Mycobacteroides
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Mycobacteroides | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | promieniowiec |
| Klasa: | promieniowce |
| Zamówienie: | mykobakterie |
| Rodzina: | Mycobacteriaceae |
| Rodzaj: |
Mycobacteroides Gupta i in. 2018 |
| Wpisz gatunek | |
|
Mycobacteroides abscessus (Moore i Frerichs 1953) Gupta i in. 2018
|
|
| Gatunek | |
|
|
| Synonimy | |
|
|
Mycobacteroides to rodzaj Gram-dodatnich bakterii w kształcie pałeczek z rodziny Mycobacteriaceae z rzędu Mycobacteriales .
Członkowie Mycobacteroides zostali odgraniczeni od większego rodzaju Mycobacterium w 2018 roku przez Gupta i in. na podstawie dowodów z różnych drzew filogenetycznych skonstruowanych na podstawie konserwatywnych sekwencji genomu, porównawczych analiz genomicznych i średnich wartości identyczności aminokwasów. Oprócz tego rodzaju w badaniu zaproponowano podział Mycobacterium na łącznie pięć odrębnych rodzajów, co spotkało się z pewnym oporem części społeczności naukowej. Oporność opierała się na tym, że Mycobacterium zawiera kilka istotnych klinicznie gatunków, a zmiany nazwy mogą powodować zamieszanie wśród klinicystów i innych badaczy.
W 2020 roku Yamada i in. przeanalizowali podstawowe właściwości morfologiczne nowych rodzajów, w tym średnicę komórki, długość komórki, obwód komórki, okrągłość komórki i współczynnik kształtu, i ustalili, że istnieją znaczne różnice między pięcioma rodzajami, wspierając w ten sposób nowy podział.
Nazwa Mycobacteroides pochodzi od łacińskiego rzeczownika Mycobacterium (odnoszącego się do rodzaju bakterii) i łacińskiego przyrostka „- oides ” (co oznacza „podobny”). Razem nazwa odnosi się do rodzaju przypominającego Mycobacterium .
Charakterystyka biochemiczna i sygnatury molekularne
Członkowie Mycobacteroides to szybko rosnące bakterie, tworzące kolonie w mniej niż siedem dni. Niektóre cechy tego rodzaju obejmują: brak reduktazy azotanowej, pobieranie żelaza i wykazywanie oporności na polimyksynę B. Optymalna temperatura wzrostu wynosi 30 ° C, chociaż wzrost może wystąpić w temperaturze 35 ° C. Członkowie wykazują również pozytywny wynik 3-dniowego testu arylosulfatazy. Rozmiar genomu Mycobacteroides gatunki mają między 4,5–5,6 Mbp, a ich zawartość G + C wynosi między 63,9–64,8% molowych. Niektóre gatunki są patogenne i wykazano, że biorą udział w infekcjach płuc, skóry i tkanek miękkich. Ponadto niektóre gatunki są również odporne na kilka leków przeciwdrobnoustrojowych.
Zidentyfikowano 27 konserwatywnych indeli sygnaturowych (CSI) jako unikalnie obecnych w tym rodzaju w białkach, takich jak: helikaza pudełkowa DEAD/DEAH , transporter anionów , białko błonowe , adenylotransferaza nikotynianowo-nukleotydowa , liaza estrowa CoA, fosforybozylotransferaza uracylowa , L-histydyna N ( alfa)-metylotransferaza, białko zawierające domenę DUF58, podjednostka G oksydoredukatazy NADH-chinonu , helikaza zależna od ATP, tRNA (cytydyno(34)-2′- O )-metylotransferaza , transaminaza glutamino-fruktozo-6-fosforanowa (izomeryzująca) , podatna na błędy polimeraza DNA i difosfokinaza 2-amino-4-hydroksy-6-hydroksymetylodihydropterydyny . Te sygnatury molekularne zostały zidentyfikowane poprzez analizy sekwencji genomu z Mycobacteroides i zapewniają wiarygodną metodę molekularną do odróżnienia tego rodzaju od innych rodzajów w rodzinie Mycobacteriaceae i wszystkich innych bakterii. Ponadto dla tego rodzaju zidentyfikowano 24 unikalne konserwatywne białka sygnaturowe (CSP).
Sekwencjonowanie całego genomu jest najlepszym sposobem na odróżnienie członków tego rodzaju od siebie.
Filogeneza
Filogeneza Mycobacteroides opiera się na analizie całego genomu.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||