ETFB
ETFB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, MADD, FP585, podjednostka beta flawoproteiny przenoszącej elektrony, podjednostka beta flawoproteiny przenoszącej elektrony | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Ludzki gen ETFB koduje podjednostkę beta flawoproteiny przenoszącej elektrony , znaną również jako ETF-β. Wraz z podjednostką alfa przenoszącą elektrony, podjednostką alfa, kodowaną przez gen „ ETFA” , tworzy heterodimeryczną flawoproteinę przenoszącą elektrony (ETF). Natywne białko ETF zawiera odpowiednio jedną cząsteczkę FAD i jedną cząsteczkę AMP.
Pierwsze doniesienia o białku ETF opierały się na ETF wyizolowanym z wątroby świni. Świńskie i ludzkie ETF przenoszą elektrony z flawoenzymów macierzy mitochondrialnej do przenoszącej elektrony oksydoreduktazy flawoproteiny-ubichinonu (ETF-QO) kodowanej przez gen ETFDH . ETF-QO następnie przekazuje elektrony przez ubichinon do kompleksu III w łańcuchu oddechowym . Flawoenzymy, które przenoszą elektrony do ETF, biorą udział w utlenianiu beta kwasów tłuszczowych , katabolizmie aminokwasów , metabolizmie choliny i specjalnych szlakach metabolicznych. Wady jednej z podjednostek ETF lub ETFDH powodują wielokrotny niedobór dehydrogenazy acylo-CoA (OMIM # 231680), wcześniej nazywany kwasicą glutarową typu II . MADD charakteryzuje się wydalaniem szeregu substratów znajdujących się powyżej flawoenzymów, np. kwasu glutarowego, mlekowego, etylomalonowego, masłowego, izomasłowego, 2-metylomasłowego i izowalerianowego.
Relacje ewolucyjne
ETF jest ewolucyjnie starożytnym białkiem z ortologami występującymi we wszystkich królestwach życia. Fundusze ETF są podzielone na 3 podgrupy, I, II i III. Najlepiej przebadaną grupą są ETFy grupy I, które w komórkach eukariotycznych są zlokalizowane w przestrzeni macierzy mitochondrialnej. Grupa I ETF-y przenoszą elektrony między flawoenzymami. ETF-y grupy II mogą również otrzymywać elektrony z ferredoksyny lub NADH.
Gen, ekspresja i lokalizacja subkomórkowa
Ludzki gen ETFB kodujący podjednostkę beta ETF (ETF-β) jest zlokalizowany na chromosomie 19 (19q13.3). Składa się z 6 eksonów. Niewiele wiadomo na temat jego promotora i regulacji transkrypcji. Globalne analizy ekspresji pokazują, że jest on wyrażany na znacznych poziomach w większości tkanek ( PROTEOMICXS DB ). ETF-β jest potranslacyjnie importowany do przestrzeni macierzy mitochondrialnej, ale nie ma rozszczepionej N-końcowej sekwencji kierującej do mitochondriów.
Modyfikacje i regulacje potranslacyjne
P13804 opisano acetylację i sukcynylację reszt lizyny oraz fosforylację reszt seryny i treoniny w ETF-β . Wykazano, że trimetylacja dwóch lizyn, Lys-200 i Lys-203, w ETF-β wpływa na aktywność ETF. Czynnik regulatorowy flawoproteiny przenoszenia elektronów 1 (ETFRF1) został zidentyfikowany jako białko, które specyficznie wiąże ETF i wykazano, że ta interakcja inaktywuje ETF poprzez wypieranie FAD.
Struktura i interakcja z partnerami redoks
Jak pokazano po raz pierwszy dla świńskiego ETF, jeden łańcuch ETF-β łączy się z jednym łańcuchem ETF-α i po jednej cząsteczce FAD i AMP w dimeryczny natywny enzym. Struktura krystaliczna ludzkiego ETF została opisana w 1996 roku. Pokazało to, że ETF składa się z trzech odrębnych domen (I, II i III). FAD jest związany w szczelinie między dwiema podjednostkami i oddziałuje głównie z C-końcową częścią ETF-α. AMP jest zakopany w domenie III. Określono strukturę krystaliczną kompleksu jednego z jego interaktorów, średniołańcuchowej dehydrogenazy acylo-CoA (MCAD; nazwa genu ACADM). To zidentyfikowało tak zwaną pętlę rozpoznawania utworzoną przez ETF-β, która zakotwicza ETF na jednej podjednostce homotetramerycznego enzymu MCAD. Ta interakcja wyzwala zmiany konformacyjne, a wysoce mobilna, aktywna redoks domena FAD ETF przechodzi do domeny FAD sąsiedniej podjednostki tetrameru MCAD, doprowadzając dwie cząsteczki FAD do bliskiego kontaktu w celu międzybiałkowego transferu elektronów.
Funkcja molekularna
Ludzki ETF otrzymuje elektrony z co najmniej 14 flawoenzymów i przenosi je do oksydoreduktaz ETF-ubichinonu (ETF:QO) w wewnętrznej błonie mitochondrialnej. ETF:QO z kolei przekazuje je do ubichinonu, skąd wchodzą do łańcucha oddechowego w kompleksie III. Większość flawoenzymów przenoszących elektrony do ETF bierze udział w utlenianiu kwasów tłuszczowych, katabolizmie aminokwasów i metabolizmie choliny. ETF i ETF:QO stanowią zatem ważne centrum przenoszenia elektronów z różnych reakcji redoks i dostarczania ich do łańcucha oddechowego w celu produkcji energii.
Wady genetyczne i patogeneza molekularna
Szkodliwe mutacje w genach ETFB i ETFA kodujących ETF lub genie ETFDH kodującym ETF:QO są związane z wielokrotnym niedoborem dehydrogenazy acylo-CoA (MADD; OMIM #231680 ; wcześniej nazywana kwasicą glutarową typu II). Biochemicznie MADD charakteryzuje się podwyższonymi poziomami szeregu koniugatów karnityny substratów różnych dehydrogenaz partnerskich piasty ETF/ETF:QO, np. kwasy. Nagromadzenie substratów i pochodnych dehydrogenaz poprzedzających oraz niedobór energii na czczo powodują fenotyp kliniczny. Głównie w zależności od ciężkości mutacji, chorobę dzieli się na trzy podgrupy: typ I (początek noworodkowy z wadami wrodzonymi), typ II (początek noworodkowy bez wad wrodzonych) i typ III (późny początek). Nie ma lekarstwa na tę chorobę, a leczenie obejmuje dietę ograniczającą spożycie białka i tłuszczu, unikanie długotrwałego postu, aby złagodzić przepływ przez partnerskie dehydrogenazy. Ponadto suplementacja ryboflawiny, prekursora kofaktora FAD, może stabilizować zmutowane warianty ETF i ETF:QO z pewnymi mutacjami zmiany sensu.
Notatki
Dalsza lektura
- Frerman FE (czerwiec 1988). „Dehydrogenazy acylo-CoA, flawoproteina przenosząca elektrony i dehydrogenaza flawoproteiny przenosząca elektrony”. Transakcje Towarzystwa Biochemicznego . 16 (3): 416–8. doi : 10.1042/bst0160416 . Identyfikator PMID 3053288 .
- Freneaux E, Sheffield VC, Molin L, Shires A, Rhead WJ (listopad 1992). „Kwasica glutarowa typu II. Heterogeniczność strumienia beta-oksydacji, syntezy polipeptydów i komplementarnych mutacji DNA w podjednostce alfa flawoproteiny przenoszącej elektrony u ośmiu pacjentów” . Dziennik badań klinicznych . 90 (5): 1679–86. doi : 10.1172/JCI116040 . PMC 443224 . PMID 1430199 .
