białka @ dom
 Wygaszacz ekranu Proteins@Home
| |
| System operacyjny | wieloplatformowy |
|---|---|
| Platforma | BOINC |
Protein@home był projektem komputerowym wolontariuszy , który wykorzystywał architekturę BOINC . Projekt był prowadzony przez Wydział Biologii École Polytechnique . Projekt rozpoczął się 28 grudnia 2006 r., a zakończył w czerwcu 2008 r.
Zamiar
Proteins@home był zakrojonym na dużą skalę projektem non-profit dotyczącym przewidywania struktury białek, wykorzystującym komputery wolontariuszy do wykonywania intensywnych obliczeń w krótkim czasie. Z ich strony internetowej:
Sekwencja aminokwasowa białka określa jego trójwymiarową strukturę, czyli „pofałdowanie”. I odwrotnie, trójwymiarowa struktura jest kompatybilna z dużym, ale ograniczonym zestawem sekwencji aminokwasowych. Wyliczanie dozwolonych sekwencji dla danego fałdu jest znane jako „problem odwrotnego fałdowania białka”. Pracujemy nad rozwiązaniem tego problemu dla dużej liczby znanych fałd białkowych (reprezentatywny podzbiór: około 1500 fałd). Najdroższym krokiem jest zbudowanie bazy danych funkcji energetycznych opisujących wszystkie te struktury. Dla każdej struktury rozważamy wszystkie możliwe sekwencje aminokwasów. Co zaskakujące, jest to wykonalne obliczeniowo, ponieważ nasze funkcje energetyczne są sumami par interakcji. Kiedy już to zrobimy, możemy w szybki i efektywny sposób eksplorować przestrzeń sekwencji aminokwasowych i zachować najkorzystniejsze sekwencje. To wielkoskalowe mapowanie przestrzeni sekwencji białek będzie miało zastosowanie do przewidywania struktury i funkcji białek, zrozumienia ewolucji białek i projektowania nowych białek. Przyłączając się do projektu, pomożesz zbudować bazę danych funkcji energetycznych i rozwinąć ważną dziedzinę nauki o potencjalnych zastosowaniach biomedycznych.
Zobacz też
Linki zewnętrzne