Lee Altenberga

Lee Altenberga
Urodzić się
Lee Altenberga
Narodowość amerykański
Alma Mater Uniwersytet Kalifornijski w Berkeley
Znany z
Ewolucja ewolucyjności Zasada redukcji
Nagrody Nagroda Onipa`a (2011)
Kariera naukowa
Pola

Teoria ewolucji Genetyka populacji Algebra liniowa
Instytucje


University of Hawaii w Mānoa Konrad Lorenz Institute Duke University Ronin Institute
Praca dyplomowa   Uogólnienie teorii ewolucji genów modyfikujących (1984)
Doradca doktorski Marcusa W. Feldmana
Inni doradcy akademiccy Glenysa Thomsona
Wpływy Marcus Feldman , Sam Karlin , Michael Conrad , Rupert Riedl , Lawrence Goodwyn , David M. Josephson
Strona internetowa dynamics.org / Altenberg /

Lee Altenberg jest amerykańskim biologiem teoretycznym . Pracuje na wydziale Wydziałów Informatyki i Informatyki oraz Matematyki na Uniwersytecie Hawajskim w Mānoa . Najbardziej znany jest ze swojej pracy, która pomogła ustalić ewolucję ewoluowalności i modułowości na mapie genotyp-fenotyp jako obszarów badań w biologii ewolucyjnej, z przenoszenia koncepcji teoretycznych między dziedzinami biologii ewolucyjnej i obliczeń ewolucyjnych oraz z jego matematycznego ujednolicenia i uogólnienie modele genów modyfikujących do ewolucji transmisji informacji biologicznych, umieszczające w jednym schemacie matematycznym ewolucję tempa mutacji, tempa rekombinacji, tempa rozmnażania płciowego i tempa rozprzestrzeniania się.

Altenberg jest zastępcą redaktora czasopisma BioSystems i zasiada w radach redakcyjnych czasopism Genetic Programming i Evolvable Machines and Artificial Life oraz w grupie zadaniowej IEEE Computational Intelligence Society ds. Sztucznego życia i złożonych systemów adaptacyjnych.

Edukacja

Altenberg uzyskał tytuł licencjata z genetyki w 1980 roku na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley na podstawie pracy z wyróżnieniem, której doradzał Glenys Thomson, na temat teorii selekcji zależnej od częstotliwości . Uzyskał tytuł doktora. Doktorat z nauk biologicznych w 1985 roku na Uniwersytecie Stanforda z doradcą Marcusem W. Feldmanem z rozprawą, która ujednoliciła modele ewolucji genów modyfikujących.

Kariera

Altenberg odbywał staże podoktoranckie na Uniwersytecie Stanforda, Uniwersytecie Stanowym Karoliny Północnej i Uniwersytecie Duke'a. Podczas stażu podoktoranckiego na Uniwersytecie Duke'a , Altenberg zaoferował tam pierwszy kurs obliczeń ewolucyjnych . Kiedy jego ojciec zachorował na krioglobulinemię , przeniósł się z nim na Hawaje ze względu na wysokie temperatury. W 2002 Altenberg został mianowany profesorem nadzwyczajnym Informatyki i Informatyki na Uniwersytecie Hawajskim w Mānoa . Ponownie zaoferował tam pierwsze kursy obliczeń ewolucyjnych. W 2013 Altenberg był długoterminowym gościem w Mathematical Biosciences Institute na Ohio State University , a w latach 2014-2016 był Senior Fellow w Konrad Lorenz Institute for Evolution and Cognition Research . Rada Regentów Uniwersytetu Hawajskiego zatwierdziła jego awans na profesora zwyczajnego w 2020 r. Od 2013 r. Altenberg jest stypendystą naukowym w Instytucie Ronina .

Badania

Badania Altenberga koncentrują się na odkrywaniu matematycznych zależności w dynamice ewolucji biologicznej i algorytmach ewolucyjnych . Szczególnie interesują go zjawiska wyższego rzędu, takie jak ewolucja ewoluowalności , ewolucja przekazywania informacji genetycznej oraz ewolucja mapy genotyp-fenotyp . Jego głównymi osiągnięciami było (1) ujednolicenie teorii ewolucji systemów genetycznych (szybkości rekombinacji i mutacji) poprzez osadzenie ich w przestrzeni dziedziczenia inkluzywnego, która obejmuje zarówno informacje przestrzenne, jak i kulturowe, oraz (2) rozwinięcie koncepcja zmienności właściwości organizmów jako zjawisk podlegających dynamice ewolucyjnej. Obejmuje to odkrycie mechanizmów, które prowadzą do ewolucji ewoluowalności i modułowości na mapie genotyp-fenotyp.

Matematyczna inkluzywność jego pracy teoretycznej sprawiła, że ​​można ją zastosować do problemów obliczeń ewolucyjnych. Jego praca nad ewolucją transmisji informacji biologicznej wymagała opracowania nowych twierdzeń spektralnych dla operatorów liniowych , w tym unifikacji teorii reakcji-dyfuzji przewidującej ewolucję powolnego rozprzestrzeniania się z przewidywaniami zasady redukcji dla modeli ewolucji tempa mutacji, rekombinacji i migracji. Zastosował teorię spektralną, aby zrozumieć ewolucję odporności na mutacje .

Altenberg wprowadził szereg koncepcji, które zostały przyjęte w kilku dziedzinach:

  • wprowadzenie równania Price'a do ewolucyjnej teorii obliczeń
  • mechanizmy ewolucji ewoluowalności i modułowości
  • pojęciowe rozróżnienie generatywnych i wariacyjnych właściwości mapy genotyp-fenotyp
  • Selekcja potomstwa w algorytmach ewolucyjnych
  • uogólnienie NK Krajobrazy Stuarta Kauffmana , zastosowane do ewolucji technologicznej
  • uogólnienie zasady redukcji na nieskończone przestrzenie wymiarowe, które ujednoliciło modele reakcji-dyfuzji dla ewolucji rozprzestrzeniania się i zostało zastosowane do modeli epidemii.

Praca środowiskowa i społeczna

Nagrody i wyróżnienia

Towarzystwa zawodowe

Altenberg jest dożywotnim członkiem:

Linki zewnętrzne