- Indo Y, Glassberg R, Yokota I, Tanaka K (wrzesień 1991). „Charakterystyka molekularna wariantu podjednostki alfa flawoproteiny przenoszącej elektrony u trzech pacjentów z kwasicą glutarową typu II - i identyfikacja podstawienia glicyny waliny-157 w sekwencji prekursora, wytwarzającej niestabilne dojrzałe białko u pacjenta” . American Journal of Human Genetics . 49 (3): 575–80. PMC 1683153 . PMID 1882842 .
- Finocchiaro G, Ito M, Ikeda Y, Tanaka K (październik 1988). „Klonowanie molekularne i sekwencja nukleotydów cDNA kodujących podjednostkę alfa ludzkiej flawoproteiny przenoszącej elektrony” . Journal of Biological Chemistry . 263 (30): 15773–80. doi : 10.1016/S0021-9258(19)37655-0 . PMID 3170610 .
- Biały RA, Dowler LL, Angeloni SV, Koeller DM (kwiecień 1996). „Przypisanie Etfdh, Etfb i Etfa do chromosomów 3, 7 i 13: mysie homologi genów odpowiedzialnych za kwasicę glutarową typu II u ludzi”. Genomika . 33 (1): 131–4. doi : 10.1006/geno.1996.0170 . PMID 8617498 .
- Roberts DL, Frerman FE, Kim JJ (grudzień 1996). „Trójwymiarowa struktura ludzkiego flawoproteiny przenoszącej elektrony do rozdzielczości 2,1 A” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (25): 14355–60. doi : 10.1073/pnas.93.25.14355 . PMC26136 . _ PMID 8962055 .
- Bross P, Pedersen P, Winter V, Nyholm M, Johansen BN, Olsen RK i in. (czerwiec 1999). „Wariant polimorficzny w ludzkim łańcuchu alfa flawoproteiny przenoszącej elektrony (alfa-T171) wykazuje zmniejszoną stabilność termiczną i jest nadreprezentowany u pacjentów z niedoborem dehydrogenazy acylo-CoA o bardzo długich łańcuchach z łagodną prezentacją w dzieciństwie” . Genetyka molekularna i metabolizm . 67 (2): 138–47. doi : 10.1006/mgme.1999.2856 . PMID 10356313 .
- Jones M, Talfournier F, Bobrov A, Grossmann JG, Vekshin N, Sutcliffe MJ, Scrutton NS (marzec 2002). „Przenoszenie elektronów i zmiany konformacyjne w kompleksach dehydrogenazy trimetyloaminowej i flawoproteiny przenoszącej elektrony” . Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 8457–65. doi : 10.1074/jbc.M111105200 . PMID 11756429 .
- Olsen RK, Andresen BS, Christensen E, Bross P, Skovby F, Gregersen N (lipiec 2003). „Wyraźny związek między genotypem i fenotypem ETF / ETFDH u pacjentów z wielokrotnym niedoborem odwodornienia acylo-CoA”. Ludzka mutacja . 22 (1): 12–23. doi : 10.1002/humu.10226 . PMID 12815589 . S2CID 24730356 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R i in. (styczeń 2006). „Zróżnicowanie modulacji transkrypcji: identyfikacja i charakterystyka na dużą skalę przypuszczalnych alternatywnych promotorów ludzkich genów” . Badania genomu . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Schiff M, Froissart R, Olsen RK, Acquaviva C, Vianey-Saban C (czerwiec 2006). „Niedobór flawoproteiny przenoszącej elektrony: aspekty funkcjonalne i molekularne”. Genetyka molekularna i metabolizm . 88 (2): 153–8. doi : 10.1016/j.ymgme.2006.01.009 . PMID 16510302 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
- Chiong MA, Sim KG, Carpenter K, Rhead W, Ho G, Olsen RK, Christodoulou J (2007). „Przejściowy, wielokrotny niedobór odwodornienia acylo-CoA u noworodków płci żeńskiej spowodowany niedoborem ryboflawiny u matki”. Genetyka molekularna i metabolizm . 92 (1–2): 109–14. doi : 10.1016/j.ymgme.2007.06.017 . PMID 17689999 .