Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
Identyfikatory NELFB
, COBRA1, NELF-B, kofaktor BRCA1, ujemny współczynnik wydłużenia elementu złożonego B
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Kofaktor BRCA1 , znany również jako COBRA1 , jest ludzkim genem kodującym NELF-B.
Funkcjonować
NELF-B jest podjednostką ujemnego współczynnika wydłużenia (NELF) , który obejmuje również NELF-A ( WHSC2 ; MIM 606026), NELF-C lub NELF-D (TH1L; MIM 605297) i NELF-E ( RDBP ; MIM 154040). NELF działa z czynnikiem indukującym wrażliwość na DRB ( DSIF ), heterodimerem SPT4 (SUPT4H1; MIM 603555) i SPT5 (SUPT5H; MIM 602102), powodując wstrzymanie transkrypcji polimerazy RNA II (patrz MIM 180660). COBRA1 został początkowo zidentyfikowany na dwuhybrydowym skriningu drożdży przy użyciu domeny BRCT1 BRCA1 jako przynęty.
Interakcje
Wykazano, że kofaktor BRCA1 wchodzi w interakcje z:
Dalsza lektura
Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). „Regulacja transkrypcji HIV-1: cele molekularne dla interwencji chemioterapeutycznej” . Med Res ks . 26 (5): 595–625. doi : 10.1002/med.20081 . PMC 7168390 PMID 16838299 .
Yamaguchi Y, Takagi T, Wada T, Yano K, Furuya A, Sugimoto S, Hasegawa J, Handa H (1999). „NELF, wielopodjednostkowy kompleks zawierający RD, współpracuje z DSIF w celu zahamowania wydłużania polimerazy RNA II” . komórka . 97 (1): 41–51. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80713-8 PMID 10199401 . S2CID 16855257 .
Hirosawa M, Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R, Nomura N, Ohara O (2000). „Charakterystyka klonów cDNA wybranych za pomocą analizy GeneMark z bibliotek cDNA frakcjonowanych pod względem wielkości z ludzkiego mózgu” . DNA Res . 6 (5): 329–336. doi : 10.1093/dnares/6.5.329 PMID 10574461 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonowanie DNA przy użyciu rekombinacji specyficznej dla miejsca in vitro” . Genom Res . 10 (11): 1788–1795. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 PMID 11076863 .
Ping YH, Rana TM (2001). „DSIF i NELF oddziałują z kompleksem wydłużenia polimerazy RNA II, a HIV-1 Tat stymuluje fosforylację polimerazy RNA II i DSIF za pośrednictwem P-TEFb podczas wydłużania transkrypcji” . J. Biol. chemia . 276 (16): 12951–12958. doi : 10.1074/jbc.M006130200 PMID 11112772 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych ludzkich cDNA kodujących białka” . Genom Res . 11 (3): 422–435. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). „Systematyczna lokalizacja subkomórkowa nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Przedstawiciel EMBO 1 (3): 287–292. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 PMID 11256614 .
Ye Q, Hu YF, Zhong H, Nye AC, Belmont AS, Li R (2002). „Rozwijanie chromatyny na dużą skalę wywołane przez BRCA1 i specyficzne dla alleli skutki mutacji predysponujących do raka” . J. Cell Biol . 155 (6): 911–921. doi : 10.1083/jcb.200108049 . PMC 2150890 PMID 11739404 .
Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H (2003). „Ludzki czynnik wydłużania transkrypcji NELF: identyfikacja nowych podjednostek i odtworzenie funkcjonalnie aktywnego kompleksu” . Mol. Komórka. Biol . 23 (6): 1863–1873. doi : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . PMC 149481 PMID 12612062 .
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (2004). „Analiza dwuhybrydowego systemu drożdży o dużej przepustowości i jego zastosowanie do przewidywania funkcji białek wewnątrzkomórkowych kodowanych w ludzkim regionie MHC klasy III”. Genomika . 83 (1): 153–167. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
Zhu J, Song S, Jiang Z, Yan J, Lu Q, Huang C, Ye Q (2005). „Charakterystyka COBRA1 w ludzkich liniach komórkowych raka piersi przy użyciu nowego przeciwciała poliklonalnego przeciwko COBRA1”. Życie IUBMB . 56 (3): 161–166. doi : 10.1080/15216540410001699826 . PMID 15185750 . S2CID 31137609 .
Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Charakterystyka na dużą skalę fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (33): 12130–12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 PMC 514446 PMID 15302935 .
Aiyar SE, Sun JL, Blair AL, Moskaluk CA, Lu YZ, Ye QN, Yamaguchi Y, Mukherjee A, Ren DM, Handa H, Li R (2004). „Tłumienie transkrypcji za pośrednictwem receptora estrogenowego α poprzez stymulowaną estrogenem rekrutację ujemnego czynnika wydłużania” . Geny Dev . 18 (17): 2134–2146. doi : 10.1101/gad.1214104 . PMC 515291 PMID 15342491 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). „Od ORFeome do biologii: funkcjonalny rurociąg genomiczny” . Genom Res . 14 (10B): 2136–2144. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 PMID 15489336 .
Zhong H, Zhu J, Zhang H, Ding L, Sun Y, Huang C, Ye Q (2005). „COBRA1 hamuje aktywność transkrypcyjną AP-1 w transfekowanych komórkach”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 325 (2): 568–573. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.10.079 . PMID 15530430 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (2006). „Baza danych LIFEdb w 2006 roku” . Kwasy nukleinowe Res . 34 (problem z bazą danych): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 PMID 16381901 .
McChesney PA, Aiyar SE, Lee OJ, Zaika A, Moskaluk C, Li R, El-Rifai W (2006). „Kofaktor BRCA1: nowy regulator czynnika transkrypcyjnego w gruczolakorakach górnego odcinka przewodu pokarmowego” . Rak Res . 66 (3): 1346–1353. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-3593 PMID 16452188 .
