CNOT1

CNOT1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologiczne: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, CDC39, NOT1, NOT1H, AD-005, podjednostka kompleksu transkrypcyjnego CCR4-NOT 1, HPE12, VIBOS
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( Człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Ojej Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortolodzy Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) Wyszukiwanie PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

CCR4 – komponent nieskomplikowany,
identyfikatory Not1
Symbol	Nie1
Pfam	PF04054
InterPro	IPR007196
Dostępne struktury białkowe: Pfam   konstrukcje / ECOD   WPB RCSB WPB ; PDBe ; PDBj Suma PDB podsumowanie struktury

Podjednostka 1 kompleksu transkrypcyjnego CCR4-NOT jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen CNOT1 .

Jest częścią kompleksu CCR4-Not , który powoduje deadenylację mRNA . CNOT1 pełni rolę białka rusztowania, wiążąc inne podjednostki kompleksu.

Interakcje

Wykazano, że CNOT1 oddziałuje z CNOT8 .

Dalsza lektura

•   Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Genom Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•   Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych genów ludzkich. XIII. Kompletne sekwencje 100 nowych klonów cDNA z mózgu, które kodują duże białka in vitro” . Rez. DNA . 6 (1): 63–70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 .
•   Chen J, Rappsilber J , Chiang YC, Russell P, Mann M, Denis CL (2001). „Oczyszczanie i charakterystyka kompleksu 1,0 MDa CCR4-NOT identyfikuje dwa nowe składniki kompleksu”. J. Mol. Biol . 314 (4): 683–94. doi : 10.1006/jmbi.2001.5162 . PMID 11733989 .
•    Laveder P, De Pittà C, Toppo S, Valle G, Lanfranchi G (2002). „Dwuetapowa strategia konstruowania bibliotek cDNA z własnym odejmowaniem” . Kwasy nukleinowe Res . 30 (9): 38e–38. doi : 10.1093/nar/30.9.e38 . PMC 113861 . PMID 11972353 .
•    Winkler GS, Mulder KW, Bardwell VJ, Kalkhoven E, Timmers HT (2006). „Ludzki kompleks Ccr4-Not jest zależnym od ligandu represorem transkrypcji za pośrednictwem receptora jądrowego” . EMBO J. 25 (13): 3089–99. doi : 10.1038/sj.emboj.7601194 . PMC 1500986 . PMID 16778766 .

Linki zewnętrzne

• Klasa motywu motywu liniowego eukariotycznego LIG_CNOT1_NIM_1
• Lokalizacja ludzkiego genomu CNOT1 i strona ze szczegółami genu CNOT1 w przeglądarce genomu UCSC .
• Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : A5YKK6 (podjednostka 1 kompleksu transkrypcyjnego CCR4-NOT) w PDBe-KB .