LIMS1

LIMS1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, PINCH, PINCH-1, PINCH1, domena palca cynkowego LIM zawierająca 1
identyfikator zewnętrzny
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko 1 domeny zawierającej antygen podobny do antygenu komórek starzejących się jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen LIMS1 .

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen jest białkiem adaptorowym, które zawiera pięć domen LIM, czyli podwójne palce cynkowe. Białko jest prawdopodobnie zaangażowane w sygnalizację integryny poprzez interakcję, w której pośredniczy domena LIM, z kinazą połączoną z integryną, znajdującą się w ogniskowych płytkach adhezyjnych. Uważa się również, że działa jako mostek łączący kinazę połączoną z integryną z białkiem adaptorowym 2 NCK, które bierze udział w szlakach sygnałowych kinazy receptora czynnika wzrostu. Jego lokalizacja na obrzeżach rozprzestrzeniających się komórek sugeruje również, że białko to może odgrywać rolę w adhezji lub rozprzestrzenianiu się komórek za pośrednictwem integryny.

Interakcje

Wykazano, że LIMS1 oddziałuje z kinazą połączoną z integryną i NCK2 .

Dalsza lektura

•    Tu Y, Li F, Wu C (1998). „Nck-2, nowe białko adaptorowe zawierające homologię Src2 / 3, które oddziałuje z białkiem PINCH zawierającym tylko LIM i składnikami szlaków sygnałowych kinazy receptora czynnika wzrostu” . Mol. Biol. komórka . 9 (12): 3367–82. doi : 10.1091/mbc.9.12.3367 . PMC25640 . _ PMID 9843575 .
•   Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). „Antygeny rozpoznawane przez autologiczne przeciwciała u pacjentów z rakiem nerkowokomórkowym” . Int. J. Rak . 83 (4): 456–64. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5 . PMID 10508479 .
•   Velyvis A, Yang Yang, Wu C, Qin J (2001). „Struktura rozwiązania domeny adaptera adhezji ogniskowej PINCH LIM1 i charakterystyka jej interakcji z domeną powtórzeń ankyrynowych kinazy sprzężonej z integryną” . J. Biol. chemia . 276 (7): 4932–9. doi : 10.1074/jbc.M007632200 . PMID 11078733 .
•    Tu Y, Huang Y, Zhang Y, Hua Y, Wu C (2001). „Nowe ogniskowe białko adhezyjne, które oddziałuje z kinazą połączoną z integryną i reguluje adhezję i rozprzestrzenianie się komórek” . J. Cell Biol . 153 (3): 585–98. doi : 10.1083/jcb.153.3.585 . PMC 2190577 . PMID 11331308 .
•   Zhang Y, Chen K, Tu Y, Velyvis A, Yang Y, Qin J, Wu C (2002). „Montaż kompleksu PINCH-ILK-CH-ILKBP poprzedza i jest niezbędny do lokalizacji każdego składnika w miejscach adhezji macierzy komórkowej” . J. Cell Sci . 115 (Pt 24): 4777–86. doi : 10.1242/jcs.00166 . PMID 12432066 .
•    Campana WM, Myers RR, Rearden A (2003). „Identyfikacja PINCH w komórkach Schwanna i neuronach DRG: wahadłowiec i sygnalizacja po uszkodzeniu nerwu”. glia . 41 (3): 213–23. doi : 10.1002/glia.10138 . PMID 12528177 . S2CID 33508275 .
•    Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). „Eksploracja proteomów i analiza przetwarzania białek za pomocą identyfikacji spektrometrii mas posortowanych peptydów N-końcowych”. Nat. Biotechnologia . 21 (5): 566-9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
•    Velyvis A, Vaynberg J, Yang Y, Vinogradova O, Zhang Y, Wu C, Qin J (2003). „Strukturalny i funkcjonalny wgląd w sygnalizację integryn za pośrednictwem domeny PINCH LIM4”. Nat. Struktura. Biol . 10 (7): 558–64. doi : 10.1038/nsb938 . PMID 12794636 . S2CID 175531 .
•   Fukuda T, Chen K, Shi X, Wu C (2003). „PINCH-1 jest obowiązkowym partnerem kinazy połączonej z integryną (ILK) działającej w modulacji kształtu, ruchliwości i przeżywalności komórek” . J. Biol. chemia . 278 (51): 51324–33. doi : 10.1074/jbc.M309122200 . PMID 14551191 .
•    Bock-Marquette I, Saxena A, White MD, Dimaio JM, Srivastava D (2004). „Tymozyna beta4 aktywuje kinazę połączoną z integryną i wspomaga migrację komórek serca, przeżycie i naprawę serca”. Natura . 432 (7016): 466–72. doi : 10.1038/natura03000 . PMID 15565145 . S2CID 4420896 .
•    Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (2005). „Wysokoprzepustowe mapowanie dynamicznej sieci sygnalizacyjnej w komórkach ssaków”. nauka . 307 (5715): 1621–5. Bibcode : 2005Sci...307.1621B . doi : 10.1126/science.1105776 . PMID 15761153 . S2CID 39457788 .
•   Dougherty GW, Chopp T, Qi SM, Cutler ML (2005). „Supresor Ras Rsu-1 wiąże się z domeną LIM 5 białka adaptera PINCH1 i bierze udział w funkcjach związanych z adhezją”. Do potęgi. Rozdz . komórki 306 (1): 168–79. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.01.025 . PMID 15878342 .
•   Xu Z, Fukuda T, Li Y, Zha X, Qin J, Wu C (2005). „Rozbiór molekularny PINCH-1 ujawnia mechanizm sprzęgania i rozłączania modulacji kształtu komórki i przeżycia” . J. Biol. chemia . 280 (30): 27631–7. doi : 10.1074/jbc.M504189200 . PMID 15941716 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173-8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R .    doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .