Cochlin

KOCH
Protein COCH PDB 1jbi.png
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Identyfikatory
, COCH-5B2, COCH5B2, DFNA9, cochlin, DFNB110
Identyfikatory zewnętrzne
ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (białko)

Lokalizacja (UCSC)
PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Cochlin jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen COCH . Jest to białko macierzy pozakomórkowej (ECM), występujące bardzo obficie w ślimaku i przedsionku ucha wewnętrznego, stanowiące główny niekolagenowy składnik macierzy zewnątrzkomórkowej ucha wewnętrznego. Białko jest wysoce konserwatywne u ludzi, myszy i kurczaków, wykazując odpowiednio 94% i 79% identyczności aminokwasów sekwencji ludzkich z mysimi i kurczakami.

Struktura

Cochlin zawiera trzy domeny białkowe: N-końcową domenę LCCL i dwie kopie domen czynnika von Willebranda typu A.

Funkcjonować

Gen ulega ekspresji w wrzecionowatych komórkach zlokalizowanych wzdłuż włókien nerwowych między zwojem słuchowym a nabłonkiem czuciowym. Komórki te towarzyszą neurytom w habenula perforata, otworze, przez który neuryty rozciągają się, unerwiając komórki rzęsate. To i wzór ekspresji tego genu w uchu wewnętrznym kurczaka odpowiadały histologicznym odkryciom kwasochłonnych , zgodnych z podstawową substancją mukopolisacharydową , w kościach skroniowych pacjentów z DFNA9 (autosomalna dominująca niesyndromiczna głuchota czuciowo-nerwowa 9). W tym genie opisano mutacje powodujące DFNA9.

Cochlin został zidentyfikowany w siatce beleczkowej (TM) pacjentów z jaskrą , ale nie u zdrowych osób kontrolnych. TM to podobny do filtra obszar tkanki w oku; cochlin może odgrywać rolę w adhezji komórek, mechanosensacji i modulacji filtra TM.

Ulega również ekspresji w pęcherzykowych komórkach dendrytycznych w śledzionie i węzłach chłonnych . Tutaj ślimak jest rozszczepiany przez agrekanazy i wydzielany do krwioobiegu podczas stanu zapalnego, przyczyniając się do przeciwbakteryjnej wrodzonej odpowiedzi immunologicznej .

Dalsza lektura

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR030743