Lee Altenberga
Lee Altenberga | |
---|---|
Urodzić się | Lee Altenberga |
Narodowość | amerykański |
Alma Mater | Uniwersytet Kalifornijski w Berkeley |
Znany z |
Ewolucja ewolucyjności Zasada redukcji |
Nagrody | Nagroda Onipa`a (2011) |
Kariera naukowa | |
Pola |
Teoria ewolucji Genetyka populacji Algebra liniowa |
Instytucje |
University of Hawaii w Mānoa Konrad Lorenz Institute Duke University Ronin Institute |
Praca dyplomowa | Uogólnienie teorii ewolucji genów modyfikujących (1984) |
Doradca doktorski | Marcusa W. Feldmana |
Inni doradcy akademiccy | Glenysa Thomsona |
Wpływy | Marcus Feldman , Sam Karlin , Michael Conrad , Rupert Riedl , Lawrence Goodwyn , David M. Josephson |
Strona internetowa |
Lee Altenberg jest amerykańskim biologiem teoretycznym . Pracuje na wydziale Wydziałów Informatyki i Informatyki oraz Matematyki na Uniwersytecie Hawajskim w Mānoa . Najbardziej znany jest ze swojej pracy, która pomogła ustalić ewolucję ewoluowalności i modułowości na mapie genotyp-fenotyp jako obszarów badań w biologii ewolucyjnej, z przenoszenia koncepcji teoretycznych między dziedzinami biologii ewolucyjnej i obliczeń ewolucyjnych oraz z jego matematycznego ujednolicenia i uogólnienie modele genów modyfikujących do ewolucji transmisji informacji biologicznych, umieszczające w jednym schemacie matematycznym ewolucję tempa mutacji, tempa rekombinacji, tempa rozmnażania płciowego i tempa rozprzestrzeniania się.
Altenberg jest zastępcą redaktora czasopisma BioSystems i zasiada w radach redakcyjnych czasopism Genetic Programming i Evolvable Machines and Artificial Life oraz w grupie zadaniowej IEEE Computational Intelligence Society ds. Sztucznego życia i złożonych systemów adaptacyjnych.
Edukacja
Altenberg uzyskał tytuł licencjata z genetyki w 1980 roku na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley na podstawie pracy z wyróżnieniem, której doradzał Glenys Thomson, na temat teorii selekcji zależnej od częstotliwości . Uzyskał tytuł doktora. Doktorat z nauk biologicznych w 1985 roku na Uniwersytecie Stanforda z doradcą Marcusem W. Feldmanem z rozprawą, która ujednoliciła modele ewolucji genów modyfikujących.
Kariera
Altenberg odbywał staże podoktoranckie na Uniwersytecie Stanforda, Uniwersytecie Stanowym Karoliny Północnej i Uniwersytecie Duke'a. Podczas stażu podoktoranckiego na Uniwersytecie Duke'a , Altenberg zaoferował tam pierwszy kurs obliczeń ewolucyjnych . Kiedy jego ojciec zachorował na krioglobulinemię , przeniósł się z nim na Hawaje ze względu na wysokie temperatury. W 2002 Altenberg został mianowany profesorem nadzwyczajnym Informatyki i Informatyki na Uniwersytecie Hawajskim w Mānoa . Ponownie zaoferował tam pierwsze kursy obliczeń ewolucyjnych. W 2013 Altenberg był długoterminowym gościem w Mathematical Biosciences Institute na Ohio State University , a w latach 2014-2016 był Senior Fellow w Konrad Lorenz Institute for Evolution and Cognition Research . Rada Regentów Uniwersytetu Hawajskiego zatwierdziła jego awans na profesora zwyczajnego w 2020 r. Od 2013 r. Altenberg jest stypendystą naukowym w Instytucie Ronina .
