Mycobacteroides abscessus
Mycobacteroides abscessus | |
---|---|
GD01 szczep Mycobacteroides abscessus wyizolowany od pacjenta | |
Klasyfikacja naukowa | |
Domena: | Bakteria |
Gromada: | promieniowiec |
Klasa: | promieniowce |
Zamówienie: | mykobakterie |
Rodzina: | Mycobacteriaceae |
Rodzaj: | Mycobacteroides |
Gatunek: |
M. abscessus
|
Nazwa dwumianowa | |
Mycobacteroides abscessus (Moore i Frerichs 1953) Gupta i in. 2018
|
|
Typ szczep | |
ATCC 19977 CCUG 20993 CIP 104536 DSM 43491 DSM 44196 Hauduroy L948 JCM 13569 L948 NCTC 13031 TMC 1543 |
|
Podgatunek | |
|
|
Synonimy | |
|
Mycobacteroides abscessus (dawniej Mycobacterium abscessus ) to gatunek szybko rosnących, wielolekoopornych , niegruźliczych prątków , które są powszechnym zanieczyszczeniem gleby i wody. Chociaż M. abscessus najczęściej powoduje przewlekłą infekcję płuc oraz infekcję skóry i tkanek miękkich (SSTI), może również powodować infekcję prawie wszystkich narządów ludzkich, głównie u pacjentów z osłabionym układem odpornościowym . Wśród gatunków NTM odpowiedzialnych za chorobę, infekcję wywołaną przez M. abscessus złożone są trudniejsze do leczenia ze względu na oporność na leki przeciwdrobnoustrojowe .
Opis
Mycobacteroides abscessus to Gram-dodatnie , nieruchome, kwasoodporne pałeczki o długości około 1,0–2,5 µm i szerokości 0,5 µm. Mogą tworzyć kolonie na podłożu Löwensteina-Jensena , które wydają się gładkie lub szorstkie, białe lub szarawe i niefotochromogeniczne . [ potrzebne źródło ]
Etymologia
Abscessus pochodzi od ropni . Jest to łacińskie słowo pochodzące od ab- („dalej”) + cedere („iść”), ponieważ starożytna medyczna koncepcja głosiła, że przejawem czterech humorów jest wydostawanie się ropy z ciała. M. abscessus został po raz pierwszy wyizolowany z ropni pośladkowych u 62-letniej pacjentki, która w dzieciństwie doznała urazu kolana i 48 lat później miała rozsianą infekcję. Gatunek M.bolletii , który został po raz pierwszy opisany w 2006 roku, nosi imię zmarłego wybitnego francuskiego mikrobiologa i taksonomisty Claude'a Bolleta. [ potrzebne źródło ]
Fizjologia
M. abscessus wykazuje wzrost w 28 i 37 °C po 7 dniach, ale nie w 43 °C. Może rosnąć na agarze MacConkeya w temperaturze 28°C, a nawet 37°C. Wykazuje tolerancję na pożywkę solankową (5% NaCl) i 500 mg/L hydroksyloaminy (pożywka jajowa Ogawa) i 0,2% pikrynianu (pożywka agarowa Sauton). Wykazano, że szczepy tego gatunku rozkładają antybiotyk p -aminosalicylan . Wykazano również, że M. abscessus wytwarza arylosulfatazę , ale nie reduktazę azotanową i hydrolazę Tween 80. Pokazuje negatywny wynik testu wychwytu żelaza i brak użycia fruktozy , glukozy , szczawianu lub cytrynianu jako jedynych źródeł węgla. [ potrzebne źródło ]
Charakterystyka różnicowa
M. abscessus i M. chelonae można odróżnić od M. fortuitum lub M. peregrinum na podstawie ich niezdolności do redukcji azotanów i pobierania żelaza. Tolerancja na 5% NaCl w podłożu Löwensteina-Jensena, tolerancja na 0,2% pikrynianu w agarze Sautona i niestosowanie cytrynianu jako jedynego źródła węgla to cechy odróżniające M. abscessus od M. chelonae . M. abscessus i M. chelonae sequevar I mają identyczną sekwencję w regionie 54-510 16S rRNA , chociaż oba gatunki można rozróżnić na podstawie sekwencji genów hsp65 , ITS lub rpoB . [ potrzebne źródło ]
Genetyka
Szkic sekwencji genomu M. abscessus subsp. bolletii BD T została zakończona w 2012 roku. Od tego czasu zsekwencjonowano genomy wielu szczepów tego podgatunku , co doprowadziło do wyjaśnienia granic między podgatunkami. W 1992 roku M. abscessus został po raz pierwszy uznany za odrębny gatunek. W 2006 roku grupa ta została podzielona na trzy podgatunki: M. a. abscessus , M. a. bolletii i M. a. masowy . W 2011 roku te dwa ostatnie zostały na krótko połączone w jeden podgatunek, ale następnie zostały ponownie rozdzielone po większej dostępności danych dotyczących sekwencji genomu, które wykazały, że trzy podgatunki utworzyły genetycznie odrębne grupy. Zaproponowano M. bolletii i M. massiliense jako gatunków unikalnych.
