Ectobacillus
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Ectobacillus | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: |
Ectobacillus Gupta i in. 2020
|
| Gatunek | |
Informacje na podstawie LPSN 2021 |
|
Ectobacillus jest rodzajem Gram-dodatnich (z wyjątkiem Ectobacillus funiculus , który jest Gram-ujemny ), pałeczkowatych bakterii z rodziny Bacillaceae z rzędu Bacillales . Gatunkiem typowym dla tego rodzaju jest Ectobacillus panaciterrae.
Ectobacillus składa się z gatunków pierwotnie należących do rodzaju Bacillus . Rodzaj Bacillus obejmuje dużą liczbę niepowiązanych filogenetycznie gatunków bakterii o zróżnicowanym zakresie cech biochemicznych. Polifiletyczny charakter rodzaju wynika częściowo z niejasnych kryteriów stosowanych przy przyporządkowywaniu gatunków do tego rodzaju (tj. przyjmowanie wszystkich gatunków zdolnych do tworzenia przetrwalników w warunkach tlenowych). Porównawcze analizy genomiczne i badania filogenetyczne miały na celu wyjaśnienie złożonego związku taksonomicznego tego rodzaju, co doprowadziło do przeniesienia wielu gatunków do nowych rodzajów, takich jak Virgibacillus , Solibacillus , Brevibacillus i Alteribacter . Ponadto rodzaj Bacillus został ograniczony do gatunków blisko spokrewnionych z Bacillus subtilis i Bacillus cereus .
Nazwa Ectobacillus pochodzi od jego pozycji taksonomicznej w stosunku do Bacillus . Przedrostek „ecto-” (który pochodzi od greckiego przyimka ecto i tłumaczy się jako „na zewnątrz”) oraz przyrostek „-bacillus” (który pochodzi od łacińskiego rzeczownika Bacillus , odnoszącego się do laski lub laski, jak również Bacillus , rodzaj bakterii) łączą się, tworząc nazwę Ectobacillus, co oznacza „poza Bacillus ”.
Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne
Członkowie rodzaju Ectobacillus mogą być tlenowymi lub fakultatywnie beztlenowymi . Wszystkie tworzą przetrwalniki, a niektórzy członkowie to komórki ruchliwe. Ectobacillus może przetrwać w temperaturze od 15°C do 45°C, jednak optymalny wzrost następuje w przedziale 28-35°C.
Analizy sekwencji genomu Ectobacillus zidentyfikowały pięć konserwatywnych indeli sygnaturowych (CSI), które są wyłączne dla gatunków Ectobacillus w białkach małej podjednostce dehydratazy 3-izopropylomałczanowej, deacetylazie biosyntezy bakcylitiolu BshB1, reduktazie aldo lub keto, metalo-hydrolazie fałdowej MBL i domenie CYTH -zawierające białko. Te CSI można wykorzystać do odróżnienia Ectobacillus od innych rodzajów Bacillceae pod względem molekularnym.
Taksonomia
Ectobacillus występują łącznie 4 gatunki z ważnie opublikowanymi nazwami . Stwierdzono, że członkowie tego kladu grupują się w gałęzi monofiletycznej w różnych drzewach filogenetycznych zbudowanych na konserwowanych sekwencjach genomu i sekwencjach 16S rRNA. Ten wzór rozgałęzień można również zobaczyć w bazie danych taksonomii genomu (GTDB), dodatkowo wspierając tę klasyfikację.