Badania
Badania Altenberga koncentrują się na odkrywaniu matematycznych zależności w dynamice ewolucji biologicznej i algorytmach ewolucyjnych . Szczególnie interesują go zjawiska wyższego rzędu, takie jak ewolucja ewoluowalności , ewolucja przekazywania informacji genetycznej oraz ewolucja mapy genotyp-fenotyp . Jego głównymi osiągnięciami było (1) ujednolicenie teorii ewolucji systemów genetycznych (szybkości rekombinacji i mutacji) poprzez osadzenie ich w przestrzeni dziedziczenia inkluzywnego, która obejmuje zarówno informacje przestrzenne, jak i kulturowe, oraz (2) rozwinięcie koncepcja zmienności właściwości organizmów jako zjawisk podlegających dynamice ewolucyjnej. Obejmuje to odkrycie mechanizmów, które prowadzą do ewolucji ewoluowalności i modułowości na mapie genotyp-fenotyp.
Matematyczna inkluzywność jego pracy teoretycznej sprawiła, że można ją zastosować do problemów obliczeń ewolucyjnych. Jego praca nad ewolucją transmisji informacji biologicznej wymagała opracowania nowych twierdzeń spektralnych dla operatorów liniowych , w tym unifikacji teorii reakcji-dyfuzji przewidującej ewolucję powolnego rozprzestrzeniania się z przewidywaniami zasady redukcji dla modeli ewolucji tempa mutacji, rekombinacji i migracji. Zastosował teorię spektralną, aby zrozumieć ewolucję odporności na mutacje .
Altenberg wprowadził szereg koncepcji, które zostały przyjęte w kilku dziedzinach:
- wprowadzenie równania Price'a do ewolucyjnej teorii obliczeń
- mechanizmy ewolucji ewoluowalności i modułowości
- pojęciowe rozróżnienie generatywnych i wariacyjnych właściwości mapy genotyp-fenotyp
- Selekcja potomstwa w algorytmach ewolucyjnych
- uogólnienie NK Krajobrazy Stuarta Kauffmana , zastosowane do ewolucji technologicznej
- uogólnienie zasady redukcji na nieskończone przestrzenie wymiarowe, które ujednoliciło modele reakcji-dyfuzji dla ewolucji rozprzestrzeniania się i zostało zastosowane do modeli epidemii.
Praca środowiskowa i społeczna
- Historia zapomnianego orędownictwa spółdzielni pracowniczych przez Lelanda Stanforda
- Rozporządzenie dotyczące zanieczyszczenia światłem dla Maui na Hawajach
- Ochrona nizinnych suchych rodzimych lasów na Maui na Hawajach
- Podczas pandemii SARS-CoV-2 służył w Hawai`i Pandemic Applied Modeling Workgroup.
Nagrody i wyróżnienia
- Delegat Kalifornii na National Youth Science Camp w 1975 roku
- Uniwersytetu Kalifornijskiego w latach 1975-1979
- Wybrany do Phi Beta Kappa w 1979 roku
- Bachelor of Arts z wyróżnieniem w ramach stypendium ogólnego, University of California, Berkeley, 1980
- Stypendysta Dziekana Wydziału Lekarskiego Uniwersytetu Stanforda w latach 1985-1986
- Przewodniczący Native Hawaiian Plant Society na Maui 2005-2007
- Nagroda Onipa`a w 2011 r., przyznana przez kapitułę Sierra Club na Hawajach , za jego pracę nad uchwaleniem przepisów zapobiegających zanieczyszczeniu światłem na Maui i zachowanie na zawsze zagrożonego hawajskiego siedliska suchych lasów nizinnych na Maui.
- Senior Fellow of the Konrad Lorenz Institute for Evolution and Cognition Research 2014-2016
- Wywiad w ramach projektu historii mówionej IEEE Computational Intelligence Society w 2017 r
- Członek Foundational Questions Institute (FQXi) w 2020 roku
Towarzystwa zawodowe
Altenberg jest dożywotnim członkiem: