Ibercivis

Ibercivis
Logocivis.jpg
Ibercivis.gif
wygaszacz ekranu ibercivis
Deweloperzy Hiszpańska Narodowa Rada ds. Badań i Fundacja Ibercivis
Status rozwoju Nieaktywny
System operacyjny Międzyplatformowe
Platforma BOINC
Średnia wydajność 13.936 teraflopów
Aktywni użytkownicy 917
Całkowita liczba użytkowników 924
Aktywni gospodarze 2375
Wszystkich gospodarzy 2383
Strona internetowa boinc .ibercivis .es

Ibercivis była wolontariacką platformą komputerową , która umożliwia internautom udział w badaniach naukowych poprzez przekazanie niewykorzystanych cykli komputerowych do przeprowadzania symulacji naukowych i innych zadań. Pierwotny projekt, który rozpoczął działalność w 2008 r., był efektem współpracy naukowej między Portugalii i Hiszpanii , ale jest otwarty dla ogółu społeczeństwa i społeczności naukowej, zarówno na Półwyspie Iberyjskim , jak i poza nim . Nazwa projektu to kontaminacja Iberii oraz łacińskie słowo civis , oznaczające „ obywatel ”.

Hiszpańska Narodowa Rada ds. Badań ponownie uruchomiły wolontariuszy platformę obliczeniową w celu przeszukiwania istniejących leków pod kątem działania przeciwwirusowego przeciwko koronawirusowi zespołu ostrej ostrej niewydolności oddechowej 2 , czynnikowi wywołującemu pandemię COVID-19 .

Historia

Ibercivis został opracowany w Hiszpanii we współpracy z Instytutem Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych na Uniwersytecie w Saragossie , CIEMAT , CETA-CIEMAT, Hiszpańską Narodową Radą ds. Badań Naukowych (CSIC) i RedIris. Zadania projektu są wydawane przez różne ośrodki naukowe i technologiczne w Hiszpanii w celu stworzenia funkcjonalnej platformy do obliczeń naukowych opartych na wolontariacie. Projekt jest europejskim odpowiednikiem odnoszącej sukcesy amerykańskiej inicjatywy SETI@home i Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) ochotnicze projekty komputerowe.

Zivis z siedzibą na Uniwersytecie w Saragossie , rozpoczął działalność w 2007 r., a sam Ibercivis rozpoczął działalność w czerwcu 2008 r. Projekt Zivis był lokalną aplikacją komputerową ochotniczą, finansowaną przez ayuntamiento ( radę miejską) miasta Saragossa . Infrastruktura Ibercivis na większą skalę została wykorzystana do różnych zastosowań obliczeniowych, w tym do nad syntezą jądrową , fałdowaniem białek i symulacjami materiałów . W lipcu 2009 r. platforma Ibercivis została rozszerzona na Portugalię w wyniku porozumienia podpisanego przez rządy obu krajów podczas szczytu luso-hiszpańskiego, który odbył się w Zamora, Hiszpania , w styczniu 2009 r. Następnie kilka portugalskich instytucji połączyło się z Ibercivis, w tym Ministerstwo Nauki , Centrum Neuronauki i Biologii Komórkowej na Uniwersytecie w Coimbrze oraz eksperymentalne laboratorium fizyki wysokich energii LIP .

W kwietniu 2020 r. uruchomiono nowy projekt Ibercivis mający na celu wsparcie naukowców w walce z chorobą Coronavirus 2019 .

Liczba uczestników

W momencie powstania w czerwcu 2008 r. Ibercivis miał 3000 zarejestrowanych użytkowników obsługujących różne projekty. Do grudnia 2012 roku liczba ta wzrosła do ponad 19 800 w 124 krajach. W projekcie zarejestrowano około 55 000 indywidualnych urządzeń hostingowych, z których ponad 3600 było aktywnych tygodniowo.

W kwietniu 2020 r. w nowym powstaniu Ibercivis było 917 aktywnych użytkowników i 2375 aktywnych hostów.

Projektowanie

Ibercivis miał działać w nieskończoność i jest przeznaczony do jednoczesnego uruchamiania kilku aplikacji należących do różnych dyscyplin naukowych w sposób podobny do World Community Grid . Użytkownicy mogą wybrać, w których projektach chcą uczestniczyć za pośrednictwem strony internetowej projektu. Od maja 2020 r. Ibercivis obejmował osiem różnych aktywnych projektów:

Aktywne projekty

COVID-Phym : Sprawdź istniejące leki pod kątem działania przeciwwirusowego przeciwko koronawirusowi zespołu ostrej niewydolności oddechowej 2 , czynnikowi wywołującemu pandemię COVID-19 .

Zrealizowane projekty

Projekty Ibercivis, które zostały zakończone lub przerwane w maju 2020 r., obejmują:

  • Fuzja: gwiazda na ekranie : ta aplikacja pomogła naukowcom z Centrum Badawczego Środowiska i Technologii Energetycznych (CIEMAT) oraz Instytutu Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych (BIFI) przeprowadzić symulacje plazmy, która zostanie wyprodukowana w Międzynarodowym Eksperymentalny Reaktor Termojądrowy (ITER). Projekt ITER, który rozpocznie działalność w 2018 r., ma na celu urzeczywistnienie energii syntezy jądrowej , replikując warunki panujące na Ziemi typowo wewnątrz gwiazd .
  • Dokowanie: poszukiwanie leków przeciwnowotworowych : aplikacja Docking wspomagała poszukiwanie nowych leków poprzez symulację dokowania białek . Jednostka Bioinformatyki Centro de Biología Molecular Severo Ochoa ( CSIC -UAM) opracowała platformę umożliwiającą automatyczną symulację interakcji białek i małych cząsteczek. Jego celem było znalezienie skutecznych leków do leczenia poważnych chorób, takich jak rak .
  • Materiały: symulacja układów magnetycznych : aplikacja Materials pomogła fizykom z Universidad Complutense de Madrid , Universidad de Extremadura oraz Instytutu Biokomputacji i Fizyki Układów Złożonych w odkryciu, w jaki sposób zanieczyszczenia niemagnetyczne w materiałach magnetycznych modyfikują właściwości ich przejścia z stanu magnetycznego do stanu niemagnetycznego. Znajomość tych przejść jest ważna nie tylko z teoretycznego punktu widzenia, ale może również pomóc w rozwoju wielu dziedzin techniki , takich jak magnetyczne dyski twarde czy nadprzewodnictwo . materiały.
  • Nanoluz: światło w nanoskali : wiedza o tym, jak reaguje światło w skali nanometrowej , jest wyzwaniem naukowym o ważnych implikacjach dla konstruowania nowych materiałów, opracowywania nowych systemów komputerowych i komunikacyjnych oraz ulepszania technologii, takich jak panele słoneczne . Korzystając z aplikacji Nanoluz, naukowcy z Instytutu Optyki Daza Valdés CSIC badali zachowanie światła w nanocząstkach metali , starając się opracować systemy, które mogłyby uprościć analizę medyczną i biologiczną.
  • IberNet: zbadajmy wnętrze Ibercivis : w ramach tego projektu naukowcy starali się zbadać i przedstawić strukturę Ibercivis jako sieci społecznościowej i spróbować wyeksportować swoje wnioski do innych sieci społecznościowych, aby pomóc w badaniu i przewidywaniu dynamiki masowego środowisko.
  • Amiloid: poszukiwanie leków przeciw neurodegeneracyjnym chorobom amyloidowym : projekt AMILOIDE ma na celu przeszukiwanie bibliotek cyfrowych milionów związków w poszukiwaniu leków, które mogłyby zakłócać tworzenie się agregatów i włókien amyloidowych , co może prowadzić do chorób neurodegeneracyjnych . Obecnie głównymi badanymi chorobami docelowymi są rodzinna polineuropatia amyloidowa (FAP) i choroba Alzheimera . Za projekt odpowiadają naukowcy z Grupy Biologii Strukturalnej i Obliczeniowej w Centrum Neurobiologii i Biologii Komórki (CNC) Uniwersytetu w Coimbrze .
