Dehydrataza fosforanowa imidazologlicerolu
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| dehydratazy imidazologlicerolowo-fosforanowej | |||||||||
 | |||||||||
| nr WE | 4.2.1.19 | ||||||||
| nr CAS | 9024-35-5 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| dehydratazy fosforanu imidazologlicerolu | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 dehydratazy fosforanu imidazologlicerolu
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | IGPD | ||||||||
| Pfam | PF00475 | ||||||||
| Klan Pfam | CL0329 | ||||||||
| InterPro | IPR000807 | ||||||||
| PROZYTA | PDOC00738 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhy / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Enzym dehydrataza fosforanu imidazologlicerolu ( EC 4.2.1.19 ) katalizuje reakcję chemiczną
- D -erytro-1- (imidazol-4-ilo) 3-fosforan glicerolu imidazol -4-ilo) -2-oksopropylofosforan + H2O
Enzym ten należy do rodziny liaz , w szczególności hydroliaz, które rozszczepiają wiązania węgiel-tlen. Nazwa systematyczna tej klasy enzymów to hydroliaza D - erytro -1-(imidazol-4-ilo)glicerol-3-fosforanu [tworząca 3-(imidazol-4-ilo)-2-oksopropylo-fosforan] . Inne powszechnie używane nazwy obejmują dehydratazę IGP i hydroliazę 3-fosforanu D - erytro -1-(imidazol-4-ilo)glicerolu . Enzym ten bierze udział w metabolizmie histydyny ponieważ bierze udział w 6. etapie biosyntezy histydyny jako część dziewięcioetapowego szlaku cyklicznego.
Istnieją dwie izoformy IGPD; IGPD1 i IGPD2. Różne izoformy są wysoce konserwatywne i różnią się tylko 8 aminokwasami. Te subtelne różnice wpływają jednak na ich aktywność, ale jak dotąd nie wiadomo w jaki sposób.
W większości organizmów IGPD jest białkiem jednofunkcyjnym o masie około 22 do 29 kD . W niektórych bakteriach, takich jak Escherichia coli , domena C-końcowa białka dwufunkcyjnego zawiera domenę histydynolo-fosfatazy . W E. coli jest to białko kodowane przez gen hisB .
Zahamowanie
Niektóre związki hamujące IGPD były stosowane jako herbicydy , ponieważ zwierzęta nie mają tego białka. Jednym z takich inhibitorów jest 3-amino-1,2,4-triazol (3-AT), który był również stosowany jako kompetycyjny inhibitor produktu drożdżowego genu HIS3 (kolejny IGPD), np . układ hybrydowy .
Studia strukturalne
Pod koniec 2007 roku rozwiązano 3 struktury dla tej klasy enzymów o kodach dostępu PDB 1RHY , 2AE8 i 2F1D .
Dalsza lektura
- AMES BN (1957). „Biosynteza histydyny; dehydraza fosforanowa D-erytro-imidazologlicerolu”. J. Biol. chemia . 228 (1): 131–43. PMID 13475302 .
