neuGRID
 logo NeuGRID
| |
| Adres URL | |
|---|---|
| Aktualny stan | Aktywny |
neuGRID to portal internetowy, którego celem jest (i) pomoc neurobiologom w przeprowadzaniu wysokoprzepustowych badań obrazowych oraz (ii) dostarczanie neurologom klinicznym zautomatyzowanych obrazowych markerów diagnostycznych chorób neurodegeneracyjnych do indywidualnej diagnozy pacjentów. Przyjazne dla użytkownika środowisko neuGRID jest dostosowane do szerokiego grona użytkowników, od studentów po starszych neurobiologów pracujących w dziedzinie choroby Alzheimera , chorób psychicznych i chorób istoty białej. neuGRID ma stać się powszechnym źródłem analiz obrazowania mózgu.
Proces
Za pośrednictwem jednego wirtualnego punktu dostępu, portalu internetowego Science Gateway, użytkownicy logują się i uzyskują dostęp do „wirtualnego” laboratorium obrazowania. Tutaj użytkownicy mogą przesyłać, używać i udostępniać algorytmy do analizy obrazowania mózgu, mieć dostęp do dużych zbiorów danych neuroobrazowania i przeprowadzać intensywne obliczeniowo analizy, przez cały czas dzięki specjalistycznemu wsparciu i szkoleniom. Dzięki rozproszonym usługom i typu grid / chmura , analizy z neuGRID są znacznie szybsze niż tradycyjne analizy laboratoryjne. Weryfikacja koncepcji neuGRID została przeprowadzona w 2009 r., kiedy biomarker choroby Alzheimera (grubość kory 3D z Freesurfer i CIVET) została wyodrębniona z 6500 skanów MR w ciągu 2 tygodni w porównaniu z 5 latami, które zajęłoby to w tradycyjnych warunkach.
Historia
neuGRID został po raz pierwszy sfinansowany przez DG INFSO Komisji Europejskiej w ramach 7. Programu Ramowego w latach 2008-2011. Tutaj rozwijano infrastrukturę sprzętową i oprogramowanie pośredniczące. Druga fala została sfinansowana w 2011 r. przez Komisję Europejską , obecnie DG CONNECT, w ramach projektu neuGRID for you (N4U) , którego głównym celem jest rozszerzenie usług dla użytkowników o bardziej intuicyjne i graficzne interfejsy. N4U zakończyło się w kwietniu 2015 r.
Konsorcjum
Początkowe konsorcjum neuGRID obejmowało 8 europejskich partnerów z Włoch, Francji, Wielkiej Brytanii, Holandii, Szwecji, Hiszpanii i Szwajcarii. N4U obejmowało 9 partnerów europejskich (6 z nich już w neuGRID) i 2 z Ameryki Północnej. Międzynarodowi partnerzy zostali zaangażowani dzięki akcji wsparcia ponownie finansowanej przez DG INFSO ( outGRID , http://www.outgrid.eu ). Koordynatorem wszystkich trzech projektów jest Giovanni B. Frisoni, neurolog pracujący w IRCCS Fatebenefratelli, Narodowym Centrum Chorób Alzheimera w Brescii we Włoszech.
Notatki
Inne publikacje
Badania neuronaukowe, w których jako źródło wykorzystano neuGRID
- Redolfi, A; Bosko, P; Manset, D; Frisoni, Wielka Brytania; Konsorcjum Neugrid (2013). „Badanie mózgu i konceptualizacja mózgu” . Neurologia funkcjonalna . 28 (3): 175–90. PMC 3812741 . PMID 24139654 .
- Okładka, Keith S.; Van Schijndel, Ronald A.; Van Dijk, Bob W.; Redolfi, Alberto; Knol, Dirk L.; Frisoni, Giovanni B.; Barkhof, Frederik; Vrenken, Hugo; NeuGRID; Inicjatywa neuroobrazowania choroby Alzheimera (2011). „Ocena odtwarzalności pomiarów atrofii mózgu SienaX i Siena przy użyciu skanów ADNI back-to-back MP-RAGE MRI” . Badania psychiatryczne: neuroobrazowanie . 193 (3): 182–90. doi : 10.1016/j.pscychresns.2011.02.012 . PMID 21764565 .
- Frisoni, Giovanni B.; Fox, Nick C.; Jack Jr, Clifford R.; Scheltens, Filip; Thompson, Paul M. (2010). „Kliniczne zastosowanie strukturalnego MRI w chorobie Alzheimera” . Nature Recenzje Neurologia . 6 (2): 67–77. doi : 10.1038/nrneurol.2009.215 . PMC 2938772 . PMID 20139996 .
- Pełną listę publikacji neuGRID można znaleźć na stronie: https://www.neugrid2.eu/index.php/scientific-publications/