Endoliaza siarczanu chondroityny-ABC
Identyfikatory | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
endoliazy siarczanu chondroityny-ABC | |||||||||
nr WE | 4.2.2.20 | ||||||||
Bazy danych | |||||||||
IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
PRYM | profil | ||||||||
Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
|
Enzym endoliaza siarczanu chondroityny-ABC ( EC 4.2.2.20 ) katalizuje następujący proces:
- Endolityczne rozszczepienie wiązań (1→4)-β-galaktozaminowych między N -acetylogalaktozaminą a kwasem D -glukuronowym lub kwasem L -iduronowym w celu wytworzenia mieszaniny Δ4 - nienasyconych oligosacharydów o różnej wielkości, które ostatecznie ulegają rozkładowi do Δ4 - nienasyconych tetra- i disacharydy
Enzym ten należy do rodziny liaz , w szczególności liaz węglowo-tlenowych działających na polisacharydy. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to endoliaza siarczanu chondroityny-ABC . Inne powszechnie używane nazwy to chondroitynaza (niejednoznaczna) , eliminaza ABC chondroityny (niejednoznaczna) , chondroitynaza ABC (niejednoznaczna), liaza ABC chondroityny (niejednoznaczna) , liaza ABC siarczanu chondroityny (niejednoznaczna) , liaza ChS ABC (niejednoznaczna) , endoeliminaza siarczanu chondroityny ABC , endoliaza ABC siarczanu chondroityny i liaza I ChS ABC .
- Yamagata T, Saito H, Habuchi O, Suzuki S (1968). „Oczyszczanie i właściwości bakteryjnych chondroitynaz i chondrosulfataz”. J. Biol. chemia . 243 (7): 1523–35. PMID 5647268 .
- Saito H, Yamagata T, Suzuki S (1968). „Enzymatyczne metody oznaczania małych ilości izomerycznych siarczanów chondroityny”. J. Biol. chemia . 243 (7): 1536–42. PMID 4231029 .
- Suzuki S, Saito H, Yamagata T, Anno K, Seno N, Kawai Y, Furuhashi T (1968). „Tworzenie trzech rodzajów disulfated disacharydów z siarczanów chondroityny przez trawienie chondroitynazą”. J. Biol. chemia . 243 (7): 1543–50. PMID 5647269 .
- Suzuki S; Hashimoto, N; Mochizuki, H.; Kato, F; Makiguchi, Y; Horie, K; Suzuki, S (1997). „Dwie różne liazy ABC siarczanu chondroityny. Endoeliminaza wytwarzająca tetrasacharydy i egzoeliminaza preferencyjnie działająca na oligosacharydy” . J. Biol. chemia . 272 (14): 9123–30. doi : 10.1074/jbc.272.14.9123 . PMID 9083041 .
- Lauder RM; Nieduszyński IA; Giannopoulos, M; tygodnie, SD; Sadler, IH; Lauder, RM (2005). „Charakterystyka oligosacharydów z siarczanów chondroityny / dermatanu. Badania 1H-NMR i 13C-NMR zredukowanych trisacharydów i heksasacharydów”. FEBS J. 272 (24): 6276–86. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.05009.x . PMID 16336265 .