C1QBP

C1QBP
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, GHABP1, SF2p32, gC1Q-R, gC1qR, p32, składnik 1 dopełniacza, białko wiążące podskładnik q, białko wiążące C1q dopełniacza, COXPD33, SF2AP32
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko wiążące subskładnik dopełniacza 1 Q, mitochondrialne jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen C1QBP .

Podskładnik ludzkiego dopełniacza C1q łączy się z C1r i C1s w celu uzyskania pierwszego składnika układu dopełniacza surowicy. Wiadomo, że białko kodowane przez ten gen wiąże się z kulistymi głowami cząsteczek C1q i hamuje aktywację C1. Białko to zostało również zidentyfikowane jako podjednostka p32 czynnika splicingowego pre-mRNA SF2, jak również kwas hialuronowy .

Podjednostka białka

długość 282 aminokwasów i ma trzy homologiczne podjednostki z N-końcowymi 73 resztami aminokwasowymi odciętymi w celu wytworzenia dojrzałego C1QBP. C1QBP pojawia się jako monomer około 33 kDa na żelu SDS-PAGE zarówno w warunkach redukujących, jak i nieredukujących, ale migruje jako trimer w chromatografii wykluczania ze względu na wielkość (filtracja żelowa).

Struktura białka

Struktura krystaliczna C1QBP przy rozdzielczości 2,25 Å przedstawia homotrimeryczny pierścień wykazujący symetrię . Poszczególne podjednostki są utrzymywane razem przez oddziaływania niekowalencyjne i tworzą czwartorzędową strukturę w kształcie pączka z centralną wnęką o średnicy 20 Å. Każda podjednostka C1QBP ma siedem nici β (β1-β7) i trzy α-helisy (α1-α3). C1QBP jest naładowany ujemnie na swojej rozpuszczalnej stronie, podczas gdy powierzchnia membrany jest głównie naładowana dodatnio.

Interakcje

Wykazano, że C1QBP oddziałuje z kinazą białkową D1 , BAT2 , PRKCD , PKC alfa i kinazą białkową Mζ . Inni oddziałujący partnerzy C1QBP obejmują domeny białkowe z patogenów, takich jak bakterie, wirusy i Plasmodium falciparum. Wykazano, że białka osocza, w tym fibrynogen, FXII i HK, oddziałują z C1QBP w sposób zależny od cynku. Ostatnio wykazano, że peptyd zasiedlający nowotwór, LyP-1 (CGNKRTRGC), selektywnie wiąże się z C1QBP w komórkach eksprymujących guz.

