ITPA

ITPA
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, C20orf37, HLC14-06-P, dJ794I6.3, My049, ITPaza, NTPaza, trifosfataza inozynowa,
identyfikatory zewnętrzne DEE35
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Pirofosfataza trifosforanu inozyny jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen ITPA , gen rdgB u bakterii E. coli i gen HAM1 u drożdży S. cerevisiae ; białko jest również kodowane przez niektóre wirusy RNA z Potyviridae . Dla tego genu znaleziono dwa warianty transkryptu kodujące dwie różne izoformy. Zidentyfikowano również co najmniej dwa inne warianty transkryptu, które prawdopodobnie są raczej regulatorowe niż kodujące białka.

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen hydrolizuje trifosforan inozyny i trifosforan dezoksyinozyny do nukleotydu monofosforanowego i difosforanu . Enzym posiada wieloraką specyficzność substratową i działa na inne nukleotydy, w tym trifosforan ksantozyny i trifosforan dezoksyksantozyny. Kodowane białko, które należy do rodziny białek HAM1 NTPazy , znajduje się w cytoplazmie i działa jako homodimer .

Znaczenie kliniczne

Defekty w kodowanym białku mogą skutkować niedoborem pirofosforylazy trifosforanu inozyny. Enzym ITPaza defosforyluje trifosforan rybawiryny in vitro do monofosforanu rybawiryny, a zmniejszona aktywność enzymatyczna ITPazy obecna u 30% ludzi nasila mutagenezę wirusa zapalenia wątroby typu C. Warianty genów przewidujące zmniejszoną przewidywaną aktywność ITPazy były związane ze zmniejszonym ryzykiem niedokrwistości indukowanej rybawiryną, zwiększonym ryzykiem małopłytkowości, niższymi stężeniami rybawiryny, a także zmniejszonym ryzykiem nawrotu podobnym do rybawiryny po terapii opartej na interferonie wirusa zapalenia wątroby typu C (HCV) zakażenie genotypem 2 lub 3.

Czytanie

•   Holmes SL, Turner BM, Hirschhorn K (1979). „Ludzka trifosfataza inozynowa: właściwości katalityczne i badania populacyjne”. Clin. Chim. Akta . 97 (2–3): 143–53. doi : 10.1016/0009-8981(79)90410-8 . PMID 487601 .
•   Fraser JH, Meyers H, Henderson JF i in. (1976). „Indywidualna zmienność akumulacji trifosforanu inozyny w ludzkich erytrocytach”. Clin. Biochem . 8 (6): 353–64. doi : 10.1016/S0009-9120(75)93685-1 . PMID 1204209 .
•   Clawson GA, Song YL, Schwartz AM i in. (1992). „Interakcja białka Rev ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu I z aktywnością trifosfatazy nukleozydowej rusztowania jądrowego”. Wzrost komórek różni się . 2 (11): 575–82. PMID 1667585 .
•   Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J i in. (2002). „Sekwencja DNA i analiza porównawcza ludzkiego chromosomu 20” . Natura . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 .
•    Sumi S, Marinaki AM, Arenas M i in. (2002). „Genetyczne podstawy niedoboru pirofosfohydrolazy trifosforanu inozyny”. Szum. Genet . 111 (4–5): 360–7. doi : 10.1007/s00439-002-0798-z . PMID 12384777 . S2CID 24240940 .
•   Cao H, Hegele RA (2003). „Polimorfizmy DNA w ITPA, w tym podstawa niedoboru trifosfatazy inozynowej” . J. Hum. Genet . 47 (11): 620–2. doi : 10.1007/s100380200095 . PMID 12436200 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Marinaki AM, Duley JA, Arenas M i in. (2005). „Mutacja w genie ITPA przewiduje nietolerancję azatiopryny”. Nukleozydy Nukleotydy Kwasy nukleinowe . 23 (8–9): 1393–7. doi : 10.1081/NCN-200027639 . PMID 15571265 . S2CID 86308163 .
•    Marinaki AM, Sumi S, Arenas M i in. (2005). „Częstotliwość alleli polimorfizmów genu pirofosfatazy trifosforanu inozyny w populacji japońskiej”. Nukleozydy Nukleotydy Kwasy nukleinowe . 23 (8–9): 1399–401. doi : 10.1081/NCN-200027641 . PMID 15571266 . S2CID 36126159 .
•   Maeda T, Sumi S, Ueta A i in. (2005). „Genetyczne podstawy niedoboru pirofosfohydrolazy trifosforanu inozyny w populacji japońskiej”. Mol. Genet. Metab . 85 (4): 271–9. doi : 10.1016/j.ymgme.2005.03.011 . PMID 15946879 .
•    Breen DP, Marinaki AM, Arenas M, Hayes PC (2005). „Związek farmakogenetyczny z działaniami niepożądanymi leków na leczenie immunosupresyjne azatiopryną po przeszczepie wątroby” . Transpl . wątroby 11 (7): 826–33. doi : 10.1002/lt.20377 . PMID 15973722 . S2CID 9301778 .
•    Porta J, Kolar C, Kozmin SG i in. (2006). „Struktura formy rombowej ludzkiej pirofosfatazy trifosforanu inozyny” . Acta Crystallographica Sekcja F . 62 (Pt 11): 1076–81. doi : 10.1107/S1744309106041790 . PMC 2225220 . PMID 17077483 .
•   Arenas M, Duley J, Sumi S i in. (2007). „Warianty sekwencji ITPA c.94C>A i g.IVS2+21A>C przyczyniają się do nieprawidłowego składania genu ITPA” . Biochim. Biofiza. Akta . 1772 (1): 96–102. doi : 10.1016/j.bbadis.2006.10.006 . PMID 17113761 .
•   Stenmark P, Kursula P, Flodin S i in. (2007). „Struktura krystaliczna ludzkiej trifosfatazy inozynowej. Wiązanie substratu i implikacje mutacji niedoboru trifosfatazy inozynowej P32T” . J. Biol. chemia . 282 (5): 3182–7. doi : 10.1074/jbc.M609838200 . PMID 17138556 .
•    Atanasova S, Shipkova M, Svinarov D i in. (2007). „Analiza korelacji fenotyp-genotyp ITPA w populacji bułgarskiej ujawniła nowy wariant genu w eksonie 6”. Monitorowanie leków terapeutycznych . 29 (1): 6–10. doi : 10.1097/FTD.0b013e3180308554 . PMID 17304144 . S2CID 7286658 .