Beta-defensyna 2

DEFB4B
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie Human UniProt: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, DEFB4P,
zewnętrzne identyfikatory defensyny beta 4B
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj Człowiek

Beta-defensyna 2 (BD-2), znana również jako przeciwbakteryjny peptyd skórny 1 (SAP1), jest peptydem , który u ludzi jest kodowany przez gen DEFB4 (defensyna, beta 4) .

Ludzka beta-defensyna-2 (hBD-2) jest bogatym w cysteinę kationowym peptydem przeciwbakteryjnym o niskiej masie cząsteczkowej , niedawno odkrytym w zmienionej chorobowo skórze.

Struktura

hBD-2 jest białkiem, którego pierwszorzędową strukturę tworzą 64 aminokwasy. W stężeniach ≤2,4 mM hBD-2 jest monomerem. Struktura jest amfifilowa z nierównomiernym rozkładem ładunku dodatniego na powierzchni i zawiera kilka kluczowych elementów strukturalnych, w tym trójniciową, antyrównoległą warstwę beta z pasmami 2 i 3 w konformacji spinki do włosów beta . Określenie innych elementów konstrukcyjnych zależy od zastosowanej techniki. Gdy stosuje się krystalografię rentgenowską, można zaobserwować helisę alfa na N- końcu białka (kody PDB: , i ). Podczas korzystania z NMR ta alfa-helisa nie pojawia się (kod PDB: ), jednak tę strukturę określono przy użyciu skróconej wersji hBD-2, w której brakowało początkowych 4 aminokwasów i może być przyczyną rozbieżności.

Funkcjonować

Defensyny tworzą rodzinę bakteriobójczych i cytotoksycznych peptydów wytwarzanych przez neutrofile . Członkowie rodziny defensyn są bardzo podobni w sekwencji białek. Beta-defensyna 2 jest peptydem antybiotycznym, który jest lokalnie regulowany przez stan zapalny .

Ludzka beta-defensyna 2 jest wytwarzana przez wiele komórek nabłonka i wykazuje silne działanie przeciwdrobnoustrojowe przeciwko bakteriom Gram-ujemnym i Candida , ale nie przeciwko Gram-dodatniemu S. aureus . Spekulowano, że beta-defensyna 2 może przyczyniać się do rzadkości zakażeń Gram-ujemnych skóry i tkanki płucnej.

hBD-2 reprezentuje pierwszą ludzką defensynę, która jest wytwarzana po stymulacji komórek nabłonkowych przez kontakt z mikroorganizmami, takimi jak P. aeruginosa lub cytokinami, takimi jak TNF-alfa i IL-1 beta. Gen i białko HBD-2 ulegają lokalnej ekspresji w keratynocytach związanych ze zmianami zapalnymi skóry. Intrygujące jest spekulowanie, że HBD-2 jest dynamicznym składnikiem miejscowego nabłonkowego systemu obronnego skóry i dróg oddechowych, odgrywającym rolę w ochronie powierzchni przed infekcją i dostarczającym możliwego powodu, dla którego infekcje skóry i płuc bakteriami Gram-ujemnymi są raczej niespotykane.

Chociaż to białko nie ma żadnej aktywności przeciwbakteryjnej przeciwko bakteriom Gram-dodatnim, istnieją badania pokazujące, że istnieje synergia między hBD-2 a innymi białkami. Jednym z przykładów tego efektu synergistycznego jest epiP, białko wydzielane przez niektóre szczepy S. epidermidis . hBD2, trzymając się za ręce z epiP, jest w stanie zabić S. aureus , Gram-dodatnią bakterię odpowiedzialną za choroby człowieka.

Linki zewnętrzne

• Lokalizacja ludzkiego genomu DEFB4A i strona szczegółów genu DEFB4A w przeglądarce genomu UCSC .

