Drużyna została założona w 2010 roku przez FC JAX Soccer, aby wypełnić lukę w zorganizowanej męskiej i żeńskiej piłce nożnej w Jacksonville . Organizacja została oficjalnie ogłoszona 21 kwietnia 2011 roku z planami dotyczącymi męskich i żeńskich franczyz w United Soccer Leagues , grających pod nazwą FC JAX Destroyers.
Męska drużyna grała w latach 2011-2012 w USL Premier Development League , czwartej lidze piłki nożnej w Stanach Zjednoczonych i Kanadzie, w południowo-wschodniej części Konferencji Południowej. Swoje domowe mecze rozgrywali na nowo wyremontowanym boisku piłkarskim Uniwersytetu Jacksonville . Ich pierwszy mecz rywalizacyjny odbył się 13 maja 2011 r., Przegrywając 3: 1 z Mississippi Brilla . Pierwszym golem w historii franczyzy był gol samobójczy zdobyty przez Thomasa Shannona z Mississippi; pierwszym zawodnikiem JAX, który strzelił gola, był Isaac Kinman, który dwa dni później wygrał 2: 0 z Nashville Metros .
Drużyna kobieca grała w W-League, drugiej lidze kobiecej piłki nożnej w American Soccer Pyramid , w sezonie 2012. Ich pierwszy mecz odbył się 19 maja. Jednak FC Jax Destroyers wycofał się z United Soccer Leagues przed sezonem 2013.
Gonzalo Troncoso
Aidana Davisona
Aidan Davison (lipiec 2011 - 2012) 
Eric Dutt (kwiecień 2011 - czerwiec 2011)
