HNRPF

HNRNPF
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, HNRPF, OK/SW-cl.23, mcs94-1, heterogenna jądrowa rybonukleoproteina F
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Heterogenna jądrowa rybonukleoproteina F jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen HNRNPF .

Ten gen należy do podrodziny wszechobecnych heterogennych jądrowych rybonukleoprotein ( hnRNP ). hnRNP to białka wiążące RNA , które łączą się z heterogenicznym jądrowym RNA (hnRNA). Białka te są związane z pre-mRNA w jądrze i regulują alternatywny splicing, poliadenylację i inne aspekty metabolizmu i transportu mRNA .

Chociaż wszystkie hnRNP są obecne w jądrze , niektóre wydają się przemieszczać między jądrem a cytoplazmą . Białka hnRNP mają różne właściwości wiązania kwasów nukleinowych . Białko kodowane przez ten gen ma trzy powtórzenia domen quasi-RRM, które wiążą się z RNA , które mają sekwencje bogate w guanozynę . Białko to jest bardzo podobne do członka rodziny hnRNPH. Zidentyfikowano wiele alternatywnych splicingów, kodujących to samo białko.

Dalsza lektura

•   McDonald H, Smailus D, Jenkins H i in. (1992). „Identyfikacja i charakterystyka genu w D10S94 w regionie MEN2A”. Genomika . 13 (2): 344–8. doi : 10.1016/0888-7543(92)90251-M . PMID 1351868 .
•    Matunis MJ, Xing J, Dreyfuss G (1994). „Białko F hnRNP: unikalna struktura podstawowa, właściwości wiązania kwasów nukleinowych i lokalizacja subkomórkowa” . Kwasy nukleinowe Res . 22 (6): 1059–67. doi : 10.1093/nar/22.6.1059 . PMC 307930 . PMID 7512260 .
•    Gamberi C, Izaurralde E, Beisel C, Mattaj IW (1997). „Interakcja między ludzkim kompleksem białek wiążących czapeczkę jądrową a hnRNP F”. Mol. Komórka. Biol . 17 (5): 2587–97. doi : 10.1128/MCB.17.5.2587 . PMC 232108 . PMID 9111328 .
•    Chou MY, Rooke N, Turck CW, czarny DL (1999). „hnRNP H jest składnikiem kompleksu wzmacniającego splicing, który aktywuje alternatywny ekson c-src w komórkach neuronalnych” . Mol. Komórka. Biol . 19 (1): 69–77. doi : 10.1128/MCB.19.1.69 . PMC83866 . _ PMID 9858532 .
•    Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). „hnRNPs H, H' i F zachowują się inaczej w odniesieniu do posttranslacyjnego rozszczepienia i lokalizacji subkomórkowej” . FEBS Lett . 456 (2): 274–80. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00911-4 . PMID 10456323 . S2CID 7617501 .
•    Yoshida T, Kokura K, Makino Y i in. (2000). „Heterogeniczne jądrowe RNA-rybonukleoproteina F wiąże się z DNA poprzez motyw oligo (dG) i jest związane z polimerazą RNA II” . Komórki genów . 4 (12): 707–19. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00295.x . PMID 10620016 . S2CID 31210778 .
•    Markovtsov V, Nikolic JM, Goldman JA i in. (2000). „Kooperacyjne składanie kompleksu hnRNP indukowanego przez tkankowo specyficzny homolog białka wiążącego przewód polipirymidynowy” . Mol. Komórka. Biol . 20 (20): 7463–79. doi : 10.1128/MCB.20.20.7463-7479.2000 . PMC86300 . _ PMID 11003644 .
•   Zhang Y, Lindblom T, Chang A i in. (2001). „Dowody na to, że dim1 wiąże się z białkami zaangażowanymi w splicing pre-mRNA i określenie reszt niezbędnych do interakcji dim1 z hnRNP F i Npw38 / PQBP-1”. gen . 257 (1): 33–43. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00372-3 . PMID 11054566 .
•    Veraldi KL, Arhin GK, Martincic K i in. (2001). „hnRNP F wpływa na wiązanie 64-kilodaltonowej podjednostki czynnika stymulacji cięcia z prekursorami mRNA w mysich komórkach B” . Mol. Komórka. Biol . 21 (4): 1228–38. doi : 10.1128/MCB.21.4.1228-1238.2001 . PMC 99576 . PMID 11158309 .
•   Jia L, Young MF, Powell J i in. (2002). „Profil ekspresji genów ludzkich komórek zrębowych szpiku kostnego: wysokowydajna analiza sekwencjonowania znaczników ekspresji” . Genomika . 79 (1): 7–17. doi : 10.1006/geno.2001.6683 . PMID 11827452 .
•    Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR i in. (2002). „Oczyszczanie i charakteryzacja natywnych spliceosomów nadających się do trójwymiarowej analizy strukturalnej” . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
•    Angenstein F, Evans AM, Settlage RE, et al. (2002). „Receptor dla aktywowanej kinazy C jest częścią matrycowych kompleksów rybonukleoproteinowych związanych z poliA-mRNA w neuronach” . J. Neurosci . 22 (20): 8827–37. doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-20-08827.2002 . PMC 6757688 . PMID 12388589 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T i in. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21 243 pełnej długości ludzkich cDNA” . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•   Honoré B, Baandrup U, Vorum H (2004). „Heterogeniczne jądrowe rybonukleoproteiny F i H / H” wykazują zróżnicowaną ekspresję w normalnych i wybranych tkankach nowotworowych. Do potęgi. Rozdz . komórki 294 (1): 199–209. doi : 10.1016/j.yexcr.2003.11.011 . PMID 14980514 .
•   Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV i in. (2004). „Sekwencja DNA i analiza porównawcza ludzkiego chromosomu 10” . Natura . 429 (6990): 375–81. Bibcode : 2004Natur.429..375D . doi : 10.1038/natura02462 . PMID 15164054 .
•    Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). „Charakterystyka na dużą skalę fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: Kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA i in. (2005). „Profilowanie powinowactwa immunologicznego fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Nat. Biotechnologia . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .