Barbary Wold

Barbary Wold
Alma Mater	Arizona State University (Tempe), Kalifornijski Instytut Technologiczny
Kariera naukowa
Pola	Biologia rozwojowa i genetyka, biologia systemowa
Instytucje	Instytut Beckmana, Kalifornijski Instytut Technologiczny
Praca dyplomowa	Badania transkryptów genów strukturalnych w zarodkach jeżowców i dorosłych tkankach (1978)
Doradca doktorski	Erica H. Davidsona
Doktoranci	Tracy Teal Ardem Patapoutian

Barbara J. Wold jest profesorem biologii molekularnej Bren, głównym badaczem Wold Lab w California Institute of Technology (Caltech) i głównym badaczem Functional Genomics Resource Center w Beckman Institute w Caltech . Wold był dyrektorem Instytutu Beckmana w Caltech od 2001 do 2011 roku.

Edukacja

Barbara Wold ukończyła licencjat z zoologii na Uniwersytecie Stanowym Arizony (Tempe) w 1973 roku. Zainspirowała ją praca laboratoryjna z profesorem zoologii Shelby Gerking i biologiem rozwojowym Jerrym Justusem oraz wykłady z profesorem emeritą Kathleen Church. Na ASU Wold zainteresował się zrozumieniem kodu informacyjnego, który reguluje ekspresję genów. Poznała także swojego męża, geofizyka Lawrence'a „Larry'ego” Burdicka.

Wold otrzymał tytuł doktora. w molekularnej biologii rozwojowej z California Institute of Technology (Caltech) w 1978 roku, badając strukturę genomu i regulację genów podczas rozwoju zarodka. została mianowana pracownikiem naukowym ze stopniem doktora w Columbia University College of Physicians and Surgeons. Tam opracowała metody oznaczania funkcji elementu cis-regulatorowego .

Kariera

Wolda w 1986 roku

W 1981 Wold powrócił do Caltech jako adiunkt na wydziale biologii. Tytuł profesora nadzwyczajnego uzyskała w 1988 r., a profesora zwyczajnego w 1996 r., piastując tę ​​funkcję do 2002 r. Od 2003 r. została Bren profesorem biologii molekularnej.

Wold pomógł założyć LK Whittier Gene Expression Center w Caltech w 1999 roku, wraz ze Stephenem Quake'em i Melem Simonem, współpracując z Human Genome Project . Brała również udział w tworzeniu Centrum Projektowania Obwodów Biologicznych w Caltech. Była doradcą Narodowych Instytutów Zdrowia i Departamentu Energii w zakresie genomiki.

Wold był dyrektorem Instytutu Beckmana w Caltech od 2001 do 2011 roku, zastępując dyrektora-założyciela Harry'ego B. Graya . Od 30 stycznia 2012 r. jej następcą na stanowisku dyrektora został David A. Tirrell .

Badania

Barbara Wold opublikowała ponad sześćdziesiąt artykułów z dziedziny biologii rozwoju i genetyki . W całej swojej karierze Wold koncentrowała się na badaniu architektury i logiki sieci regulacyjnych genów , starając się zrozumieć mechanizmy, które napędzają zmiany stanu komórki w rozwoju i różnicowaniu poszczególnych komórek. W szczególności zbadała, w jaki sposób te mechanizmy różnicowania są kodowane w DNA, a ponadto, w jaki sposób są one wykonywane poprzez transkrypcję.

Począwszy od niezróżnicowanych komórek prekursorowych, Wold i jej laboratorium skupili się szczególnie na przejściach od komórek mezodermalnych we wczesnym rozwoju do w pełni rozwiniętych mięśni szkieletowych i mięśnia sercowego u zwierząt, głównie za pomocą modeli mysich. Ponadto interesuje się przemianami w rozwoju komórek, które prowadzą do nowotworzenia .

Wold i jej laboratorium wykorzystali różne techniki, w tym testy całego genomu i proteomu, technologię genomową mokrej ławki i metody obliczeniowe, z których wiele opracowali we współpracy z innymi badaczami, w celu zbadania rozwoju, degeneracji i regeneracji mięśni szkieletowych . Wykorzystywała również takie techniki, jak analiza ekspresji genów na mikromacierzach, globalne pomiary interakcji białko/DNA, proteomika oparta na spektrometrii mas i genomika porównawcza. We współpracy z innymi, jej laboratorium zapoczątkowało również modyfikację spektrometrii mas i znakowanie epitopów o podwójnym powinowactwie, które umożliwia wydajną i dokładną klasyfikację kompleksów wielobiałkowych.

Wiele ostatnich prac Wolda koncentruje się na przetwarzaniu informacji biologicznych, opracowywaniu i stosowaniu nowych technik, takich jak ultrawysokoprzepustowe techniki sekwencjonowania DNA do obliczeniowego modelowania danych wejściowych i wyjściowych sieci genów. Zajmuje się badaniem rozwoju embrionalnego i regeneracji kręgowców, badaniem sieci transkrypcyjnych i wykorzystaniem genomiki porównawczej do modelowania genomów myszy, ludzi i psów. Ta praca prowadzi do lepszego zrozumienia bezpośredniej regulacji transkrypcji oraz mechanizmów potranskrypcyjnych i translacyjnych oraz ich pośrednictwa przez mikroRNA. Celem Wolda jest dogłębne zrozumienie projektowania obwodów biologicznych oraz mechanizmów genetyki i rozwoju komórek. W tym celu Wold stara się wykorzystać swoje badania, aby przyczynić się do rozwoju międzynarodowych referencyjnych transkryptomu i elementów regulatorowych.

Laboratorium Wolda zajmowało się ostatnio genomiką chorób człowieka. W szczególności badają choroby, takie jak choroba Alzheimera , rak i zaburzenia układu mięśniowo-szkieletowego .

Nagrody i wyróżnienia

• 2014, Nagroda dla wybitnych absolwentów School of Life Sciences (SOLS), Arizona State University
• 1983, Program Searle Scholars

Wybrane publikacje

•      Jingli A Zhang; Ali Mortazawi; Briana Williamsa; Barbara J Wold ; Ellen V. Rothenberg (1 kwietnia 2012). „Dynamiczne transformacje znakowania epigenetycznego całego genomu i kontroli transkrypcji ustalają tożsamość komórek T” . komórka . 149 (2): 467–482. doi : 10.1016/J.CELL.2012.01.056 . ISSN 0092-8674 . PMC 3336965 . PMID 22500808 . Wikidane Q42136153 .
•     Wen Zhou; Mary A. Yui; Briana Williamsa; Jina Yun; Barbara J Wold ; Długi Cai; Ellen V. Rothenberg (16 października 2019). „Analiza pojedynczej komórki ujawnia regulacyjną dynamikę ekspresji genów prowadzącą do zaangażowania linii we wczesny rozwój komórek T” . Systemy komórkowe . 9 (4): 321-337.e9. doi : 10.1016/J.CELS.2019.09.008 . ISSN 2405-4712 . PMID 31629685 . Wikidane Q90821356 .
•      Manolisa Kellisa ; Barbara Wold ; Michaela P. Snydera ; i in. (29 kwietnia 2014). „Definiowanie funkcjonalnych elementów DNA w ludzkim genomie” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 111 (17): 6131–8. Bibcode : 2014PNAS..111.6131K . doi : 10.1073/PNAS.1318948111 . ISSN 0027-8424 . PMC 4035993 . PMID 24753594 . Wikidane Q22066251 .