Haplotyp HLA A1-B8
|
|||
| Haplotyp wielogenowy, ludzki | |||
|---|---|---|---|
| region HLA na chromosomie 6 | |||
| klasy I, A1-Cw7-B8 | |||
| Pseudonimy |
"HL A1,8; HL A1, A8; HLA A1-B8; HLA A*01-B*08, HLA A*01:01-B*08:01" |
||
| Loci | Gen | Allel | Serotyp |
|
HLA-F do HLA-A |
HLA-F | - | |
| HLA-G | - | ||
| HLA-A | *0101 | A1 | |
| HLA-E | HLA-E | - | |
| Cw-B | HLA-C | *0701 | Cw7 |
| HLA-B | *0801 | B8 | |
| węzły | |||
| Maksimum populacji | Częstotliwość Maks | ||
| Zachodnia Irlandia | >15,0% | ||
| Rozmiar i lokalizacja | |||
| Geny | Lokalizacja | rozmiar (kb/s) | |
| - | 6 | 6p21.3 | 1400 |
HLA A1-B8 (również: HL A1,8 ; HL A1, A8 ; HLA A1-Cw7-B8 ; HLA A*01-B*08 , HLA A*0101-B*0801 , HLA A*0101-Cw*0701 -B*0801 ; HLA A*01:01-C*07:01-B*08:01 ) jest wielogenowym haplotypem , który obejmuje region MHC klasy I ludzkiego głównego kompleksu zgodności tkankowej na chromosomie 6 . Haplotyp wielogenowy to zestaw dziedziczonych alleli obejmujące kilka genów lub alleli genów; wspólne haplotypy wielogenowe są na ogół wynikiem tożsamości przez pochodzenie od wspólnego przodka (mają niedawnego wspólnego przodka dla tego segmentu chromosomu). Rekombinacja chromosomów powoduje fragmentację haplotypów wielogenowych w miarę zwiększania się odległości do tego przodka w kolejnych pokoleniach.
Haplotyp można zapisać w rozszerzonej formie obejmującej główne loci zgodności tkankowej w następujący sposób:
HLA A *01:01 : Cw *07:01 : B *08:01
Istnieje jednak wiele innych alleli genów w haplotypie. W Europie występuje A1-B8, na ogół jako część haplotypu HLA A1-B8-DR3-DQ2 . Ten haplotyp ma długość 4,7 miliona nukleotydów i jest drugim najdłuższym haplotypem zidentyfikowanym w ludzkim genomie . W Afryce A1-B8 i Indiach A1-B8 jest powiązany z innymi genami i innymi wariantami A*01 i B*08
Stowarzyszenia chorobowe
Z filozoficznego punktu widzenia A1-B8 to coś więcej niż tylko dwa allele genów. Te allele genów są markerami haplotypu, odcinka chromosomu 6, który zawiera wiele alleli genów. W swojej naturalnej historii haplotyp ten przeszedł jakąś nietypową selekcję, pod koniec okresu ewolucji stał się dominującym haplotypem u północno-zachodnich przodków europejskich. Dziś jednak gromadzenie genów wiąże się ze zwiększoną częstością występowania niektórych chorób. Pomimo faktu, że związki te były znane prawie tak długo, jak znane były A1 i „A8”, rola czynników wpływających na chorobę wciąż nie jest jasna.
A1-B8 i choroby autoimmunologiczne
Serotyp A1-B8 był powiązany z wieloma chorobami, ponieważ po raz pierwszy opisano antygeny „HL-A” . Wśród nich były : celiakia , autoimmunologiczne czynne przewlekłe zapalenie wątroby , myasthenia gravis , nadczynność kory nadnerczy – zespół Cushinga , pierwotna marskość żółciowa wątroby .
Jednak wraz ze wzrostem wielkości badań i bardziej szczegółowym opisem serotypów D, powiązanie tych loci przesunęło się z loci MHC klasy I do loci MHC klasy II . U podstaw tego ruchu leżał HLA A1-B8-DR3-DQ2 , haplotyp, który znajduje się w ostrej nierównowadze sprzężeń w populacji europejskiej. Ta nierównowaga sprawiła, że wydawało się, że A1 i inne allele genów klasy I były czynnikami chorobowymi, gdy te allele były przyłączone tylko do długiego odcinka konserwatywnego DNA, który miał geny związane z chorobą na drugim końcu. W co najmniej 2 chorobach ryzyko choroby autoimmunologicznej wykracza poza region klasy II haplotypu.
Toczeń rumieniowaty układowy
Stwierdzono, że „fenotyp HL-A1,8” jest związany z ciężkim toczniem rumieniowatym układowym (SLE) (zajęcie nerek i ośrodkowego układu nerwowego) u pacjentów rasy kaukaskiej. Dwupunktowa analiza haplotypów między TNFB (allel B*01) i HLA pokazuje, że allel jest w nierównowadze sprzężeń z HLA-A1, Cw7, B8, C4A (Null), DR3, DQ2.5.
Cukrzyca typu 1
Podczas gdy cukrzyca typu 1 wykazuje rozszerzony związek na haplotypie HLA A1-B8-DR3-DQ2, wydaje się, że związek ten nie wykracza poza locus HLA-B. Niedawne badanie fenotypu DR3-DQ2/DR4-DQ8 wykazało, że A1-cw7-B8 było w rzeczywistości niższe niż oczekiwano w stosunku do innych typów AB, co wskazuje, że geny związane z ryzykiem znajdują się między B8 a DR3. Wydaje się, że A*0101 zmienia ryzyko cukrzycy typu 1 , ale nie Cw7-B8. Przykład cukrzycy typu 1 pokazuje nieodłączną trudność w stosowaniu samej analizy powiązań do ryzyka szyfrowania.
A1-B8 i choroba alergiczna
że w chorobie alergicznej A1, B8 wiążą się z reakcjami alergicznymi u noworodków. Stwierdzono wzrost A1, B8 u dzieci z astmą oskrzelową i niskim poziomem IgA. Jednak część tej reakcji można przypisać powiązaniu haplotypu HLA A1-B8-DR3-DQ2 z fenotypem bez IgA. Mocniejszy związek stwierdzono z atopiami . A1, B8 występowały częściej w katarze siennym powikłanym astmą lub atopią w porównaniu z samym katarem siennym. Kolejni pacjenci z astmą z negatywnymi testami skórnymi wykazywali tendencję do wyższych serotypów A1, B8.
A1-B8 i choroby zakaźne
HIV
W połowie lat 80. związek z A1-B8-DR3 i progresją HIV pojawił się wkrótce po odkryciu wirusa. A1-B8 wiązało się z szybszym postępem seropozytywności i było silnie związane z szybkim spadkiem liczby komórek T4 i rozwojem objawów związanych z HIV w ciągu czterech lat od zakażenia. Najsilniejsze skojarzenia zaobserwowano z haplotypem A1-Cw7-B8. C4 (dopełniacz 4) wytwarza allel zerowy w locus C4AQ. To locus w części haplotypu HLA A1-B8-DR3-DQ2 (markery to A1, CW7, B8, BfS, C4AQ0, C4B1, DR3, DQ2) dlatego jedno badanie wykazało, że C4AQ0 może wyjaśniać zwiększoną zakaźność HIV. Haplotyp był dodatkowo powiązany z splenomegalią fałszywego guza, limfocytozą CD8 i wysokim IgG.
Wirusowe zapalenie wątroby
Zaobserwowano związek między wirusowym zapaleniem wątroby a HLA-A1. Chociaż związek A1 z autoimmunologicznym zapaleniem wątroby bez przeciwciał przeciwwirusowych był silniejszy niż z przewlekłym aktywnym zapaleniem wątroby z mianem przeciwwirusowym. Następnie wykazano związek z wirusowym zapaleniem wątroby, a pacjenci z przeciwciałami przeciwjądrowymi częściej mieli A1-B8-DR3. Obecnie badania wskazują na asocjację proksymalną loci Cw*0702-B*0801.
Częstotliwości
| Irlandia | 14.4 | 1 | ||
| słowacki | 11.9 | 1 | ||
| Irlandia Północna | 11,5 | 1 | 1 | |
| szwedzki | 11,5 | 1 | ||
| Holenderska Holandia | 9.8 | |||
| jugosłowiański | 9.7 | 1 | ||
| brytyjski | 9.7 | 1 | ||
| język węgierski | 9.4 | 1 | ||
| CEPH Francja | 8.5 | 1 | 1 | |
| Niemiecki | 8.3 | 1 | ||
| Czech | 7.8 | 1 | ||
| szwajcarski | 6.7 | 3 | ||
| Belgia | 5.5 | 2 | ||
| Austria | 4.5 | 2 | ||
| Toskańskie Włochy | 4.3 | |||
| Ukraina | 4.3 | 3 | ||
| Włochy | 4.2 | 1 | ||
| baskijski | 4.2 | |||
| portugalski | 4.2 | 2 | ||
| Polski | 4.0 | |||
| Uganda | 3.7 | 1 | ||
| uralski | 3.1 | 3 | ||
| hiszpański | 2.8 | 4 | ||
| [1] | Rumunia | 2.8 | ||
| Albania | 2.5 | |||
| grecki | 2.3 | |||
| [2] | Północna Grecja | 2.1 | ||
| Kreta | 1.9 | |||
| Luo Kenia | 1.7 | 2 | ||
| Nandi Kenia | 1.4 | 2 | ||
| Omańska Arabia | 1.4 | |||
| język japoński | 0,1 | |||
| 1 Cw*0701 (Eur.), ²Cw*0704 (Afr.) | ||||