Hepaciwirus A
Klasyfikacja wirusów | |
---|---|
Hepacivirus A | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Rybowiria |
Królestwo: | Orthornawirusy |
Gromada: | Kitrinoviricota |
Klasa: | Flasuviricetes |
Zamówienie: | amarillowirusy |
Rodzina: | Flaviviridae |
Rodzaj: | hepaciwirus |
Gatunek: |
Hepaciwirus A
|
Synonimy | |
|
Hepacivirus A lub psi hepaciwirus (CHV) lub koński hepaciwirus (EHV) jest jednoniciowym wirusem RNA o dodatniej czułości z rodzaju Hepacivirus . Zaraża psy i konie oraz powoduje infekcje płuc u psów. W przeciwieństwie do pokrewnego wirusa zapalenia wątroby typu C , nie wiadomo, czy powoduje zapalenie wątroby u któregokolwiek z gospodarzy.
Historia
Wirus został wyizolowany w 2011 roku od wielu psów cierpiących na infekcje dróg oddechowych. Później od koni w różnych miejscach wyizolowano odrębne linie rodowe. [ potrzebne źródło ]
Genom
Od 2012 roku genom nie został jeszcze w pełni zsekwencjonowany. Dostępna sekwencja ma długość około 6500 nukleotydów . Przewiduje się, że ma poliproteinę , którą można rozszczepić na 10 mniejszych białek. W genomie istnieje „ śliska sekwencja ” – A 5 NNA 5 – która może kodować zaprogramowane przesunięcie ramki odczytu . Koduje dwa białka otoczki (E1 i E2) oraz proteazy cysteinowe i serynowe . [ potrzebne źródło ]
Całkowita zawartość G+C wynosi 50,7%. [ potrzebne źródło ]
Ewolucja
Wydaje się, że wirus wyewoluował z wirusa zapalenia wątroby typu C między 500 a 1000 lat temu. [ potrzebne źródło ]
Linie końskie (EHV) są bardziej zróżnicowane niż linie rodowe psów (CHV), co sugeruje, że te pierwsze są przodkami tych drugich. Wydaje się, że wirus CHV powstał w wyniku transmisji międzygatunkowej z koni na psy około 1970 r. Pochodzenie EHV nie jest znane, ale wydaje się, że zarówno wirus EHV, jak i wirus zapalenia wątroby typu C pochodzą z oddzielnych przypadków przenoszenia międzygatunkowego ze wspólnego źródła.