Dalsza lektura

•   Weinberg A, Krisanaprakornkit S, Dale BA (1999). „Nabłonkowe peptydy przeciwdrobnoustrojowe: przegląd i znaczenie w zastosowaniach doustnych” . Krytyczne recenzje z biologii jamy ustnej i medycyny . 9 (4): 399–414. doi : 10.1177/10454411980090040201 . PMID 9825219 .
•   Schröder JM, Harder J (czerwiec 1999). „Ludzka beta-defensyna-2”. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 31 (6): 645–651. doi : 10.1016/S1357-2725(99)00013-8 . PMID 10404637 .
•    Bals R, Wang X, Wu Z, Freeman T, Bafna V, Zasloff M, Wilson JM (wrzesień 1998). „Ludzka beta-defensyna 2 jest wrażliwym na sól antybiotykiem peptydowym wyrażanym w ludzkich płucach” . Dziennik badań klinicznych . 102 (5): 874–880. doi : 10.1172/JCI2410 . PMC 508952 . PMID 9727055 .
•   Liu L, Wang L, Jia HP, Zhao C, Heng HH, Schutte BC, McCray PB, Ganz T (listopad 1998). „Struktura i mapowanie ludzkiego genu beta-defensyny HBD-2 i jego ekspresja w miejscach zapalenia”. gen . 222 (2): 237–244. doi : 10.1016/S0378-1119(98)00480-6 . PMID 9831658 .
•    Mathews M, Jia HP, Guthmiller JM, Losh G, Graham S, Johnson GK, Tack BF, McCray PB (czerwiec 1999). „Wytwarzanie peptydów przeciwdrobnoustrojowych beta-defensyny przez błonę śluzową jamy ustnej i gruczoły ślinowe” . Infekcja i odporność . 67 (6): 2740–2745. doi : 10.1128/IAI.67.6.2740-2745.1999 . PMC 96577 . PMID 10338476 .
•    Jia HP, Mills JN, Barahmand-Pour F, Nishimura D, Mallampali RK, Wang G, Wiles K, Tack BF, Bevins CL, McCray PB (wrzesień 1999). „Klonowanie molekularne i charakterystyka szczurzych genów kodujących homologi ludzkich beta-defensyn” . Infekcja i odporność . 67 (9): 4827–4833. doi : 10.1128/IAI.67.9.4827-4833.1999 . PMC96815 . _ PMID 10456937 .
•   Yang D, Chertov O, Bykovskaia SN, Chen Q, Buffo MJ, Shogan J, Anderson M, Schröder JM, Wang JM, Howard OM, Oppenheim JJ (październik 1999). „Beta-defensyny: łączenie odporności wrodzonej i nabytej poprzez CCR6 komórek dendrytycznych i T”. nauka . 286 (5439): 525–528. doi : 10.1126/science.286.5439.525 . PMID 10521347 .
•    Diament G, Kaiser V, Rhodes J, Russell JP, Bevins CL (styczeń 2000). „Regulacja transkrypcji ekspresji genów beta-defensyny w komórkach nabłonka tchawicy” . Infekcja i odporność . 68 (1): 113–119. doi : 10.1128/iai.68.1.113-119.2000 . PMC 97109 . PMID 10603376 .
•   Harder J, Meyer-Hoffert U, Teran LM, Schwichtenberg L, Bartels J, Maune S, Schröder JM (czerwiec 2000). „Śluzowata Pseudomonas aeruginosa, TNF-alfa i IL-1beta, ale nie IL-6, indukują ludzką beta-defensynę-2 w nabłonku dróg oddechowych” . American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology . 22 (6): 714–721. doi : 10.1165/ajrcmb.22.6.4023 . PMID 10837369 .
•   Hoover DM, Rajashankar KR, Blumenthal R, Puri A, Oppenheim JJ, Chertov O, Lubkowski J (październik 2000). „Struktura ludzkiej beta-defensyny-2 wskazuje na oligomeryzację wyższego rzędu” . Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32911–32918. doi : 10.1074/jbc.M006098200 . PMID 10906336 .
•   Meyer JE, Harder J, Görögh T, Schröder JM, Maune S (lipiec 2000). „[Ekspresja genu hBD-2 w błonie śluzowej nosa]”. Laryngo- Rhino- Otologie . 79 (7): 400–403. doi : 10.1055/s-2000-4626 . PMID 11005092 .
•   Ali RS, Falconer A, Ikram M, Bissett CE, Cerio R, Quinn AG (lipiec 2001). „Ekspresja antybiotyków peptydowych ludzkiej beta-defensyny-1 i ludzkiej beta-defensyny-2 w normalnej ludzkiej skórze” . The Journal of Investigative Dermatology . 117 (1): 106–111. doi : 10.1046/j.0022-202x.2001.01401.x . PMID 11442756 .
•    Carothers DG, Graham SM, Jia HP, Ackermann MR, Tack BF, McCray PB (2001). „Wytwarzanie peptydów przeciwdrobnoustrojowych beta-defensyny przez błonę śluzową zatok szczękowych”. American Journal of Rhinology . 15 (3): 175–179. doi : 10.2500/105065801779954238 . PMID 11453504 . S2CID 31583849 .
•   Biragyn A, Surenhu M, Yang D, Ruffini PA, Haines BA, Klyushnenkova E, Oppenheim JJ, Kwak LW (grudzień 2001). „Mediatory odporności wrodzonej, których celem są niedojrzałe, ale niedojrzałe komórki dendrytyczne, indukują odporność przeciwnowotworową, gdy są genetycznie połączone z nieimmunogennymi antygenami nowotworowymi” . Journal of Immunology . 167 (11): 6644–6653. doi : 10.4049/jimmunol.167.11.6644 . PMID 11714836 .
•    Bauer F, Schweimer K, Klüver E, Conejo-Garcia JR, Forssmann WG, Rösch P, Adermann K, Sticht H (grudzień 2001). „Określenie struktury ludzkich i mysich beta-defensyn ujawnia konserwację strukturalną przy braku znaczącego podobieństwa sekwencji” . Nauka o białkach . 10 (12): 2470–2479. doi : 10.1110/ps.24401 . PMC 2374044 . PMID 11714914 .
•    Takahashi A, Wada A, Ogushi K, Maeda K, Kawahara T, Mawatari K, Kurazono H, Moss J, Hirayama T, Nakaya Y (listopad 2001). „Wytwarzanie beta-defensyny-2 przez ludzkie komórki nabłonka okrężnicy indukowane przez białko strukturalne filamentu Salmonella enteritidis wici” . Listy FEBS . 508 (3): 484–488. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03088-5 . PMID 11728477 . S2CID 24925463 .
•   Schibli DJ, Hunter HN, Aseyev V, Starner TD, Wencek JM, McCray PB, Tack BF, Vogel HJ (marzec 2002). „Struktury roztworów ludzkich beta-defensyn prowadzą do lepszego zrozumienia silnej aktywności bakteriobójczej HBD3 przeciwko Staphylococcus aureus” . Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 8279–8289. doi : 10.1074/jbc.M108830200 . PMID 11741980 .