CUGBP2

CELF2
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, BRUNOL3, CUGBP2, ETR-3, ETR3, NAPOR, CELF-2, CUG-BP2, CUGBP, członek rodziny podobny do Elav 2, CUGBP członek rodziny podobny do Elav 2, identyfikatory zewnętrzne
DEE97
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ; ; ;
Ontologia genów
Funkcje molekularne
Składnik komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

CUGBP, członek rodziny podobny do Elav 2 , znany również jako Etr-3 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen CELF2 .

Członkowie rodziny białek CELF/BRUNOL są białkami wiążącymi RNA i zawierają dwie N-końcowe domeny motywu rozpoznawania RNA (RRM), jedną C-końcową domenę RRM i rozbieżny segment 160-230 aa między drugą a trzecią domeną RRM . Członkowie tej rodziny białek regulują alternatywny splicing pre-mRNA i mogą być również zaangażowani w edycję i translację mRNA. Splicing alternatywny skutkuje wieloma wariantami transkryptu kodującymi różne izoformy .

Interakcje

Wykazano, że CUGBP2 oddziałuje z A1CF .

Linki zewnętrzne

Lokalizacja ludzkiego genomu CELF2 i strona szczegółów genu CELF2 w przeglądarce genomu UCSC .

Dalsza lektura

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Genom Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Choi DK, Ito T, Tsukahara F i in. (1999). „Regulowana rozwojowo ekspresja mNapor kodującego białko wiążące RNA typu ELAV wywołane apoptozą”. gen . 237 (1): 135–42. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00312-1 . PMID 10524244 .
Dobry PJ, Chen Q, Warner SJ, Śledź DC (2000). „Rodzina ludzkich białek wiążących RNA związanych z regulatorem translacji Drosophila Bruno” . J. Biol. chemia . 275 (37): 28583–92. doi : 10.1074/jbc.M003083200 . PMID 10893231 .
Ladd AN, Charlet N, Cooper TA (2001). „Rodzina białek wiążących RNA CELF jest zaangażowana w splicing alternatywny specyficzny dla komórki i regulowany rozwojowo” . Mol. Komórka. Biol . 21 (4): 1285–96. doi : 10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001 . PMC 99581 . PMID 11158314 .
Li D, Bachinski LL, Roberts R (2001). „Organizacja genomowa i specyficzna dla izoformy ekspresja tkankowa ludzkiego NAPOR (CUGBP2) jako genu kandydata na rodzinną arytmogenną dysplazję prawej komory”. Genomika . 74 (3): 396–401. doi : 10.1006/geno.2001.6558 . PMID 11414768 .
Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D i in. (2002). „Nowa rola białka wiążącego RNA CUGBP2 w edycji RNA ssaków. CUGBP2 moduluje edycję C do U mRNA apolipoproteiny B poprzez interakcję z apobec-1 i ACF, czynnikiem komplementarnym apobec-1” . J. Biol. chemia . 276 (50): 47338–51. doi : 10.1074/jbc.M104911200 . PMID 11577082 .
Lichtner P, Attié-Bitach T, Schuffenhauer S i in. (2003). „Analiza ekspresji i mutacji BRUNOL3, genu kandydata na wady rozwojowe serca i grasicy związane z częściową monosomią 10p”. J. Mol. Med . 80 (7): 431–42. doi : 10.1007/s00109-002-0331-9 . PMID 12110949 . S2CID 24098272 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Mukhopadhyay D, Houchen CW, Kennedy S i in. (2003). „Sprzężona stabilizacja mRNA i wyciszanie translacji cyklooksygenazy-2 przez nowe białko wiążące RNA, CUGBP2” . Mol. komórka . 11 (1): 113–26. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00012-1 . PMID 12535526 .
Singh G, Charlet-B N, Han J, Cooper TA (2004). „Domeny białkowe ETR-3 i CELF4 wymagane do wiązania RNA i splicingu in vivo” . Kwasy nukleinowe Res . 32 (3): 1232–41. doi : 10.1093/nar/gkh275 . PMC 373409 . PMID 14973222 .
Mukhopadhyay D, Jung J, Murmu N i in. (2004). „CUGBP2 odgrywa kluczową rolę w apoptozie komórek raka piersi w odpowiedzi na uszkodzenie genotoksyczne”. Ann. NY Acad. nauka . 1010 (1): 504–9. Bibcode : 2003NYASA1010..504M . doi : 10.1196/annals.1299.093 . PMID 15033780 . S2CID 38581539 .
Brandenberger R, Wei H, Zhang S i in. (2005). „Charakterystyka transkryptomu wyjaśnia sieci sygnalizacyjne, które kontrolują wzrost i różnicowanie ludzkich komórek ES”. Nat. Biotechnologia . 22 (6): 707–16. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M i in. (2004). „Porównanie sekwencji genów człowieka i myszy ujawnia homologiczną strukturę bloków w regionach promotora” . Genom Res . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
Murmu N, Jung J, Mukhopadhyay D i in. (2004). „Dynamiczny antagonizm między białkiem wiążącym RNA CUGBP2 a prostaglandyną E2, w której pośredniczy cyklooksygenaza-2, w uszkodzeniach popromiennych” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (38): 13873-8. Bibcode : 2004PNAS..10113873M . doi : 10.1073/pnas.0406066101 . PMC 518846 . PMID 15358864 .
Han J, Cooper TA (2005). „Identyfikacja domen aktywacji i represji splicingu CELF in vivo” . Kwasy nukleinowe Res . 33 (9): 2769–80. doi : 10.1093/nar/gki561 . PMC 1126903 . PMID 15894795 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y i in. (2006). „Zróżnicowanie modulacji transkrypcji: identyfikacja i charakterystyka na dużą skalę przypuszczalnych alternatywnych promotorów ludzkich genów” . Genom Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
Lim J, Hao T, Shaw C i in. (2006). „Sieć interakcji białko-białko dla ludzkich dziedzicznych ataksji i zaburzeń zwyrodnienia komórek Purkinjego” . komórka . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Chen Z, Eggerman TL, Patterson AP (2007). „Edycja mRNA ApoB odbywa się za pośrednictwem skoordynowanej modulacji wielu składników enzymów edytujących mRNA apoB”. Jestem. J. Physiol. żołądkowo-jelitowy. Fizjol wątroby . 292 (1): G53–65. doi : 10.1152/ajpgi.00118.2006 . PMID 16920700 .