Te odrębne grupy odpowiadają również ważnym różnicom biologicznym. Klinicznie istotne różnice obejmują różną wrażliwość na antybiotyki. MA ropień i M. a. bolletii posiadają wspólny gen oporności na antybiotyki , który nadaje oporność na antybiotyki makrolidowe , podczas gdy M. a. massiliense ma niefunkcjonalną kopię, więc jest bardziej podatny na antybiotyki i łatwiejszy w leczeniu.
Patogeneza
M. abscessus może powodować choroby płuc , infekcje skóry, infekcje ośrodkowego układu nerwowego , bakteriemię , infekcje oczu i inne, mniej powszechne choroby.
Przewlekła choroba płuc występuje najczęściej u podatnych gospodarzy z chorobami płuc, takimi jak mukowiscydoza , rozstrzenie oskrzeli i wcześniejsza gruźlica . Objawy kliniczne infekcji płuc różnią się zakresem i intensywnością, ale często obejmują przewlekły kaszel, często z ropną plwociną. Może również występować krwioplucie . Objawy ogólnoustrojowe obejmują złe samopoczucie , zmęczenie i utratę masy ciała w zaawansowanej chorobie. Rozpoznanie M. abscessus wymaga obecności objawów, nieprawidłowości radiologicznych i kultury mikrobiologiczne . [ potrzebne źródło ]
M. abscessus może powodować infekcje skóry u pacjentów z niedoborem odporności, pacjentów, którzy niedawno przeszli operację, tatuaż lub akupunkturę lub po ekspozycji na gorące źródła lub uzdrowiska. Może to być związane z infekcjami ucha środkowego ( zapalenie ucha środkowego ).
częstość występowania infekcji M. abscessus wzrasta z czasem. Ogniska M. abscessus zgłaszano w szpitalach i ośrodkach klinicznych na całym świecie. Podczas gdy ogniska stanowiące poważne zagrożenie kliniczne wiążą się z przenoszeniem (najprawdopodobniej przenoszeniem pośrednim) między wrażliwymi pacjentami, takimi jak osoby otrzymujące przeszczepy płuc lub leczone z powodu mukowiscydozy, ogniska zgłaszano również w klinikach oferujących chirurgię plastyczną, liposukcję , mezoterapię i infuzja dożylna terapii komórkowej, chociaż są one bardziej związane z zanieczyszczonymi środkami dezynfekującymi, solą fizjologiczną i instrumentami niż z kontaktem między pacjentami.
Kierownictwo
Terapia bakteriofagowa
Badanie z 2019 roku potwierdziło zdolność fagów do zabijania opornych bakterii, których nie można leczyć antybiotykami. Laboratoria badawcze zebrały się, aby znaleźć te fagi, zbierając, izolując i poddając je działaniu opornego M. abscessus , który został wyizolowany od pacjenta w Londynie.
in vitro
M. abscessus (GD01) pacjenta , podczas gdy fagi, takie jak ZoeJ i BPs, miały ograniczone możliwości infekowania GD01. Jednak mieszanka fagów, Muddy'ego i zmodyfikowanych wersji ZoeJ i BP całkowicie zainfekowała i zabiła GD01.
Na żywo
Koktajl bakteriofagów, Muddy, ZoeJ i BP, skutecznie zabił szczep M. abscessus in vitro . Potencjał, który to wykazał, zachęcił do rozpoczęcia leczenia pacjentów w kierunku zakażenia GD01. Co 12 godzin pacjentowi podawano kurację koktajlem bakteriofagowym.
Jeden dzień leczenia wykazał wysoki poziom bakteriofagów we krwi. Sugerowało to, że były uwalniane do krwioobiegu i replikowały się w celu zarażenia bakterii. Nie zgłoszono żadnych istotnych skutków ubocznych. Dla tego pacjenta znaleziono właściwe fagi, ale inny szczep może być wrażliwy na różne fagi.
Wpisz szczep
Typowy szczep M. abscessus , najczęściej określany jako ATCC 19977, został wyizolowany w 1953 r. z zakażenia ludzkiego kolana objawiającego się zmianami przypominającymi ropnie, co doprowadziło do tego, że szczep został nazwany „ abcessus ”. Szczep ten nie został rozpoznany jako odrębny gatunek aż do 1992 roku, kiedy nad hybrydyzacją DNA zidentyfikowały go jako genetycznie odrębny od swojego krewnego, M. chelonae . Genom pociągu typu został opublikowany w 2009 roku.
Ten artykuł zawiera cytowany tekst należący do domeny publicznej z CDC