RFC5

RFC5
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologiczne: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, RFC36, podjednostka współczynnika replikacji C 5
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( Człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Ojej Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortolodzy Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) Wyszukiwanie PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Podjednostka 5 czynnika replikacji C jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen RFC5 .

Funkcjonować

Wydłużenie zagruntowanych matryc DNA przez polimerazę DNA delta i polimerazę DNA epsilon wymaga dodatkowych białek antygenu jądrowego komórki proliferującej (PCNA) i czynnika replikacji C (RFC). RFC, nazywany także aktywatorem 1, to kompleks białkowy składający się z pięciu odrębnych podjednostek o masach 140, 40, 38, 37 i 36 kD. Gen ten koduje podjednostkę 36 kD. Podjednostka ta może oddziaływać z C-końcowym PCNA. Tworzy kompleks rdzeniowy z podjednostkami 38 i 40 kDa. Kompleks rdzeniowy posiada zależną od DNA ATPazę aktywność, która, jak stwierdzono, jest stymulowana przez PCNA w układzie in vitro. Donoszono o alternatywnych wariantach transkryptu podlegających składaniu, kodujących różne izoformy.

Interakcje

Wykazano, że RFC5 wchodzi w interakcję z:

• BRD4 ,
• CHTF18 ,
• PCNA ,
• RFC2 i
• RFC4 .

Dalsza lektura

•    O'Donnell M, Onrust R, Dean FB, Chen M, Hurwitz J (styczeń 1993). „Homologia białek pomocniczych polimeraz replikacyjnych - E. coli do ludzi” . Badania kwasów nukleinowych . 21 (1): 1–3. doi : 10.1093/nar/21.1.1 . PMC 309057 . PMID 8441605 .
•    Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (czerwiec 1996). „Rekonstytucja in vitro ludzkiego czynnika replikacji C z jego pięciu podjednostek” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 93 (13): 6521–6. Kod Bib : 1996PNAS...93.6521U . doi : 10.1073/pnas.93.13.6521 . PMC 39056 . PMID 8692848 .
•   Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (styczeń 1997). „Czynnik replikacji C oddziałuje z C-końcową stroną antygenu jądrowego proliferującej komórki” . Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1769–76. doi : 10.1074/jbc.272.3.1769 . PMID 8999859 .
•    Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (kwiecień 1997). „Transaktywator ludzkiego wirusa niedoboru odporności Tat oddziałuje z holoenzymem polimerazy RNA II” . Biologia molekularna i komórkowa . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128/mcb.17.4.1817 . PMC 232028 . PMID 9121429 .
•   Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (lipiec 1997). „Kompleks składający się z podjednostek ludzkiego czynnika replikacji C p40, p37 i p36 jest zależną od DNA ATPazą i związkiem pośrednim w tworzeniu holoenzymu” . Journal of Biological Chemistry . 272 (30): 18974–81. doi : 10.1074/jbc.272.30.18974 . PMID 9228079 .
•    Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (grudzień 1997). „Identyfikacja replikacji DNA i białek cyklu komórkowego, które oddziałują z PCNA” . Badania kwasów nukleinowych . 25 (24): 5041–6. doi : 10.1093/nar/25.24.5041 . PMC 147130 . PMID 9396813 .
•    Ellison V, Stillman B (marzec 1998). „Rekonstytucja rekombinowanego ludzkiego czynnika replikacji C (RFC) i identyfikacja podkompleksu RFC posiadającego zależną od DNA aktywność ATPazy” (PDF) . Journal of Biological Chemistry . 273 (10): 5979–87. doi : 10.1074/jbc.273.10.5979 . PMID 9488738 . S2CID 17647091 .
•    Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (wrzesień 1998). „Hydroliza ATP katalizowana przez ludzki czynnik replikacji C wymaga udziału wielu podjednostek” . Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (20): 11607–12. Kod Biblioteki : 1998PNAS...9511607C . doi : 10.1073/pnas.95.20.11607 . PMC 21688 . PMID 9751713 .
•    Zhang G, Gibbs E, Kelman Z, O'Donnell M, Hurwitz J (marzec 1999). „Badania nad interakcjami między ludzkim czynnikiem replikacyjnym C a antygenem jądrowym ludzkich komórek proliferujących” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 96 (5): 1869–74. Kod Biblijny : 1999PNAS...96.1869Z . doi : 10.1073/pnas.96.5.1869 . PMC 26703 . PMID 10051561 .
•    Lindsey-Boltz LA, Bermudez VP, Hurwitz J, Sancar A (wrzesień 2001). „Oczyszczanie i charakterystyka kompleksów Rad w punkcie kontrolnym uszkodzeń ludzkiego DNA” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 98 (20): 11236–41. Kod Biblijny : 2001PNAS...9811236L . doi : 10.1073/pnas.201373498 . PMC 58713 . PMID 11572977 .
•   Griffith JD, Lindsey-Boltz LA, Sancar A (maj 2002). „Struktury ludzkiego czynnika replikacji Rad17 C i kompleksów punktu kontrolnego Rad 9-1-1 wizualizowane za pomocą mikroskopii w sprayu glicerolowym / niskonapięciowym” . Journal of Biological Chemistry . 277 (18): 15233–6. doi : 10.1074/jbc.C200129200 . PMID 11907025 .
•   Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (październik 2002). „Podejście proteomiczne do identyfikacji białek wiążących antygen jądrowy komórek proliferujących (PCNA) w lizatach komórek ludzkich. Identyfikacja ludzkiego kompleksu CHL12/RFCs2-5 jako nowego białka wiążącego PCNA” . Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40362–7. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
•    Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (wrzesień 2002). „Białko bromodomeny ssaków, brd4, oddziałuje z czynnikiem replikacji C i hamuje przejście do fazy S” . Biologia molekularna i komórkowa . 22 (18): 6509–20. doi : 10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002 . PMC 135621 . PMID 12192049 .
•    Venclovas C, Colvin ME, Thelen MP (październik 2002). „Analiza interakcji oparta na modelowaniu molekularnym w procesie ładowania zacisków zależnym od RFC” . Nauka o białkach . 11 (10): 2403–16. doi : 10.1110/ps.0214302 . PMC 2373712 . PMID 12237462 .
•   Merkle CJ, Karnitz LM, Henry-Sánchez JT, Chen J (sierpień 2003). „Klonowanie i charakterystyka hCTF18, hCTF8 i hDCC1. Ludzkie homologi kompleksu Saccharomyces cerevisiae zaangażowane w tworzenie spójności chromatyd siostrzanych” . Journal of Biological Chemistry . 278 (32): 30051–6. doi : 10.1074/jbc.M211591200 . PMID 12766176 .
•    Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (wrzesień 2003). „Alternatywny kompleks Ctf18-Dcc1-Ctf8-czynnik replikacji C wymagany do spójności chromatydy siostrzanej ładuje antygen jądrowy proliferującej komórki na DNA” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 100 (18): 10237–42. Kod Bib : 2003PNAS..10010237B . doi : 10.1073/pnas.1434308100 . PMC 193545 . PMID 12930902 .
•    Zou L, Liu D, Elledge SJ (listopad 2003). „Rekrutacja za pośrednictwem białka replikacyjnego A i aktywacja kompleksów Rad17” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 100 (24): 13827–32. Kod Bib : 2003PNAS..10013827Z . doi : 10.1073/pnas.2336100100 . PMC 283506 . PMID 14605214 .