BAT1

DDX39B
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, BAT1, D6S81E, UAP56, DEAD-box helicase 39B, DExD-box helicase 39B
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Helikaza spliceosomu RNA BAT1 jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen BAT1 .

Ten gen koduje członka rodziny DEAD box ATPaz zależnych od RNA , które pośredniczą w hydrolizie ATP podczas składania pre-mRNA . Kodowane białko jest niezbędnym czynnikiem splicingowym wymaganym do asocjacji małej jądrowej rybonukleoproteiny U2 z pre-mRNA , a także odgrywa ważną rolę w eksporcie mRNA z jądra do cytoplazmy . Klaster genów, BAT1-BAT5, jest zlokalizowany w pobliżu genów dla TNF alfa i TNF beta . Wszystkie te geny znajdują się w ludzkim głównego układu zgodności tkankowej klasy III . Mutacje w tym genie mogą być związane z reumatoidalnym zapaleniem stawów . Opisano alternatywne splicingowe warianty transkryptu kodujące to samo białko.

Linki zewnętrzne

Lokalizacja ludzkiego genomu DDX39B i strona szczegółów genu DDX39B w przeglądarce genomu UCSC .
PDBe-KB zawiera przegląd wszystkich informacji o strukturze dostępnych w PDB dla helikazy ludzkiego spliceosomu RNA DDX39B (BAT1)

Dalsza lektura

Spies T, Blanck G, Bresnahan M i in. (1989). „Nowa grupa genów w głównym kompleksie zgodności tkankowej człowieka”. nauka . 243 (4888): 214–7. Bibcode : 1989Sci...243..214S . doi : 10.1126/science.2911734 . PMID 2911734 .
Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (1994). „Oczyszczanie wysp CpG przy użyciu kolumny wiążącej metylowany DNA”. Nat. Genet . 6 (3): 236–44. doi : 10.1038/ng0394-236 . PMID 8012384 . S2CID 12847618 .
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Fleckner J, Zhang M, Valcárcel J, Zielony MR (1997). „U2AF65 rekrutuje nowe ludzkie białko DEAD box wymagane do interakcji U2 snRNP-branchpoint” . Geny Dev . 11 (14): 1864–72. doi : 10.1101/gad.11.14.1864 . PMID 9242493 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K i in. (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Allcock RJ, Price P, Gaudieri S i in. (1999). „Charakterystyka ludzkiego centralnego genu MHC, BAT1: struktura i ekspresja genomowa”. Do potęgi. Clin. Immunogenet . 16 (2): 98–106. doi : 10.1159/000019100 . PMID 10343160 . S2CID 22003689 .
Ota M, Katsuyama Y, Kimura A i in. (2001). „Drugi gen podatności na rozwój reumatoidalnego zapalenia stawów w ludzkim MHC jest zlokalizowany w telomerze interwału 70 kb genów TNF w regionie HLA klasy III”. Genomika . 71 (3): 263–70. doi : 10.1006/geno.2000.6371 . PMID 11170743 .
Allcock RJ, Williams JH, Cena P (2001). „Centralny gen MHC, BAT1, może kodować białko, które zmniejsza produkcję cytokin” . Komórki genów . 6 (5): 487–94. doi : 10.1046/j.1365-2443.2001.00435.x . PMID 11380625 . S2CID 10605522 .
Luo ML, Zhou Z, Magni K i in. (2001). „Składanie pre-mRNA i eksport mRNA połączone bezpośrednimi interakcjami między UAP56 i Aly”. Natura . 413 (6856): 644–7. Bibcode : 2001Natur.413..644L . doi : 10.1038/35098106 . PMID 11675789 . S2CID 4395388 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH i in. (2002). „Skierowana analiza proteomiczna jąderka ludzkiego” . bież. Biol . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Strässer K, Masuda S, Mason P i in. (2002). „TREX to konserwowana złożona transkrypcja sprzęgająca z eksportem informacyjnego RNA” . Natura . 417 (6886): 304–8. Bibcode : 2002Natur.417..304S . doi : 10.1038/natura746 . PMID 11979277 . S2CID 1112194 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
McCracken S, Longman D, Johnstone IL i in. (2004). „Ewolucyjnie zachowana rola SRm160 w przetwarzaniu 3'-końca, która działa niezależnie od tworzenia kompleksu złącza egzonowego” . J. Biol. chemia . 278 (45): 44153–60. doi : 10.1074/jbc.M306856200 . PMID 12944400 .
Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q i in. (2003). „Drożdżowe ekrany dwuhybrydowe sugerują udział białek anemii Fanconiego w regulacji transkrypcji, sygnalizacji komórkowej, metabolizmie oksydacyjnym i transporcie komórkowym”. Do potęgi. Rozdz . komórki 289 (2): 211–21. doi : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . PMID 14499622 .
Li J, Hawkins IC, Harvey CD i in. (2003). „Regulacja alternatywnego splicingu przez SRrp86 i jego białka oddziałujące” . Mol. Komórka. Biol . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK i in. (2003). „Sekwencja DNA i analiza ludzkiego chromosomu 6” . Natura . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003Natur.425..805M . doi : 10.1038/natura02055 . PMID 14574404 .
Lehner B, Semple JI, Brown SE i in. (2004). „Analiza dwuhybrydowego systemu drożdży o dużej przepustowości i jego zastosowanie do przewidywania funkcji białek wewnątrzkomórkowych kodowanych w ludzkim regionie MHC klasy III”. Genomika . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
Price P, Wong AM, Williamson D i in. (2004). „Polimorfizmy w pozycjach -22 i -348 w promotorze genu BAT1 wpływają na transkrypcję i wiązanie czynników jądrowych” . Szum. Mol. Genet . 13 (9): 967–74. doi : 10.1093/hmg/ddh113 . PMID 15028669 .