  • Neurosim: zanurzenie w molekularnej strukturze pamięci : naukowcy z Instytutu Struktury Materii CSIC wykorzystują wyniki aplikacji Neurosim do analizy właściwości strukturalnych aminokwasów i małych peptydów (sekwencje kilkudziesięciu aminokwasów), które działają w ludzkim mózgu i układzie nerwowym . Symulując tak zwany krajobraz energetyczny dla każdego aminokwasu, można wykonać kluczowe kroki w rekonstrukcji trójwymiarowej struktury białek z sekwencji aminokwasów, posuwając naprzód badania struktury i funkcji ludzkiego mózgu.
  • Adsorpcja: zachowanie płynów zamkniętych w ograniczonej przestrzeni : aplikacja Adsorption pomaga naukowcom z Instituto de Química-Física Rocasolano z CSIC badać właściwości adsorpcyjne glin filarowych, które są szeroko stosowane jako katalizatory przemysłowe , materiały do ​​magazynowania gazu i przemysłowe środki separujące . Ten rodzaj gliny jest wykorzystywany w procesach przemysłowych, takich jak produkcja biopaliw z olejów roślinnych , magazynowanie gazu ziemnego w temperaturze pokojowej oraz magazynowanie gazów cieplarnianych produkowane przez przemysł.
  • Cuanticables: symulacje drutów kwantowych : naukowcy z Uniwersytetu w Buenos Aires używają tej aplikacji do badania stopnia, w jakim wady materiału drutów kwantowych wpływają na ich prąd elektryczny . W tym celu opracowują model teoretyczny, który symuluje drut kwantowy, zanieczyszczenia i elektrody, z którymi łączy się drut kwantowy, oraz badają zachowanie prądu generowanego w przewodzie, gdy przyłożone jest do niego zewnętrzne napięcie.
  • Sanidad: ulepszona diagnostyka : promieniowanie jonizujące jest wykorzystywane w zastosowaniach zdrowotnych począwszy od podstawowych badań diagnostycznych w nowoczesnym szpitalu (w radiologii , medycynie nuklearnej i badaniach laboratoryjnych) po leczenie raka za pomocą radioterapii . Do tych celów wykorzystywane są zarówno rzeczywiste materiały radioaktywne (w postaci nasion lub materiału nadającego się do wstrzykiwania), jak i złożone urządzenia generujące wiązki fotonów i elektronów można wykorzystać. Fizycy z Andaluzji wykorzystują symulacje Sanidad do poszerzania wiedzy na temat bezpiecznego stosowania promieniowania w opiece zdrowotnej oraz do badania potencjalnych nowych zastosowań.
  • Criticalidad: transport elektronów w układach nieuporządkowanych o właściwościach fraktali : projekt Criticalidad pomaga meksykańskim badaczom zrozumieć właściwości i skutki fraktali w transporcie elektronów przez układy nieuporządkowane w przejściu Andersona .
  • Soluvel: badanie rozpuszczalności związków toksycznych i farmaceutycznych: celem projektu Soluvel jest obliczenie energii solwatacji niektórych rozpuszczalnych związków, aby określić za pomocą obliczeń, które związki mogą okazać się toksyczne dla ludzi, a które mogą służyć jako skuteczne leki. Projekt prowadzony jest przez naukowców z Laboratorium Symulacji Molekularnej Inżynierii Separacji i Reakcji (LSRE), oddziału Wydziału Inżynierii Uniwersytetu w Porto .
  • Primalidad: szukaj liczb pierwszych Wilsona: projekt „nauki obywatelskiej” otwarty dla wszystkich matematyków, aplikacja Primalidad wyszukuje następną liczbę pierwszą Wilsona - pierwsze trzy to 5, 13 i 563. Przypuszcza się, że czwarta liczba pierwsza Wilsona musi być większy niż 5 × 10 8 .

Zobacz też

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ibercivis&oldid=1134113798 ”