Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
RBBP7
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologiczne:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, RbAp46, białko wiążące siatkówczaka 7, białko wiążące RB 7, czynnik przebudowy chromatyny
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Białko wiążące histon RBBP7 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen RBBP7 .
Funkcjonować
Białko to jest wszechobecnym białkiem jądrowym i należy do wysoce konserwatywnej podrodziny białek powtórzeń WD. Znajduje się wśród kilku białek, które wiążą się bezpośrednio z białkiem siatkówczaka, które reguluje proliferację komórek. Kodowane białko znajduje się w wielu kompleksach deacetylazy histonowej, w tym kompleksie korepresorowym mSin3. Jest również obecny w kompleksach białkowych biorących udział w składaniu chromatyny. Białko to może oddziaływać z genem supresorowym guza BRCA1 i może odgrywać rolę w regulacji proliferacji i różnicowania komórek.
Organizmy modelowe
Do badania funkcji RBBP7 wykorzystano organizmy modelowe . Linia myszy z warunkowym nokautem , zwana Rbbp7 tm1a (EUCOMM) Wtsi, została wygenerowana w ramach programu International Knockout Mouse Consortium — wysokowydajnego projektu mutagenezy mającego na celu generowanie i dystrybucję zwierzęcych modeli chorób do zainteresowanych naukowców.
Samce i samice zwierząt poddano standaryzowanemu badaniu fenotypowemu w celu określenia skutków delecji. Przeprowadzono dwadzieścia jeden testów na zmutowanych myszach i zaobserwowano jedną istotną nieprawidłowość: hemizygotyczne zmutowane samce miały zmniejszoną liczbę limfocytów T CD4-dodatnich i CD8-dodatnich .
Interakcje
Wykazano, że RBBP7 wchodzi w interakcje z:
Dalsza lektura
Huang S, Lee WH, Lee EY (1991). „Białko komórkowe, które konkuruje z antygenem T SV40 o wiązanie z produktem genu siatkówczaka”. Natura . 350 (6314): 160–162. Bibcode : 1991Natur.350..160H . doi : 10.1038/350160a0 . PMID 2005966 . S2CID 4345233 .
Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (1997). „Deacetylazy histonowe i SAP18, nowy polipeptyd, są składnikami ludzkiego kompleksu Sin3” . komórka . 89 (3): 357–364. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 PMID 9150135 .
Verreault A, Kaufman PD, Kobayashi R, Stillman B (1998). „Nukleosomalny DNA reguluje podjednostkę wiążącą rdzeń-histon ludzkiej acetylotransferazy Hat1” . bież. Biol . 8 (2): 96–108. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70040-5 PMID 9427644 . S2CID 201273 .
Zhang Y, Sun ZW, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Hampsey M, Reinberg D (1998). „SAP30, nowe białko konserwowane między człowiekiem a drożdżami, jest składnikiem kompleksu deacetylazy histonowej” . Mol. komórka . 1 (7): 1021–1031. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 PMID 9651585 .
Guan LS, Rauchman M, Wang ZY (1998). „Indukcja białka związanego z Rb (RbAp46) przez supresor guza Wilmsa WT1 pośredniczy w hamowaniu wzrostu” . J. Biol. chemia . 273 (42): 27047–27050. doi : 10.1074/jbc.273.42.27047 PMID 9765217 .
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (1998). „Autoantygen Mi2 specyficzny dla zapalenia skórno-mięśniowego jest składnikiem kompleksu zawierającego deacetylazę histonową i aktywność przebudowy nukleosomów” . komórka . 95 (2): 279–289. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 PMID 9790534 . S2CID 18786866 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (1998). „Deacetylacja chromatyny przez zależny od ATP kompleks przebudowy nukleosomu”. Natura . 395 (6705): 917–921. Bibcode : 1998Natur.395..917T . doi : 10.1038/27699 . PMID 9804427 . S2CID 4355885 .
Yarden RI, Brody LC (1999). „BRCA1 oddziałuje ze składnikami kompleksu deacetylazy histonowej” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 96 (9): 4983–4988. Bibcode : 1999PNAS...96.4983Y . doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 PMC 21803 PMID 10220405 .
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (1999). „Analiza podjednostek NuRD ujawnia kompleks rdzenia deacetylazy histonowej i związek z metylacją DNA” . Geny Dev . 13 (15): 1924–1935. doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920 PMID 10444591 .
Wade PA, Gegonne A, Jones PL, Ballestar E, Aubry F, Wolffe AP (1999). „Kompleks Mi-2 łączy metylację DNA z przebudową chromatyny i deacetylacją histonów”. Nat. Genet . 23 (1): 62–66. doi : 10.1038/12664 . PMID 10471500 . S2CID 52868103 .
Zhang Q, Vo N, Goodman RH (2000). „Białko wiążące histon RbAp48 oddziałuje z kompleksem białka wiążącego CREB i fosforylowanego CREB” . Mol. Komórka. Biol . 20 (14): 4970–4978. doi : 10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000 . PMC85947 . _ PMID 10866654 .
Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (2001). „Stabilne kompleksy deacetylazy histonowej wyróżniające się obecnością białek domeny SANT CoREST / kiaa0071 i Mta-L1” . J. Biol. chemia . 276 (9): 6817–6824. doi : 10.1074/jbc.M007372200 PMID 11102443 .
Skowyra D, Zeremski M, Neznanov N, Li M, Choi Y, Uesugi M, Hauser CA, Gu W, Gudkov AV, Qin J (2001). „Różnicowe skojarzenie produktów alternatywnych transkryptów kandydata na supresor guza ING1 z kompleksem transkrypcyjnym korepresora mSin3 / HDAC1” . J. Biol. chemia . 276 (12): 8734–8739. doi : 10.1074/jbc.M007664200 PMID 11118440 .
Chen GC, Guan LS, Yu JH, Li GC, Choi Kim HR, Wang ZY (2001). „Białko 46 związane z Rb (RbAp46) hamuje transaktywację transkrypcji, w której pośredniczy BRCA1”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 284 (2): 507–514. doi : 10.1006/bbrc.2001.5003 . PMID 11394910 .
Yarden RI, Brody LC (2002). „Identyfikacja białek, które oddziałują z BRCA1 przez badania przesiewowe bibliotek dalekozachodnich” . J. Komórka. Biochem . 83 (4): 521–531. doi : 10.1002/jcb.1257 . PMID 11746496 . S2CID 29703139 .
Kuźmiczew A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2002). „Rola kompleksu deacetylazy histonowej Sin3 w regulacji wzrostu przez kandydata na supresor guza p33 (ING1)” . Mol. Komórka. Biol . 22 (3): 835–848. doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . PMC 133546 PMID 11784859 .
Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (2002). „Funkcjonalna i fizyczna interakcja między metylotransferazą histonową Suv39H1 a deacetylazami histonowymi” . Kwasy nukleinowe Res . 30 (2): 475–481. doi : 10.1093/nar/30.2.475 . PMC 99834 PMID 11788710 .
Saito M, Ishikawa F (2002). „Domena wiążąca mCpG ludzkiego MBD3 nie wiąże się z mCpG, ale oddziałuje ze składnikami NuRD / Mi2 HDAC1 i MTA2” . J. Biol. chemia . 277 (38): 35434–35439. doi : 10.1074/jbc.M203455200 PMID 12124384 .
Kuźmiczew A, Nishioka K, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2002). „Aktywność metylotransferazy histonowej związana z ludzkim kompleksem wielobiałkowym zawierającym wzmacniacz białka Zeste” . Geny Dev . 16 (22): 2893–2905. doi : 10.1101/gad.1035902 . PMC 187479 PMID 12435631 .
