efektorów - w ten sposób prawdopodobnie zrzucając presję ewolucyjną na strzegące go receptory powtórzeń wiążące nukleotydy, bogate w leucynę .

Odkryli również, że czyni to PBS1 jeszcze bardziej użytecznym modyfikowalnym wabikiem immunologicznym, ponieważ jest rozpoznawany przez szerszą gamę konwergentnie wyewoluowanych białek odpornościowych niż tylko RPS5.

ortologi

jeden model i wiele roślin gospodarczych ma wiele ortologów na genom:

• AtPBS1 - w modelu Arabidopsis thaliana

• AtPBS15 x Alanina - z wstawką 5- alaniny w celu wytworzenia rozwarcia w miejscu rozszczepienia, fałszywie naśladując ciągłe rozszczepianie przez efektor

• GmPBS1 - w Glycine max

• GmPBS1–1

• GmPBS1–15 x Alanina - takie same wyniki jak 5xAla At PBS1 powyżej

• GmPBS1SMV – przeciwko wirusowi mozaiki soi

• PBS1RCS2 - przeciwko efektorowi typu III AvrRpt2 wytwarzanemu przez P. syringae
• PBS1TCS – przeciwko proteazie Nla wytwarzanej przez wirusa wżerania tytoniu (TEV)
• PBS1TuMV - przeciwko proteazie Nla wytwarzanej przez wirusa mozaiki rzepy (TuMV)

Przyszłe badania

Od 2020 roku Indiana University (siedziba Pottingera i Innesa) ściga rodzinę patentów na system wabików RPS5-PBS1. Oczekuje się, że w przyszłości zmodyfikowane wabiki PBS1 staną się tańsze i łatwiejsze do wykonania w miarę ulepszania niepowiązanych technologii genetyki molekularnej. Ten system będzie można zastosować tylko przeciwko efektorom, które działają wewnątrz komórki gospodarza, ponieważ PBS1 nie znajduje się w żadnych lokalizacjach pozakomórkowych. Określenie struktury ZAR1 było przydatne w ogólnym zrozumieniu NLR, a informacje te będą nadal stosowane do zrozumienia i rozwoju PBS1.