MBD1

MBD1
Protein MBD1 PDB 1d9n.png
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Identyfikatory
, CXXC3, PCM1, RFT, białko domeny wiążącej metylo-CpG 1
Identyfikatory zewnętrzne
ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (białko)
Lokalizacja (UCSC)
PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko 1 domeny wiążącej metylo-CpG jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen MBD1 . Białko kodowane przez MBD1 wiąże się z metylowanymi sekwencjami DNA iw ten sposób wpływa na transkrypcję . Wiąże się z różnymi metylowanymi sekwencjami i wydaje się pośredniczyć w represji ekspresji genów. Wykazano, że odgrywa rolę w modyfikacji chromatyny poprzez interakcję z metylotransferazą histonową H3K9 SETDB1. H3K9me3 to represyjna modyfikacja.

Funkcjonować

Metylacja DNA jest główną modyfikacją genomów eukariotycznych i odgrywa zasadniczą rolę w rozwoju ssaków. Ludzkie białka MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 i MBD4 obejmują rodzinę białek jądrowych spokrewnionych obecnością w każdej domenie wiążącej metylo-CpG (MBD). Każde z tych białek, z wyjątkiem MBD3, jest zdolne do swoistego wiązania się z metylowanym DNA. MECP2, MBD1 i MBD2 mogą również tłumić transkrypcję z metylowanych promotorów genów. Pięć wariantów transkryptu MBD1 jest generowanych przez alternatywny splicing, w wyniku czego powstają izoformy białka zawierające jedną domenę MBD, dwie do trzech domen bogatych w cysteinę (CXXC) i pewne różnice w końcu COOH. Wszystkie pięć wariantów transkryptu tłumi transkrypcję z metylowanych promotorów; ponadto warianty z trzema domenami CXXC również hamują aktywność niemetylowanego promotora. MBD1 i MBD2 mapują się bardzo blisko siebie na chromosomie 18q21.

Interakcje

Wykazano, że MBD1 oddziałuje z ATF7IP , CBX5 , CHAF1A i SUV39H1 .

Dalsza lektura