Priestia
Klasyfikacja naukowa | |
---|---|
Priestii | |
Domena: | |
Gromada: | |
Klasa: | |
Zamówienie: | |
Rodzina: | |
Rodzaj: |
Priestia Gupta i in. 2020
|
Gatunek | |
Informacje na podstawie LPSN 2021 |
Priestia to rodzaj głównie Gram-dodatnich ( Priestia flexa barwi Gram-zmiennych i Priestia koreensis barwi Gram-ujemnych ) bakterii o kształcie pałeczki z rodziny Bacillaceae z rzędu Bacillales . Gatunkiem typowym tego rodzaju jest Priestia megaterium.
Członkowie Priestii to wcześniej gatunki należące do Bacillus , rodzaju, który uznano za wykazujący rozległą polifię u swoich członków ze względu na niejasne kryteria stosowane do przypisywania gatunków do tego kladu. Przeprowadzono wiele badań z wykorzystaniem porównawczych analiz filogenetycznych w celu wyjaśnienia powiązań ewolucyjnych między Bacillus , co doprowadziło do przeniesienia gatunków do wielu nowych rodzajów, takich jak Alkalihalobacillus , Brevibacillus , Solibacillus , Alicyclobacillus , Virgibacillus i Evansella . Ponadto rodzaj Bacillus ograniczono do gatunków blisko spokrewnionych z Bacillus subtilis i Bacillus cereus .
Nazwa Priestia została nazwana na cześć brytyjskiego mikrobiologa profesora Fergusa G. Priesta (Heriot-Watt University, Edinbugth; 1948–2019) za jego liczny wkład w systematykę i zastosowania przedstawicieli rodzaju Bacillus .
Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne
Członkowie tego rodzaju są tlenowcami i występują w różnych miejscach, takich jak gleba, odchody, górne warstwy atmosfery, wewnętrzne tkanki roślin bawełny, osady morskie i ryzosfera korzeni wierzby. Wszyscy członkowie mogą wytwarzać endospory, a większość z nich jest ruchliwa. Priestia może rosnąć w temperaturach od 5°C do 48°C, jednak optymalna temperatura wzrostu mieści się w przedziale 28-37°C, zatem można ją zakwalifikować jako organizm mezofilny i psychrotroficzny . Priestia Aryabhattai ma znaczenie przemysłowe, ponieważ jest odporny na arsen i promieniowanie UV, co stanowi niedrogą alternatywę dla konwencjonalnych, drogich technologii regeneracji metali.
Na podstawie analizy genomu zidentyfikowano dwa konserwatywne indele sygnatur (CSI) występujące wyłącznie dla tego rodzaju w białkach oligorybonukleazy NrnB lub cAMP/cGMP fosfodiesterazy i białkach nadrodziny DHH, i można je zastosować do niezawodnego odróżnienia tego rodzaju od innych rodzajów Bacillaceae i bakterii pod względem molekularnym warunki.
Taksonomia
Priestia , stan na maj 2021 r., obejmuje łącznie 10 gatunków z ważnie opublikowanymi nazwami. Rodzaj ten został zidentyfikowany jako monofiletyczny i filogenetycznie niepowiązany z innymi gatunkami Bacillus w badaniach oceniających powiązania taksonomiczne w obrębie Bacillus . Ten wzór rozgałęzienia obserwuje się również w bazie danych taksonomii genomu (GTDB).
Stwierdzono, że dwa nieważnie opublikowane gatunki, „Bacillus pseudoflexus” i „Bacillus zanthoxyli”, również grupują się z innymi członkami Priestii w drzewach filogenetycznych, a także mają te same markery molekularne w postaci konserwatywnych indeli sygnatur (CSI). Jednak ich przeniesienie nie zostało oficjalnie zaproponowane ze względu na brak informacji o szczepach kulturowych. Konieczna jest dalsza rewizja tego rodzaju w miarę odkrywania i przypisywania dodatkowych genomów i nowych gatunków.