Mycobacterium elephantis
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Mycobacterium elephantis | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | promieniowiec |
| Klasa: | promieniowce |
| Zamówienie: | mykobakterie |
| Rodzina: | Mycobacteriaceae |
| Rodzaj: | mykobakterie |
| Gatunek: |
M. elephantis
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Mycobacterium elephantis Shojaei i in. 2000, DSM 44368
|
|
Mycobacterium elephantis , bakteria z rodziny Mycobacteriaceae , została odkryta i wyizolowana ze zmarłego słonia w pobliżu Indii i może być powiązana z dysfunkcją układu oddechowego. Wiadomo , że organizmy z rodzaju Mycobacterium są tlenowe i nieruchliwe . Organizmy należące do Mycobacterium należą albo do grupy szybko rosnącej (wzrost organizmu poniżej siedmiu dni), albo do grupy wolno rosnącej. M. elephantis jest klasyfikowany jako szybko rosnący i najbardziej spokrewniony z Mycobacterium confluentis i Mycobacterium flei .
Pochodzenie
Shojaei i in. odkryli ten gatunek bakterii z płuc zmarłego słonia z powodu przewlekłej choroby układu oddechowego na Sri Lance , wyspie na południowym krańcu Indii w roku 2000. Szczep organizmu, 484 t , został wyizolowany przez tych badaczy na podłożu Lõwenstein-Jensen . Podłoże LJ , Columbia krew , agar MacConkey , agar Middlebrook 7H10 i agar z 5% chlorkiem sodu służyły jako kultury dla M. elephantis w różnych temperaturach przez 3 do 10 dni. Na agarze z 5% NaCl nie wystąpił wzrost. Stwierdzono, że ten organizm był dodatni w redukcji azotanów i ujemny w teście sulfatazy arylu , który przeprowadzono na tym szczepie.
Biologia i biochemia
Ekologia
Zbadano wzrost M. elephantis w celu znalezienia preferowanych czynników środowiskowych. Wiadomo, że rośnie w obszarze oskrzeli ssaków , gdzie pH wynosi 5,5. Organizm jest żywicielem związanym ze ssakami, na co wskazuje pierwsza izolacja w ropniu płuc słonia, u którego zdiagnozowano przewlekłą chorobę układu oddechowego na Sri Lance . Większość szczepów tego drobnoustroju znajduje się w plwocinie z dróg oddechowych , rzadko w węzłach chłonnych .
Morfologia
Dzięki sekwencjonowaniu genu 16S rRNA ta Gram-dodatnia bakteria koreluje z rodzajem Mycobacterium; ale wysokosprawna chromatografia cieczowa i analiza wzorca enzymów restrykcyjnych PCR identyfikują nowy gatunek . Jego fenotypowe są w ścisłym związku z M. flavescens . Fenotyp pokazuje kwasoodporny organizm kokosowy , gdy hodowany jest w bulionie 12B i podłożu stałym Löwensteina-Jensena . Żółty pigment i gładki kopulasty kształt były morfologią tego gatunku na podłożu LJ. Na agarze Middlebrooke 7H10 szczep DSM 44368 Mycobacterium elephantis wykazuje tę wcześniej podaną morfologię, jak również inną opisaną jako kremową. Wraz z wiekiem pojawia się żółta pigmentacja DSM 44368. M. elephantis jest również gatunkiem nieruchliwym , co jest cechą charakterystyczną rodzaju Mycobacterium .
Metabolizm i fizjologia
Odnotowano skąpe wyniki wykazujące właściwości metaboliczne M. elephantis , ale dokonano znaczących odkryć. Po Shojaei i in. przeprowadzonych eksperymentów testujących właściwości szczepu 484 t , stwierdzono tlenowe właściwości metaboliczne . M. elephantis jest katalazą , reduktazą azotanową i ureazo- dodatnią, jak również słabo kwaśnym alkoholem . Stwierdzono, że szczep 484 t był ujemny pod względem redukcji telluru jak również aktywność z arylosulfatazą . Optymalna temperatura wzrostu dla tego gatunku to około 42° C , przy czym pierwsze szczepy pojawiają się już trzeciego dnia wzrostu w tej temperaturze. Wzrost występuje w niższych temperaturach około 30°C, ale wzrost jest minimalny w temperaturze powyżej 45°C. Wzrost tego organizmu nie zachodzi w temperaturach powyżej 52°C. Chociaż ten organizm jest wolniejszy niż przeciętny szybko rosnący Mycobacterium , wzrost poniżej 7 dni klasyfikuje ten gatunek jako szybko rosnący. Hamowanie wzrostu jest widoczne w obecności izoniazydu , ryfampicyny i kilka innych leków.
Genom
Mycobacterium elephantis został zbadany i zbadany, aby zapewnić pewien wgląd w genomową naturę tego organizmu. Szczep M. elephantis , Lipa, zawiera 67,8% GC i wielkość genomu 5,19 Mb. W tym szczepie znaleziono również 250 pseudogenów . Sekwencja genu 16S rRNA szczepu 484 t (taka sama jak DSM 44368) w porównaniu z innymi szybko rosnącymi prątkami wykazała średnie podobieństwo 96,7 + 0,5%. Wykazał również 96,2 + 0,4% podobieństwo do wolno rosnących prątków. Najbliżsi sąsiedzi, którzy wykazują największe podobieństwo do M. elephantis to M. confluentis na poziomie 97,8% i M. phlei na poziomie 97,7%. Chociaż blisko spokrewniony, szczep 484 t wykazuje różnice 29 i 30 nukleotydów w znanych gatunkach .
Znaczenie
Mycobacterium elephantis może wpływać na ocenę diagnostyczną , gdy pacjenci wykazują niewykrywalne objawy gruźlicy . Pacjent z Azji był hospitalizowany z powodu przewlekłej choroby układu oddechowego . Zdjęcie rentgenowskie klatki piersiowej wykazało oznaki, w tym cień w prawym obszarze klatki piersiowej, co jest częstym objawem gruźlicy. Bez fizycznych dowodów na gruźlicę przez brak gatunku Mycobacterium tuberculosis , lekarze błędnie zdiagnozowano u niej gruźlicę; ale badanie popłuczyn oskrzelowych pacjenta wykazało kwasoodporne bakterie kokosowe . Po dalszych testach wyizolowany organizm wykazał wysokie podobieństwo, dochodzące do 100%, do Mycobacterium elephantis . Pokazuje to trudność diagnozowania ludzi z gruźlicą w różnych obszarach geograficznych. Błędna diagnoza może być ogromnym czynnikiem w opiece nad pacjentem i rehabilitacji , a dalsze badania nad tym organizmem mogą zmniejszyć ten problem. Mycobacterium elephantis nie należy wykluczać w przyszłej diagnostyce przewlekłych chorób układu oddechowego.