Dalsza lektura

•    Krainer AR, Mayeda A, Kozak D, Binns G (1991). „Funkcjonalna ekspresja sklonowanego ludzkiego czynnika splicingowego SF2: homologia z białkami wiążącymi RNA, U1 70K i regulatorami splicingu Drosophila”. komórka . 66 (2): 383–94. doi : 10.1016/0092-8674(91)90627-B . PMID 1830244 . S2CID 24119556 .
•   Busby TF, Ingham KC (1990). „NH2-końcowa domena wiążąca wapń ludzkiego dopełniacza C1s- pośredniczy w interakcji C1r- z C1q”. Biochemia . 29 (19): 4613–8. doi : 10.1021/bi00471a016 . PMID 2372546 .
•   Fridell RA, Harding LS, Bogerd HP, Cullen BR (1995). „Identyfikacja nowego białka ludzkiego palca cynkowego, które specyficznie oddziałuje z domeną aktywacyjną lentiwirusowych białek Tat” . Wirusologia . 209 (2): 347–57. doi : 10.1006/viro.1995.1266 . PMID 7778269 .
•    Luo Y, Yu H, Peterlin BM (1994). „Białko komórkowe moduluje działanie ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 Rev” . J. Wirol . 68 (6): 3850–6. doi : 10.1128/JVI.68.6.3850-3856.1994 . PMC 236890 . PMID 8189522 .
•   Honoré B, Madsen P, Rasmussen HH i in. (1994). „Klonowanie i ekspresja cDNA obejmującego cały region kodujący podjednostkę P32 ludzkiego czynnika splicingowego pre-mRNA SF2”. gen . 134 (2): 283-7. doi : 10.1016/0378-1119(93)90108-F . PMID 8262387 .
•   Tange TO, Jensen TH, Kjems J (1996). „Interakcja in vitro między białkiem Rev ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 a białkiem związanym z czynnikiem splicingowym ASF / SF2, p32” . J. Biol. chemia . 271 (17): 10066–72. doi : 10.1074/jbc.271.17.10066 . PMID 8626563 .
•   Guo N, Weremowicz S, Lynch N i in. (1997). „Przypisanie C1QBP kodującego białko wiążące domenę globularną C1q (gC1q-R) do ludzkiego chromosomu 17 prążka p13.3 przez hybrydyzację in situ” . Cytogenet. Genet komórkowy . 77 (3–4): 283–4. doi : 10.1159/000134598 . PMID 9284938 .
•   Majumdar M, Datta K (1998). „Przypisanie cDNA kodującego białko wiążące kwas hialuronowy 1 do ludzkiego chromosomu 17p12-p13”. Genomika . 51 (3): 476–7. doi : 10.1006/geno.1998.5364 . PMID 9721222 .
•    Petersen-Mahrt SK, Estmer C, Ohrmalm C i in. (1999). „Białko związane z czynnikiem splicingowym, p32, reguluje splicing RNA poprzez hamowanie wiązania i fosforylacji RNA ASF / SF2” . EMBO J. 18 (4): 1014–24. doi : 10.1093/emboj/18.4.1014 . PMC 1171193 . PMID 10022843 .
•    Jiang J, Zhang Y, Krainer AR, Xu RM (1999). „Struktura krystaliczna ludzkiego p32, kwaśnego białka macierzy mitochondrialnej w kształcie pączka” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 96 (7): 3572–7. Bibcode : 1999PNAS...96.3572J . doi : 10.1073/pnas.96.7.3572 . PMC22335 . _ PMID 10097078 .
•    Braun L, Ghebrehiwet B, Cossart P (2000). „gC1q-R/p32, białko wiążące C1q, jest receptorem dla białka inwazyjnego InlB Listeria monocytogenes” . EMBO J. 19 (7): 1458–66. doi : 10.1093/emboj/19.7.1458 . PMC 310215 . PMID 10747014 .
•    Beatch MD, Hobman TC (2000). „Kapsyd wirusa różyczki wiąże się z białkiem p32 komórki gospodarza i lokalizuje się w mitochondriach” . J. Wirol . 74 (12): 5569–76. doi : 10.1128/JVI.74.12.5569-5576.2000 . PMC 112044 . PMID 10823864 .
•   Storz P, Hausser A, Link G i in. (2000). „Kinaza białkowa C [mikro] jest regulowana przez wielofunkcyjne białko opiekuńcze p32” . J. Biol. chemia . 275 (32): 24601–7. doi : 10.1074/jbc.M002964200 . PMID 10831594 .
•   Tye AJ, Ghebrehiwet B, Guo N i in. (2001). „Ludzki gen gC1qR / p32, C1qBP. Organizacja genomu i analiza promotora” . J. Biol. chemia . 276 (20): 17069–75. doi : 10.1074/jbc.M009064200 . PMID 11278463 .
•   Schaerer MT, Kannenberg K, Hunziker P i in. (2001). „Interakcja między podjednostkami beta receptora GABA (A) a wielofunkcyjnym białkiem gC1q-R” . J. Biol. chemia . 276 (28): 26597–604. doi : 10.1074/jbc.M102534200 . PMID 11350968 .
•   Kobayashi M, Hanai R (2001). „Swoiste dla fazy powiązanie ludzkiej topoizomerazy IIIbeta z chromosomami”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 287 (1): 282–7. doi : 10.1006/bbrc.2001.5580 . PMID 11549288 .
•   Rozanov DV, Ghebrehiwet B, Postnova TI i in. (2002). „Podobna do hemopeksyny domena C-końcowa metaloproteinazy macierzy błonowej typu 1 reguluje proteolizę wielofunkcyjnego białka gC1qR” . J. Biol. chemia . 277 (11): 9318–25. doi : 10.1074/jbc.M110711200 . PMID 11773076 .
•   Majumdar M, Meenakshi J, Goswami SK, Datta K (2002). „Białko wiążące hialuronian 1 (HABP1) / C1QBP / p32 jest endogennym substratem dla kinazy MAP i jest przemieszczane do jądra po stymulacji mitogennej”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 291 (4): 829–37. doi : 10.1006/bbrc.2002.6491 . PMID 11866440 .

Linki zewnętrzne

• Lokalizacja ludzkiego genomu C1QBP i strona szczegółów genu C1QBP w przeglądarce genomu UCSC .