CPSF6

CPSF6
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, CFIM, CFIM68, HPBRII-4, HPBRII-7, czynnik specyficzny dla rozszczepiania i poliadenylacji 6, CFIM72
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ;
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Podjednostka 6 czynnika specyficzności rozszczepiania i poliadenylacji jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen CPSF6 .

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen jest jedną podjednostką czynnika cięcia wymaganego do cięcia 3' RNA i przetwarzania poliadenylacji. Interakcja białka z RNA jest jednym z najwcześniejszych etapów tworzenia kompleksu przetwarzającego koniec 3' i ułatwia rekrutację innych czynników przetwarzających. Kompleks czynnika rozszczepiania składa się z czterech polipeptydów. Ten gen koduje podjednostkę 68 kD. Ma organizację domenową przypominającą białka spliceosomalne.

Interakcje

Wykazano, że CPSF6 oddziałuje z WWP1 i PLSCR1 .

CPSF6 odgrywa ważną rolę w imporcie jądrowym i integracji kapsydów HIV-1 .

Linki zewnętrzne

Lokalizacja ludzkiego genomu CPSF6 i strona szczegółów genu CPSF6 w przeglądarce genomu UCSC .

Dalsza lektura

Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (marzec 1996). „Oczyszczanie i charakterystyka ludzkiego czynnika rozszczepiania Im zaangażowanego w przetwarzanie końca 3' prekursorów informacyjnego RNA” . Journal of Biological Chemistry . 271 (11): 6107–13. doi : 10.1074/jbc.271.11.6107 . PMID 8626397 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, Friedlein A, Langen H, Keller W (listopad 2000). „Ludzki czynnik cięcia pre-mRNA II (m) zawiera homologi białek drożdży i łączy dwa inne czynniki cięcia” . Dziennik EMBO . 19 (21): 5895–904. doi : 10.1093/emboj/19.21.5895 . PMC 305781 . PMID 11060040 .
Awasthi S, Alwine JC (listopad 2003). „Powiązanie czynnika cięcia poliadenylacji I z U1 snRNP” . RNA . 9 (11): 1400–9. doi : 10.1261/rna.5104603 . PMC 1287061 . PMID 14561889 .
Brązowy KM, Gilmartin GM (grudzień 2003). „Mechanizm regulacji przetwarzania 3' pre-mRNA przez ludzki czynnik cięcia Im” . Komórka Molekularna . 12 (6): 1467–76. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00453-2 . PMID 14690600 .
Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S, Keller W, Barabino SM (sierpień 2004). „Wyraźne motywy sekwencji w podjednostce 68 kDa czynnika cięcia Im pośredniczą w wiązaniu RNA, interakcjach białko-białko i lokalizacji subkomórkowej” (PDF) . Journal of Biological Chemistry . 279 (34): 35788–97. doi : 10.1074/jbc.M403927200 . PMID 15169763 . S2CID 39752996 .
Venkataraman K, Brown KM, Gilmartin GM (czerwiec 2005). „Analiza niekanonicznego miejsca poli (A) ujawnia trójstronny mechanizm rozpoznawania miejsca poli (A) kręgowców” . Geny i rozwój . 19 (11): 1315–27. doi : 10.1101/gad.1298605 . PMC 1142555 . PMID 15937220 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (październik 2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173-8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Millevoi S, Loulergue C, Dettwiler S, Karaa SZ, Keller W, Antoniou M, Vagner S (październik 2006). „Interakcja między U2AF 65 i CF I (m) łączy maszyny do łączenia i obróbki końca 3 '” . Dziennik EMBO . 25 (20): 4854–64. doi : 10.1038/sj.emboj.7601331 . PMC 1618107 . PMID 17024186 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapowanie na dużą skalę ludzkich interakcji białko-białko za pomocą spektrometrii mas” . Biologia systemów molekularnych . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .