NIAID ChemDB
Treść | |
---|---|
Opis | Małe cząsteczki, które zostały przetestowane pod kątem HIV i/lub pokrewnych infekcji oportunistycznych |
Kontakt | |
Centrum Badań | Narodowy Instytut Alergii i Chorób Zakaźnych (NIAID) |
Data wydania | 1989 |
Dostęp | |
Strona internetowa | http://chemdb.niaid.nih.gov/ |
ChemDB HIV, Opportunistic Infection and Tuberculosis Therapeutics Database to publicznie dostępne narzędzie opracowane przez Narodowy Instytut Alergii i Chorób Zakaźnych w celu kompilacji danych przedklinicznych dotyczących małych cząsteczek o potencjalnym działaniu terapeutycznym przeciwko HIV/AIDS i powiązanym infekcjom oportunistycznym.
Charakterystyka i treść
Od 1989 r. ChemDB jest aktualizowana o informacje pochodzące z recenzowanej literatury, materiałów konferencyjnych i patentów. Dane są zestawiane na temat struktury związku, właściwości chemicznych, aktywności biologicznej (np. białka docelowego, IC50 , EC50 , cytotoksyczności , TI , Ki i/lub MIC ) oraz szczegółów odniesienia (np. Autor, Czasopismo).
Interfejs sieciowy ChemDB obsługuje wyszukiwanie danych biologicznych, tekstowych i chemicznych za pomocą Oracle Text , wyszukiwarki chemicznej Accelrys Direct oraz narzędzi Marvin firmy ChemAxon. Narzędzia te umożliwiają użytkownikom sieci przeszukiwanie bazy danych poprzez porównywanie stopnia podobieństwa lub elastyczności dopasowania do struktur chemicznych, które zostały przesłane lub narysowane. Dodatkowe wyszukiwanie Boolean można połączyć z wyszukiwaniem struktury, aby uwzględnić inne interesujące pola, w tym organizm docelowy lub wynik Lipińskiego . Oprócz publicznie dostępnego interfejsu internetowego społeczność naukowa może pobierać całe bazy danych. Baza danych jest często wykorzystywana w recenzowanych badaniach naukowych.
Patogeny oportunistyczne
Patogeny oportunistyczne zawarte w tej bazie danych to:
- SIV
- FIV
- Ludzki wirus cytomegalii (HCMV)
- Wirus Epsteina-Barra
- Wirus opryszczki pospolitej 1
- Wirus opryszczki pospolitej 2
- Wirus mięsaka Kaposiego
- Wirus zapalenia wątroby typu A
- Wirus zapalenia wątroby typu B
- Wirus zapalenia wątroby typu C
- Mycobacterium spp.
- Pneumocystis carinni
- Cryptococcus spp.
- Candida spp.
- Aspergillus spp.
- mikrosporydia
- Toxoplasma gondii
- Cryptosporidium parvum
- Leishmania spp.
- Plasmodium spp.
Linki zewnętrzne
- NIAID ChemDB [1]