Dyspersja anomalna na wielu długościach fal

Wielofalowa anomalna dyfrakcja (czasami wielofalowa anomalna dyspersja ; w skrócie MAD ) jest techniką stosowaną w krystalografii rentgenowskiej , która ułatwia określenie trójwymiarowej struktury biologicznych makrocząsteczek (np. DNA, receptorów leków) poprzez roztwór fazy problem .

MAD został opracowany przez Wayne'a Hendricksona podczas pracy jako badacz ze stopniem doktora pod kierownictwem Jerome'a Karle'a w Laboratorium Badawczym Marynarki Wojennej Stanów Zjednoczonych . Matematyka, na której oparto MAD (i prekursora anomalnej dyspersji pojedynczej długości fali ) została opracowana przez Jerome'a Karle'a , za pracę, za którą otrzymał w 1985 roku Nagrodę Nobla w dziedzinie chemii (wraz z Herbertem Hauptmanem ).

Zobacz też

Dalsza lektura

Hendrickson WA (1985). „Analiza struktury białka na podstawie pomiaru dyfrakcji przy wielu długościach fal”. Transakcje ACA . 21 .
Karle J. (1980). „Niektóre postępy w anomalnej dyspersji do badań strukturalnych systemów makrocząsteczkowych w biologii”. International Journal of Quantum Chemistry: Sympozjum biologii kwantowej . 7 : 357–367. doi : 10.1002/qua.560180734 .
Karle J. (1989). „Liniowe analizy algebraiczne struktur z jednym dominującym typem rozpraszacza anomalii” . Acta Crystallographica A. 45 (4): 303–307. doi : 10.1107/s0108767388013042 . PMID 2559755 .
Pahler A, Smith JL, Hendrickson WA (1990). „Reprezentacja prawdopodobieństwa informacji o fazie z anomalnej dyspersji wielu długości fal” . Acta Crystallographica A. 46 (7): 537–540. doi : 10.1107/s0108767390002379 . PMID 2206480 .
Terwilliger TC (1994). „Fazowanie MAD: oszacowania bayesowskie FA” . Acta Crystallographica D. 50 (część 1): 11–16. doi : 10.1107/s0907444993008224 . PMID 15299471 .
Terwilliger TC (1994). „Fazowanie MAD: traktowanie różnic dyspersyjnych jako izomorficznych informacji zastępczych” . Acta Crystallographica D. 50 (część 1): 17–23. doi : 10.1107/s0907444993008236 . PMID 15299472 .
Fourme R, Shepard W, Kahn R, l'Hermite G, de La Sierra IL (1995). „Metoda wielofalowego anomalnego kontrastu rozpuszczalnika (MASC) w krystalografii makromolekularnej”. Dziennik promieniowania synchrotronowego . 2 (część 1): 36–48. doi : 10.1107/S0909049594006680 . PMID 16714785 .
de la Fortelle E, Bricogne G (1997). Udoskonalanie parametru ciężkiego atomu o maksymalnym prawdopodobieństwie dla metod wielokrotnego zastępowania izomorficznego i anomalnej dyfrakcji o wielu długościach fal . Metody w enzymologii. Tom. 276. s. 472–494 . doi : 10.1016/S0076-6879(97)76073-7 . ISBN 978-0-12-182177-7 . PMID 27799110 .
Hendrickson WA, Ogata CM (1997). Wyznaczanie fazy na podstawie pomiarów dyfrakcji anomalii na wielu długościach fal . Metody w enzymologii. Tom. 276. s. 494–523 . doi : 10.1016/S0076-6879(97)76074-9 . ISBN 978-0-12-182177-7 . PMID 27799111 .
Bella J, Rossmann MG (1998). „Ogólny algorytm fazowania dla wielu danych MAD i MIR”. Acta Crystallographica D. 54 (2): 159–174. doi : 10.1107/s0907444997010469 . PMID 9761882 .
Guss JM, Merritt EA, Phizackerley RP, Hedman B, Murata M, Hodgson KO , Freeman HC (1989). „Wyznaczanie fazy za pomocą dyfrakcji rentgenowskiej na wielu długościach fal: struktura krystaliczna podstawowego białka niebieskiej miedzi z ogórków”. nauka . 241 (4867): 806–811. Bibcode : 1988Sci...241..806G . doi : 10.1126/science.3406739 . PMID 3406739 .

Linki zewnętrzne

Etapy MAD — dogłębny samouczek z przykładami, ilustracjami i odniesieniami.
HHMI Bio dla Wayne'a Hendricksona
Strona główna Wayne'a Hendricksona
Podsumowanie badań laboratorium Hendricksona
Biografia Jerome'a Karla Nobla
NRL Uznanie Nagrody Nobla

Programy komputerowe

Pakiet absorpcyjny SSRL — Brennan S, Cowan PL (1992). „Zestaw programów do obliczania absorpcji, odbicia i dyfrakcji promieniowania rentgenowskiego dla różnych materiałów przy dowolnych długościach fal” . Przegląd instrumentów naukowych . 63 (1): 850. Bibcode : 1992RScI...63..850B . doi : 10.1063/1.1142625 .
CHOOCH — Evans G, Pettifer RF (2001). „CHOOCH: program do wyprowadzania czynników rozpraszania anomalii z widm fluorescencji rentgenowskiej” . Journal of Applied Krystalografii . 34 : 82–86. doi : 10.1107/S0021889800014655 .
Shake-and-Bake ( SnB ) — Smith GD, Nagar B, Rini JM, Hauptman HA, Blessing RH (1998). „Zastosowanie Snb do określenia anomalnej podstruktury rozpraszającej”. Acta Crystallographica D. 54 (cz. 5): 799–804. doi : 10.1107/S0907444997018805 . PMID 9757093 .
SHELX — Sheldrick GM (1998). „SHELX: zastosowania do makrocząsteczek”. W S Fortier (red.). Metody bezpośrednie rozwiązywania struktur makrocząsteczkowych . Dordrecht: wydawcy akademiccy Kluwer. s. 401–411. ISBN 0-7923-4949-0 .

Samouczki i przykłady

Evans, Gwyndaf (październik 1994). „Metoda anomalnej dyfrakcji wielu długości fali z wykorzystaniem promieniowania synchrotronowego przy optymalnych energiach promieniowania rentgenowskiego: zastosowanie do krystalografii białek” . praca doktorska . Uniwersytet w Warwick.