Erez Lieberman Aiden

Erez Lieberman Aiden
Lieberman Aiden w 2011 roku
Urodzić się	Ereza Liebermana 1980 (wiek 42–43) Brooklyn , Nowy Jork , USA
Alma Mater	Uniwersytet Princeton (licencjat) Uniwersytet Yeshiva (magisterium) Uniwersytet Harvarda (doktorat)
Współmałżonek	Aviva Presser Aiden ​ ( m. 2005 <a i=3>) ​
Nagrody	Lemelson–MIT Student Prize , Technology Review TR35
Kariera naukowa
Pola	Matematyka stosowana Biologia molekularna Biofizyka
Instytucje	Baylor College of Medicine
Praca dyplomowa	Ewolucja i pojawienie się struktury (2010)
Doradca doktorski	Erica Landera Martina Nowaka
Strona internetowa	erez.com _

Erez Lieberman Aiden (ur. 1980, z domu Erez Lieberman) to amerykański naukowiec aktywny w wielu dziedzinach związanych z matematyką stosowaną . Jest adiunktem w Baylor College of Medicine , a wcześniej członkiem Harvard Society of Fellows i wizytującym członkiem wydziału w Google . Jest adiunktem na wydziale informatyki na Rice University . Używając metod matematycznych i obliczeniowych, badał ewolucję w różnych kontekstach, w tym sieci poprzez ewolucyjną teorię grafów i języki w dziedzinie kulturomiki . Publikował artykuły naukowe z różnych dziedzin.

Lieberman Aiden zdobył nagrody, w tym nagrodę Lemelson-MIT Student Prize oraz nagrodę Amerykańskiego Towarzystwa Fizycznego za wybitne badania nad pracą doktorską z fizyki biologicznej. W 2009 roku Lieberman Aiden został uznany przez Technology Review za jednego z 35 najlepszych innowatorów poniżej 35 roku życia , aw 2011 roku był jednym z laureatów Presidential Early Career Award for Scientists and Engineers .

Wczesne życie i edukacja

Lieberman dorastał na Brooklynie z trójką rodzeństwa. Zaczął programować komputery w wieku siedmiu lat. Jego ojciec, Aharon Lieberman, był przedsiębiorcą technologicznym i właścicielem fabryki w New Jersey . Jako dziecko Lieberman Aiden mówił po hebrajsku i węgiersku , czyniąc angielski swoim trzecim językiem.

Lieberman Aiden studiował matematykę, fizykę i filozofię w Princeton i uzyskał tytuł magistra historii na Uniwersytecie Yeshiva . Zaczął robić wspólny doktorat z matematyki i bioinżynierii na Wydziale Nauk o Zdrowiu i Technologii Harvard-MIT , gdzie doradzali mu Eric Lander i Martin Nowak .

Badania i kariera

Lieberman Aiden przyczynił się do powstania ewolucyjnej teorii grafów wraz ze swoim promotorem doktoratu Martinem Nowakiem . Od tego czasu zajmuje się badaniem trójwymiarowej struktury ludzkiego genomu oraz dziedziną kulturomiki .

Fraktalny model globul ( po lewej ) trójwymiarowej struktury genomu, zasugerowany przez Liebermana Aidena i współpracowników, skontrastowany z modelem równowagi ( po prawej ) (małe zdjęcia przedstawiają przekroje)

Struktura genomu 3D

Zobacz też: Hi-C (technika analizy genomowej)

Lieberman Aiden był członkiem zespołu naukowców z University of Massachusetts Medical School i MIT , który jako pierwszy zasugerował, że ludzkie DNA fałduje się w globulę fraktalną , a nie w globulę równowagi. To odkrycie wyjaśnia, w jaki sposób genom każdej komórki może być mocno zagęszczony bez tworzenia węzła . Lieberman Aiden i współpracownicy wynaleźli wariant wychwytywania konformacji chromosomu o nazwie „Hi-C”, który daje miarę prawdopodobieństwa kontaktu w całym genomie, która wskazuje na trójwymiarową strukturę genomu. Ta technika łączy istniejącą metodologię wychwytywania chromosomów z sekwencjonowaniem nowej generacji , umożliwiając wszechstronny pomiar kontaktów chromatyny.

W 2009 roku praca ta została opublikowana w czasopiśmie Science i znalazła się na okładce. Po publikacji zacytowano słowa Liebermana Aidena:

Od dawna wiemy, że w małej skali DNA jest podwójną helisą… Ale gdyby podwójna helisa nie zwijała się dalej, genom w każdej komórce miałby dwa metry długości. Naukowcy nie do końca rozumieli, w jaki sposób podwójna helisa zwija się, aby zmieścić się w jądrze ludzkiej komórki, która ma zaledwie jedną setną milimetra średnicy. To nowe podejście umożliwiło nam zbadanie dokładnie tego pytania.

W 2014 roku był starszym autorem artykułu w Cell , w którym opisano udoskonaloną metodę Hi-C, którą jego zespół wykorzystał do opisania podstawowej organizacji DNA.

Erez Lieberman Aiden wykłada kulturomikę na Uniwersytecie Harvarda w 2011 roku

kulturomika

Lieberman Aiden był zaangażowany w analizę korpusu około 5 milionów zdigitalizowanych książek, stosując techniki eksploracji danych , aby rozwinąć nową dziedzinę kulturomiki. Leiberman Aiden był zaangażowany w projekt digitalizacji anglosaskich w 2004 roku, którego analiza dostarczyła dowodów potwierdzających regularyzację czasowników, proces, w którym czasowniki nieregularne stają się z czasem coraz bardziej regularne .

Po ogłoszeniu Książek Google Lieberman Aiden zwrócił się do dyrektora ds. badań Google, Petera Norviga , i otrzymał pozwolenie na statystyczną analizę ich danych. Jego praca przyczyniła się do powstania przeglądarki Google Ngram Viewer , wydanej w grudniu 2010 r., która wykorzystuje idee kulturomiczne do tworzenia znormalizowanych trendów historycznych dla dowolnej sekwencji liter. W ramach tego projektu w czasopiśmie Science opublikowano szereg odkryć , w tym zmieniającą się dynamikę sławy i przypadki cenzury literackiej podczas drugiej wojny światowej .

Nagrody i wyróżnienia

W 2008 roku Lieberman Aiden otrzymał nagrodę Lemelson-MIT Student Prize za pracę nad iShoe, który miał pomagać osobom starszym z problemami z równowagą i zapobiegać upadkom, które mogłyby spowodować obrażenia. W następnym roku iShoe znalazł się na liście „20 nowych przełomów biotechnologicznych, które zmienią medycynę” magazynu Popular Mechanics . Rok później Lieberman Aiden został uznany za jednego z 35 najlepszych innowatorów poniżej 35 roku życia ( TR35 ) przez magazyn Technology Review MIT .

W 2010 roku Amerykańskie Towarzystwo Fizyczne przyznało Liebermanowi Aidenowi nagrodę za wybitne badania pracy doktorskiej z fizyki biologicznej za jego pracę zatytułowaną „Ewolucja i pojawienie się struktury”. Jego rozprawa doktorska została również nagrodzona Hertz Thesis Prize. Lieberman Aiden jest także laureatem nagrody New Innovator Award dyrektora NIH i został wymieniony, wraz z 95 innymi amerykańskimi naukowcami, jako laureat Presidential Early Career Award for Scientists and Engineers w 2011 roku.

Życie osobiste

Erez Lieberman poślubił Avivę Presser w 2005 roku; po ślubie zarówno mąż, jak i żona dodali do swoich nazwisk „Aiden”, co po hebrajsku oznacza Eden, a po gaelicku mały ogień. Mają syna o imieniu Gabriel Galileo, córkę o imieniu Maayan Amara i innego chłopca o imieniu Judah Avraham. Poza zainteresowaniami naukowymi Lieberman Aiden brał udział we w zakresie sztuki współczesnej z Nicholasem Kahnem i Richardem Selesnickiem, która była wystawiana w galeriach w Stanach Zjednoczonych i Europie.

Lieberman Aiden i jego żona założyli Bears Without Borders, organizację non-profit , która zajmuje się dystrybucją wypchanych zabawek w krajach rozwijających się.