Heyndrickxia
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Heyndrickxia | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: |
Heyndrickxia Gupta i in. 2020
|
| Gatunek | |
Informacje na podstawie LPSN 2021 |
|
Heyndrickxia to rodzaj Gram-dodatnich bakterii w kształcie pałeczek (z wyjątkiem Heyndrickxia sporothermodurany , które barwią Gram-ujemne) z rodziny Bacillaceae z rzędu Bacillales . Gatunkiem typowym dla tego rodzaju jest Heyndrickxia oleronia .
Członkowie Heyndrickxia byli pierwotnie przypisani do rodzaju Bacillus . Polifiletyczny charakter i niejasne pokrewieństwa ewolucyjne rodzaju Bacillus od dawna jest tematem w środowisku naukowym. Składał się z wielu niespokrewnionych gatunków o zróżnicowanym zakresie cech biochemicznych ze względu na niejasne kryteria (takie jak zdolność do tworzenia przetrwalników w warunkach tlenowych) stosowane do przypisania gatunków do tego rodzaju. Przeprowadzono wiele badań filogenetycznych i porównawczych analiz genomicznych w celu wyjaśnienia taksonomii rodzaju, co doprowadziło do ograniczenia Bacillus tylko do gatunków blisko spokrewnionych z Bacillus subtilis i Bacillus cereus oraz ustanowienia wielu nowych rodzajów, takich jak Virgibacillus , Solibacillus , Brevibacillus i Ectobacillus .
Nazwa Heydrickxia została wybrana na cześć profesora Marca Heyndrickxa (University of Gent) za jego wkład w dziedzinie mikrobiologii i badania nad gatunkami Bacillus .
Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne
Członkowie rodzaju Heyndrickxia to bakterie tlenowe , tworzące przetrwalniki . Większość gatunków jest ruchliwa i ogólnie katalazo- i oksydazo -dodatnia. Głównym źródłem izolacji dla tego rodzaju są mleczarnie lub zakłady produkujące nabiał, na przykład w surowym mleku i paszach treściwych dla bydła. Heyndrickxia może przetrwać w temperaturach od 20 do 55 ° C (68 do 131 ° F), ale optymalny wzrost występuje w zakresie 30–45 ° C (86–113 ° F).
Pięć konserwatywnych indeli sygnaturowych (CSI) zostało zidentyfikowanych jako wyłączne dla tego rodzaju w białkach stadium V sporulacji, białku D, reduktazie N-acetylo-gamma-glutamylofosforanowej , białku układu wydzielniczego typu II/IV, O-sukcynylotransferazie homoseryny i pierścieniu przegrody regulator formacji EzrA, który można wykorzystać jako wiarygodne sygnatury molekularne do odróżnienia gatunków Heyndrickxia od innych rodzajów i bakterii Bacillaceae .
Taksonomia
Heyndrickxia występują łącznie 3 gatunki z ważnie opublikowanymi nazwami . Członkowie tego rodzaju tworzą monofiletyczną w różnych drzewach filogenetycznych utworzonych na podstawie połączonych sekwencji z różnych zbiorów danych konserwowanych białek i sekwencji genomu 16S rRNA. Monofiletyczny charakter tego rodzaju znajduje się również w bazie danych taksonomii genomu .
Ponadto nieważnie opublikowany gatunek „Bacillus obstructivis” również rozgałęzia się z przedstawicielami Heyndrickxia , a także ma wspólne unikalne markery molekularne specyficzne dla rodzaju. Jednak przeniesienie tego gatunku do kladu nie zostało zaproponowane ze względu na brak informacji o szczepach kulturowych. Wskazuje to na potrzebę przeprowadzania okresowej analizy klasyfikacji tego rodzaju, gdy dostępnych będzie więcej informacji o sekwencji genomu i plamach hodowlanych.